Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5T0

Ighv3-8, Immunoglobulin heavy variable V3-8 (Fragment), mousemouse

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Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv3-8A0A075B5T0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Ighv3-8A0A075B5T0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ighv3-8A0A075B5T0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ighv3-8A0A075B5T0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ighv3-8A0A075B5T0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ighv3-8A0A075B5T0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ighv3-8A0A075B5T0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ighv3-8A0A075B5T0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ighv3-8A0A075B5T0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ighv3-8A0A075B5T0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ighv3-8A0A075B5T0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ighv3-8A0A075B5T0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ighv3-8A0A075B5T0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ighv3-8A0A075B5T0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ighv3-8A0A075B5T0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ighv3-8A0A075B5T0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ighv3-8A0A075B5T0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ighv3-8A0A075B5T0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ighv3-8A0A075B5T0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ighv3-8A0A075B5T0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ighv3-8A0A075B5T0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ighv3-8A0A075B5T0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ighv3-8A0A075B5T0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ighv3-8A0A075B5T0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ighv3-8A0A075B5T0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ighv3-8A0A075B5T0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ighv3-8A0A075B5T0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ighv3-8A0A075B5T0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ighv3-8A0A075B5T0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ighv3-8A0A075B5T0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Ighv3-8A0A075B5T0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ighv3-8A0A075B5T0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ighv3-8A0A075B5T0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ighv3-8A0A075B5T0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ighv3-8A0A075B5T0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ighv3-8A0A075B5T0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ighv3-8A0A075B5T0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ighv3-8A0A075B5T0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ighv3-8A0A075B5T0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ighv3-8A0A075B5T0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ighv3-8A0A075B5T0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ighv3-8A0A075B5T0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ighv3-8A0A075B5T0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ighv3-8A0A075B5T0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ighv3-8A0A075B5T0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ighv3-8A0A075B5T0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ighv3-8A0A075B5T0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ighv3-8A0A075B5T0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ighv3-8A0A075B5T0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ighv3-8A0A075B5T0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ighv3-8A0A075B5T0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ighv3-8A0A075B5T0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ighv3-8A0A075B5T0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ighv3-8A0A075B5T0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ighv3-8A0A075B5T0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ighv3-8A0A075B5T0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ighv3-8A0A075B5T0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ighv3-8A0A075B5T0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ighv3-8A0A075B5T0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ighv3-8A0A075B5T0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ighv3-8A0A075B5T0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ighv3-8A0A075B5T0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ighv3-8A0A075B5T0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ighv3-8A0A075B5T0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ighv3-8A0A075B5T0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ighv3-8A0A075B5T0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Ighv3-8A0A075B5T0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ighv3-8A0A075B5T0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ighv3-8A0A075B5T0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ighv3-8A0A075B5T0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ighv3-8A0A075B5T0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ighv3-8A0A075B5T0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ighv3-8A0A075B5T0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ighv3-8A0A075B5T0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ighv3-8A0A075B5T0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ighv3-8A0A075B5T0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ighv3-8A0A075B5T0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ighv3-8A0A075B5T0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ighv3-8A0A075B5T0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ighv3-8A0A075B5T0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ighv3-8A0A075B5T0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ighv3-8A0A075B5T0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ighv3-8A0A075B5T0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ighv3-8A0A075B5T0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ighv3-8A0A075B5T0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ighv3-8A0A075B5T0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ighv3-8A0A075B5T0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ighv3-8A0A075B5T0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ighv3-8A0A075B5T0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ighv3-8A0A075B5T0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ighv3-8A0A075B5T0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ighv3-8A0A075B5T0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ighv3-8A0A075B5T0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ighv3-8A0A075B5T0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ighv3-8A0A075B5T0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ighv3-8A0A075B5T0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ighv3-8A0A075B5T0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ighv3-8A0A075B5T0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ighv3-8A0A075B5T0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ighv3-8A0A075B5T0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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