RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589485.5

ILF3-215, Transcript of interleukin enhancer binding factor 3, humanhuman

TSL 2

Gene ILF3, Length 620 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3-215ENST00000589485 MT1LQ93083 61 aa7.37□□□□□ -1.23
ILF3-215ENST00000589485 K7ERS5 55 aa7.34□□□□□ -1.23
ILF3-215ENST00000589485 Q1T7F1 81 aa7.34□□□□□ -1.23
ILF3-215ENST00000589485 MT1MQ8N339 61 aa7.32□□□□□ -1.24
ILF3-215ENST00000589485 KRTAP12-3P60328 96 aa7.22□□□□□ -1.25
ILF3-215ENST00000589485 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa7.22□□□□□ -1.25
ILF3-215ENST00000589485 A6NED7 52 aa7.16□□□□□ -1.26
ILF3-215ENST00000589485 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa7.16□□□□□ -1.26
ILF3-215ENST00000589485 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa7.15□□□□□ -1.26
ILF3-215ENST00000589485 PCP4P48539 62 aa7.07□□□□□ -1.28
ILF3-215ENST00000589485 LCE4AQ5TA78 99 aa7.03□□□□□ -1.28
ILF3-215ENST00000589485 RPS28P62857 69 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
ILF3-215ENST00000589485 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.02□□□□□ -1.29
ILF3-215ENST00000589485 LCE1DQ5T752 114 aa6.99□□□□□ -1.29
ILF3-215ENST00000589485 MT4P47944 62 aa6.96□□□□□ -1.3
ILF3-215ENST00000589485 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.94□□□□□ -1.3
ILF3-215ENST00000589485 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.92□□□□□ -1.3
ILF3-215ENST00000589485 SVIPQ8NHG7 77 aa6.89□□□□□ -1.31
ILF3-215ENST00000589485 HMCN1Q96RW7 5635 aa6.89□□□□□ -1.31
ILF3-215ENST00000589485 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa6.88□□□□□ -1.31
ILF3-215ENST00000589485 GPR98Q8WXG9 6306 aa6.86□□□□□ -1.31
ILF3-215ENST00000589485 ROMO1P60602 79 aa6.82□□□□□ -1.32
ILF3-215ENST00000589485 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.79□□□□□ -1.32
ILF3-215ENST00000589485 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.79□□□□□ -1.32
ILF3-215ENST00000589485 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.74□□□□□ -1.33
ILF3-215ENST00000589485 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
ILF3-215ENST00000589485 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.65□□□□□ -1.34
ILF3-215ENST00000589485 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.65□□□□□ -1.34
ILF3-215ENST00000589485 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa6.64□□□□□ -1.35
ILF3-215ENST00000589485 KRTAP12-4P60329 112 aa6.53□□□□□ -1.36
ILF3-215ENST00000589485 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa6.51□□□□□ -1.37
ILF3-215ENST00000589485 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.49□□□□□ -1.37
ILF3-215ENST00000589485 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa6.41□□□□□ -1.38
ILF3-215ENST00000589485 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
ILF3-215ENST00000589485 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.31□□□□□ -1.4
ILF3-215ENST00000589485 MT1AP04731 61 aa6.28□□□□□ -1.4
ILF3-215ENST00000589485 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa6.24□□□□□ -1.41
ILF3-215ENST00000589485 BRK1Q8WUW1 75 aa6.24□□□□□ -1.41
ILF3-215ENST00000589485 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa6.23□□□□□ -1.41
ILF3-215ENST00000589485 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa6.15□□□□□ -1.42
ILF3-215ENST00000589485 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.05□□□□□ -1.44
ILF3-215ENST00000589485 KRTAP5-2Q701N4 177 aa6.04□□□□□ -1.44
ILF3-215ENST00000589485 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.94□□□□□ -1.46
ILF3-215ENST00000589485 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.92□□□□□ -1.46
ILF3-215ENST00000589485 PMAIP1Q13794 54 aa5.86□□□□□ -1.47
ILF3-215ENST00000589485 PRO0628Q9UI54 55 aa5.85□□□□□ -1.47
ILF3-215ENST00000589485 MT3P25713 68 aa5.76□□□□□ -1.49
ILF3-215ENST00000589485 KRTAP5-8O75690 187 aa5.7□□□□□ -1.5
ILF3-215ENST00000589485 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.63□□□□□ -1.51
ILF3-215ENST00000589485 PRAC1Q96KF2 57 aa5.63□□□□□ -1.51
ILF3-215ENST00000589485 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
ILF3-215ENST00000589485 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
ILF3-215ENST00000589485 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.43□□□□□ -1.54
ILF3-215ENST00000589485 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa5.4□□□□□ -1.54
ILF3-215ENST00000589485 MUC5ACP98088 5654 aa5.38□□□□□ -1.55
ILF3-215ENST00000589485 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.34□□□□□ -1.55
ILF3-215ENST00000589485 LCE1EQ5T753 118 aa5.22□□□□□ -1.57
ILF3-215ENST00000589485 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.97□□□□□ -1.61
ILF3-215ENST00000589485 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.91□□□□□ -1.62
ILF3-215ENST00000589485 LCE1CQ5T751 118 aa4.85□□□□□ -1.63
ILF3-215ENST00000589485 H3BS24 57 aa4.84□□□□□ -1.63
ILF3-215ENST00000589485 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.83□□□□□ -1.64
ILF3-215ENST00000589485 LUZP6Q538Z0 58 aa4.79□□□□□ -1.64
ILF3-215ENST00000589485 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.56□□□□□ -1.68
ILF3-215ENST00000589485 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.46□□□□□ -1.7
ILF3-215ENST00000589485 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.41□□□□□ -1.7
ILF3-215ENST00000589485 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.38□□□□□ -1.71
ILF3-215ENST00000589485 LCE1FQ5T754 118 aa4.24□□□□□ -1.73
ILF3-215ENST00000589485 NDUFAF8A1L188 74 aa4.21□□□□□ -1.74
ILF3-215ENST00000589485 A0A0A0MQY5 61 aa4.14□□□□□ -1.75
ILF3-215ENST00000589485 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.08□□□□□ -1.76
ILF3-215ENST00000589485 PHGR1C9JFL3 82 aa3.78□□□□□ -1.8
ILF3-215ENST00000589485 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.77□□□□□ -1.81
ILF3-215ENST00000589485 INE1O15225 51 aa3.67□□□□□ -1.82
ILF3-215ENST00000589485 PRM1P04553 51 aa3.5□□□□□ -1.85
ILF3-215ENST00000589485 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.48□□□□□ -1.85
ILF3-215ENST00000589485 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.85□□□□□ -1.95
ILF3-215ENST00000589485 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.5□□□□□ -2.01
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms