RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 MMRN2Q9H8L6 949 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 KIF4AO95239 1232 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 SLU7O95391 586 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 UBE4AQ14139 1066 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 KRT40Q6A162 431 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 NRKQ7Z2Y5 1582 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 LRRC45Q96CN5 670 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 CCDC42Q96M95 316 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 EXOC7Q9UPT5 735 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 TTLL7Q6ZT98 887 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 IFNL3Q8IZI9 196 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 TMX1Q9H3N1 280 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 GPCPD1Q9NPB8 672 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 PNMA2Q9UL42 364 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
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PDE4D-228ENST00000636120 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 TNS3Q68CZ2 1445 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 LMBRD1Q9NUN5 540 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 DNAI1Q9UI46 699 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 REREQ9P2R6 1566 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 LRRC7Q96NW7 1537 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 A0A0D9SFI3 127 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 EIF6P56537 245 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 PAK1Q13153 545 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 ME3Q16798 604 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 CDC37L1Q7L3B6 337 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 LEMD3Q9Y2U8 911 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 CRKLP46109 303 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 PDE4DQ08499 809 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 CYP26C1Q6V0L0 522 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF202O95125 648 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 PDE6AP16499 860 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 ACTN2P35609 894 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 SMTNP53814 917 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 CCDC155Q8N6L0 562 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 KCNG1Q9UIX4 513 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 PIK3C2BO00750 1634 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 PREX1Q8TCU6 1659 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 OPA1O60313 960 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 ZBED4O75132 1171 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 SIK1P57059 783 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 CHMP4BP1P59074 171 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 CHRNDQ07001 517 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 POLA2Q14181 598 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 PLS1Q14651 629 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 POSTNQ15063 836 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 ADALQ6DHV7 355 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 FCHSD1Q86WN1 690 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 MAP4K1Q92918 833 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 DIP2AQ14689 1571 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 PDE8BO95263 885 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF654Q8IZM8 581 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 TEKT1Q969V4 418 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 SYNCQ9H7C4 482 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 JAG2Q9Y219 1238 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 MRVI1Q9Y6F6 885 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 PNPLA6Q8IY17 1366 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 PTGS1P23219 599 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 DNA2P51530 1060 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 PTH1RQ03431 593 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 CALCRLQ16602 461 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 KIFAP3Q92845 792 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 NT5C3AQ9H0P0 336 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 XDHP47989 1333 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 CCDC113Q9H0I3 377 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 ARFGAP3Q9NP61 516 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 RFX7Q2KHR2 1363 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF75DP51815 510 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 CLUL1Q15846 466 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 NIM1KQ8IY84 436 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 GNA14O95837 355 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
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