RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000061239.13

Sh3bp1-202, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rpl11Q9CXW4 178 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ighv14-1A0A075B5R4 117 aa13.66□□□□□ -0.22
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ighv1-50A0A075B5W1 117 aa13.66□□□□□ -0.22
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tcl1b4P56844 120 aa13.66□□□□□ -0.22
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr1367Q8VFG2 316 aa13.66□□□□□ -0.22
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rnf114Q9ET26 229 aa13.66□□□□□ -0.22
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dido1Q8C9B9 2256 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Sptbn1Q62261 2363 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm45521A0A1B0GRK0 198 aa13.65□□□□□ -0.22
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ca1P13634 261 aa13.65□□□□□ -0.22
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Med13lQ6JPI3 2207 aa13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ceacam15A0A0B4J1L0 234 aa13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Sertad4A7DTG3 377 aa13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 S100a4P07091 101 aa13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cd69P37217 199 aa13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm10604Q3V0X7 143 aa13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm9961Q8BNV2 113 aa13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mrpl36Q99N90 102 aa13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 NbasE9Q411 2356 aa13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Igsf23B2RTN2 239 aa13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Umad1E0CX23 159 aa13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr317Q5NCD6 327 aa13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Defa22Q8C1N8 93 aa13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dusp14Q9JLY7 198 aa13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tmem262D3Z338 116 aa13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 P01812 117 aa13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ormdl2Q9CQZ0 153 aa13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tex48Q9DA81 110 aa13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ep300B2RWS6 2412 aa13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ighv1-52A0A0A6YXC3 117 aa13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Lgals6O54891 301 aa13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Khdc1cQ4KL78 166 aa13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Slc35d2Q762D5 326 aa13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gkn1Q9CR36 201 aa13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 119 aa13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 NpsP0C0P8 89 aa13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ankrd11E9Q4F7 2643 aa13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Sumo2P61957 95 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cited1P97769 203 aa13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Sdhaf1Q3U276 118 aa13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Clec4b2Q67DU8 208 aa13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 3110018I06RikQ9CXS0 120 aa13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Slc25a20Q9Z2Z6 301 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ighv1-12A0A0A6YXJ9 117 aa13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm17359A0A0G2JEB7 487 aa13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm12845A0A0N4SUM5 588 aa13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Vmn1r197Q8R265 298 aa13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 SonQ9QX47 2444 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Col6a4A2AX52 2309 aa13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Prpf8Q99PV0 2335 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ighv1-63A0A075B5X2 117 aa13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ighv1-66A0A075B5X5 117 aa13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm17430F6RSK3 157 aa13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Igkv4-62A0A0G2JDW9 117 aa13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm21994F6T2D2 329 aa13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cited2O35740 269 aa13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rpl32P62911 135 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ovol2Q8CIV7 274 aa13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 LhbO09108 141 aa13.58□□□□□ -0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm5464Q3UY29 175 aa13.58□□□□□ -0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ndufb4Q9CQC7 129 aa13.58□□□□□ -0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Chd8Q09XV5 2582 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Sptan1P16546 2472 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 P01727 129 aa13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Samd5Q3V1H9 173 aa13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Iah1Q9DB29 249 aa13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Prrc2aQ7TSC1 2158 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Defa30E9QPZ2 93 aa13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gpx1P11352 201 aa13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm10775Q3V290 127 aa13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mc5rP41149 325 aa13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 MdfiP70331 251 aa13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr322Q5NCC8 327 aa13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Srsf12Q8C8K3 266 aa13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fam216aQ9DB54 251 aa13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ighv3-8A0A075B5T0 131 aa13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 P06328 117 aa13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 SstP60041 116 aa13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Wfdc2Q9DAU7 174 aa13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Svep1A2AVA0 3567 aa13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Trbv16A0A0B4J1H3 115 aa13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 A730046J19RikA0A1B0GSN8 89 aa13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Snrpd3P62320 126 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Znhit3Q9CQK1 151 aa13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ccl24Q9JKC0 119 aa13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm9195A0A140LHT4 2805 aa13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 LystP97412 3788 aa13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ighv6-7A0A0A6YWU3 119 aa13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rpl36-ps4A0A140T8U4 117 aa13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 P01747 120 aa13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Defa6P50704 93 aa13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Wfdc15aQ8BH89 80 aa13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Prss29Q99MS4 279 aa13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gnb1lQ9EQ15 326 aa13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Sdk1Q3UH53 2193 aa13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Igkv4-74A0A0B4J1I3 119 aa13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Hbb-bsA8DUK4 147 aa13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Hsbp1l1B2RXB2 72 aa13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mrps12O35680 139 aa13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Hbb-b1P02088 147 aa13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 41.2 ms