RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621941.1

5S_rRNA.18-201, humanhuman

BASIC

Gene 5S_rRNA, Length 110 nt, Biotype rRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa-0.48□□□□□ -2.49
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 HYDINQ4G0P3 5121 aa-0.5□□□□□ -2.49
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 A0A096LNI7 61 aa-0.5□□□□□ -2.49
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 RPS29P62273 56 aaKnown RBP-0.5□□□□□ -2.49
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 HTN1P15515 57 aa-0.51□□□□□ -2.49
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 ITPR2Q14571 2701 aa-0.51□□□□□ -2.49
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa-0.51□□□□□ -2.49
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 DEFB133Q30KQ1 61 aa-0.52□□□□□ -2.49
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 RYR2Q92736 4967 aa-0.53□□□□□ -2.49
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 DNAH5Q8TE73 4624 aa-0.53□□□□□ -2.5
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 NEBP20929 6669 aa-0.53□□□□□ -2.5
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP-0.54□□□□□ -2.5
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP-0.54□□□□□ -2.5
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 MYO15AQ9UKN7 3530 aa-0.55□□□□□ -2.5
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 KIAA1109Q2LD37 5005 aa-0.56□□□□□ -2.5
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 RYR3Q15413 4870 aa-0.56□□□□□ -2.5
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa-0.57□□□□□ -2.5
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 MT1BP07438 61 aa-0.57□□□□□ -2.5
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 CFAP54Q96N23 3096 aa-0.57□□□□□ -2.5
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 CD52P31358 61 aa-0.58□□□□□ -2.5
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 CEP250Q9BV73 2442 aa-0.58□□□□□ -2.5
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 GCC2Q8IWJ2 1684 aa-0.59□□□□□ -2.5
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 VPS13CQ709C8 3753 aa-0.59□□□□□ -2.5
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 ATMQ13315 3056 aa-0.59□□□□□ -2.5
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 TTTY10Q9BZA0 68 aa-0.59□□□□□ -2.5
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 DEFB124Q8NES8 71 aa-0.6□□□□□ -2.51
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 FREM2Q5SZK8 3169 aa-0.61□□□□□ -2.51
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa-0.62□□□□□ -2.51
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 PCNTO95613 3336 aa-0.63□□□□□ -2.51
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 FRYLO94915 3013 aa-0.63□□□□□ -2.51
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 H3BUX3 64 aa-0.63□□□□□ -2.51
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa-0.63□□□□□ -2.51
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 CEP350Q5VT06 3117 aa-0.64□□□□□ -2.51
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 DMDP11532 3685 aa-0.65□□□□□ -2.51
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 K7EIM0 57 aa-0.65□□□□□ -2.51
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 PRCDQ00LT1 54 aa-0.66□□□□□ -2.52
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa-0.67□□□□□ -2.52
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 WDFY4Q6ZS81 3184 aa-0.67□□□□□ -2.52
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 XIRP2A4UGR9 3374 aa-0.68□□□□□ -2.52
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 SZT2Q5T011 3432 aa-0.68□□□□□ -2.52
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 MT1FP04733 61 aa-0.68□□□□□ -2.52
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 MUC3AQ02505 3323 aa-0.71□□□□□ -2.52
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa-0.71□□□□□ -2.52
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 SPEGQ15772 3267 aa-0.72□□□□□ -2.52
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 LINC01556Q5JQF7 62 aa-0.73□□□□□ -2.53
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 CENPEQ02224 2701 aa-0.74□□□□□ -2.53
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 H3BSH0 61 aa-0.74□□□□□ -2.53
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 ABCA13Q86UQ4 5058 aa-0.75□□□□□ -2.53
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 DNAH12Q6ZR08 3092 aa-0.76□□□□□ -2.53
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa-0.76□□□□□ -2.53
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 DCHS1Q96JQ0 3298 aa-0.77□□□□□ -2.53
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 EP400Q96L91 3159 aa-0.78□□□□□ -2.53
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 LOC400499M0QZD8 3231 aa-0.8□□□□□ -2.54
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 APELAP0DMC3 54 aa-0.8□□□□□ -2.54
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 A0A096LPF7 62 aa-0.81□□□□□ -2.54
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa-0.81□□□□□ -2.54
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 RPL39P5Q59GN2 51 aa-0.81□□□□□ -2.54
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 DEFB108AA8MXU0 73 aa-0.83□□□□□ -2.54
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 ASPMQ8IZT6 3477 aa-0.84□□□□□ -2.54
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 UNC80Q8N2C7 3258 aa-0.86□□□□□ -2.55
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 USP34Q70CQ2 3546 aa-0.87□□□□□ -2.55
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 BRCA2P51587 3418 aa-0.88□□□□□ -2.55
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa-0.89□□□□□ -2.55
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 CENPFP49454 3210 aa-0.92□□□□□ -2.56
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 HTN3P15516 51 aa-0.92□□□□□ -2.56
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 DNAH14Q0VDD8 3507 aa-0.93□□□□□ -2.56
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa-0.93□□□□□ -2.56
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 Q9Y3F1 56 aa-0.95□□□□□ -2.56
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 VCANP13611 3396 aa-0.96□□□□□ -2.56
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 CDH23Q9H251 3354 aa-1.03□□□□□ -2.57
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 DEFB108BQ8NET1 73 aa-1.07□□□□□ -2.58
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 UTRNP46939 3433 aa-1.08□□□□□ -2.58
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 VPS13AQ96RL7 3174 aa-1.1□□□□□ -2.58
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 COX14Q96I36 57 aa-1.1□□□□□ -2.59
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP-1.13□□□□□ -2.59
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 STATHP02808 62 aa-1.24□□□□□ -2.61
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.6 ms