RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589055.3

TMEM259-206, Transcript of transmembrane protein 259, human

TSL 3

Gene TMEM259, Length 791 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM259-206	ENST00000589055	MT1M	Q8N339	61 aa		5.69	□□□□□ -1.5
TMEM259-206	ENST00000589055	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		5.69	□□□□□ -1.5
TMEM259-206	ENST00000589055	PP632	Q6XCG6	107 aa		5.66	□□□□□ -1.5
TMEM259-206	ENST00000589055	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		5.64	□□□□□ -1.51
TMEM259-206	ENST00000589055	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		5.62	□□□□□ -1.51
TMEM259-206	ENST00000589055	TNP1	P09430	55 aa		5.61	□□□□□ -1.51
TMEM259-206	ENST00000589055	PCP4	P48539	62 aa		5.6	□□□□□ -1.51
TMEM259-206	ENST00000589055	PRR15L	Q9BU68	103 aa		5.55	□□□□□ -1.52
TMEM259-206	ENST00000589055	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	5.54	□□□□□ -1.52
TMEM259-206	ENST00000589055	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		5.53	□□□□□ -1.52
TMEM259-206	ENST00000589055	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		5.5	□□□□□ -1.53
TMEM259-206	ENST00000589055	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		5.48	□□□□□ -1.53
TMEM259-206	ENST00000589055	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		5.45	□□□□□ -1.54
TMEM259-206	ENST00000589055	TMEM258	P61165	79 aa		5.44	□□□□□ -1.54
TMEM259-206	ENST00000589055	KRTAP12-3	P60328	96 aa		5.43	□□□□□ -1.54
TMEM259-206	ENST00000589055	UQCR11	O14957	56 aa		5.39	□□□□□ -1.55
TMEM259-206	ENST00000589055	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		5.29	□□□□□ -1.56
TMEM259-206	ENST00000589055	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	5.29	□□□□□ -1.56
TMEM259-206	ENST00000589055	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		5.25	□□□□□ -1.57
TMEM259-206	ENST00000589055	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		5.22	□□□□□ -1.57
TMEM259-206	ENST00000589055	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
TMEM259-206	ENST00000589055	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TMEM259-206	ENST00000589055	PSPHP1	O15172	72 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TMEM259-206	ENST00000589055	MUC5AC	P98088	5654 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TMEM259-206	ENST00000589055	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
TMEM259-206	ENST00000589055		K7ERS5	55 aa		5.14	□□□□□ -1.59
TMEM259-206	ENST00000589055	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
TMEM259-206	ENST00000589055		Q1T7F1	81 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TMEM259-206	ENST00000589055		V9GYY9	64 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TMEM259-206	ENST00000589055	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TMEM259-206	ENST00000589055	KRTAP12-4	P60329	112 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TMEM259-206	ENST00000589055	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TMEM259-206	ENST00000589055	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TMEM259-206	ENST00000589055	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TMEM259-206	ENST00000589055	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TMEM259-206	ENST00000589055		A6NED7	52 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TMEM259-206	ENST00000589055	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TMEM259-206	ENST00000589055	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TMEM259-206	ENST00000589055	KRTAP5-8	O75690	187 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TMEM259-206	ENST00000589055	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TMEM259-206	ENST00000589055	MT1A	P04731	61 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TMEM259-206	ENST00000589055	ROMO1	P60602	79 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TMEM259-206	ENST00000589055	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TMEM259-206	ENST00000589055	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TMEM259-206	ENST00000589055	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TMEM259-206	ENST00000589055	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TMEM259-206	ENST00000589055	BRK1	Q8WUW1	75 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TMEM259-206	ENST00000589055	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TMEM259-206	ENST00000589055	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMEM259-206	ENST00000589055	PRO0628	Q9UI54	55 aa		4.46	□□□□□ -1.7
TMEM259-206	ENST00000589055	MT3	P25713	68 aa		4.38	□□□□□ -1.71
TMEM259-206	ENST00000589055	PMAIP1	Q13794	54 aa		4.38	□□□□□ -1.71
TMEM259-206	ENST00000589055	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		4.3	□□□□□ -1.72
TMEM259-206	ENST00000589055	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TMEM259-206	ENST00000589055	PRAC1	Q96KF2	57 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TMEM259-206	ENST00000589055	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TMEM259-206	ENST00000589055	SVIP	Q8NHG7	77 aa		3.95	□□□□□ -1.78
TMEM259-206	ENST00000589055	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TMEM259-206	ENST00000589055	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TMEM259-206	ENST00000589055	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TMEM259-206	ENST00000589055	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		3.63	□□□□□ -1.83
TMEM259-206	ENST00000589055	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TMEM259-206	ENST00000589055	PHGR1	C9JFL3	82 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TMEM259-206	ENST00000589055	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TMEM259-206	ENST00000589055	LUZP6	Q538Z0	58 aa		3.4	□□□□□ -1.87
TMEM259-206	ENST00000589055	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.4	□□□□□ -1.87
TMEM259-206	ENST00000589055	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
TMEM259-206	ENST00000589055	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TMEM259-206	ENST00000589055	NDUFAF8	A1L188	74 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TMEM259-206	ENST00000589055	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TMEM259-206	ENST00000589055	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.98	□□□□□ -1.93
TMEM259-206	ENST00000589055	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.83	□□□□□ -1.96
TMEM259-206	ENST00000589055		A0A0A0MQY5	61 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TMEM259-206	ENST00000589055	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TMEM259-206	ENST00000589055	INE1	O15225	51 aa		2.63	□□□□□ -1.99
TMEM259-206	ENST00000589055		H3BS24	57 aa		2.52	□□□□□ -2.01
TMEM259-206	ENST00000589055	PRM1	P04553	51 aa		2.51	□□□□□ -2.01
TMEM259-206	ENST00000589055	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.97	□□□□□ -2.09

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