RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567147.5

RNPS1-222, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, human

TSL 3 BASIC

Gene RNPS1, Length 830 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNPS1-222	ENST00000567147	LCE3A	Q5TA76	89 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RNPS1-222	ENST00000567147	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RNPS1-222	ENST00000567147	MT1L	Q93083	61 aa		6.21	□□□□□ -1.42
RNPS1-222	ENST00000567147	MT1M	Q8N339	61 aa		6.2	□□□□□ -1.42
RNPS1-222	ENST00000567147	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		6.17	□□□□□ -1.42
RNPS1-222	ENST00000567147	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		6.13	□□□□□ -1.43
RNPS1-222	ENST00000567147	TMEM258	P61165	79 aa		6.11	□□□□□ -1.43
RNPS1-222	ENST00000567147	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		6.09	□□□□□ -1.43
RNPS1-222	ENST00000567147	UQCR11	O14957	56 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RNPS1-222	ENST00000567147	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RNPS1-222	ENST00000567147	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RNPS1-222	ENST00000567147	KRTAP12-3	P60328	96 aa		6	□□□□□ -1.45
RNPS1-222	ENST00000567147	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		5.99	□□□□□ -1.45
RNPS1-222	ENST00000567147	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		5.95	□□□□□ -1.46
RNPS1-222	ENST00000567147	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		5.93	□□□□□ -1.46
RNPS1-222	ENST00000567147	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		5.88	□□□□□ -1.47
RNPS1-222	ENST00000567147		K7ERS5	55 aa		5.84	□□□□□ -1.47
RNPS1-222	ENST00000567147	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		5.83	□□□□□ -1.48
RNPS1-222	ENST00000567147	PSPHP1	O15172	72 aa		5.82	□□□□□ -1.48
RNPS1-222	ENST00000567147		V9GYY9	64 aa		5.81	□□□□□ -1.48
RNPS1-222	ENST00000567147		Q1T7F1	81 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RNPS1-222	ENST00000567147	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
RNPS1-222	ENST00000567147	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		5.65	□□□□□ -1.5
RNPS1-222	ENST00000567147	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		5.64	□□□□□ -1.51
RNPS1-222	ENST00000567147	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		5.62	□□□□□ -1.51
RNPS1-222	ENST00000567147		A6NED7	52 aa		5.6	□□□□□ -1.51
RNPS1-222	ENST00000567147	KRTAP12-4	P60329	112 aa		5.6	□□□□□ -1.51
RNPS1-222	ENST00000567147	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		5.6	□□□□□ -1.51
RNPS1-222	ENST00000567147	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		5.53	□□□□□ -1.52
RNPS1-222	ENST00000567147	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
RNPS1-222	ENST00000567147	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		5.52	□□□□□ -1.53
RNPS1-222	ENST00000567147	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
RNPS1-222	ENST00000567147	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		5.45	□□□□□ -1.54
RNPS1-222	ENST00000567147	ROMO1	P60602	79 aa		5.44	□□□□□ -1.54
RNPS1-222	ENST00000567147	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
RNPS1-222	ENST00000567147	MUC5AC	P98088	5654 aa		5.4	□□□□□ -1.54
RNPS1-222	ENST00000567147	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
RNPS1-222	ENST00000567147	KRTAP5-8	O75690	187 aa		5.31	□□□□□ -1.56
RNPS1-222	ENST00000567147	MT1A	P04731	61 aa		5.28	□□□□□ -1.56
RNPS1-222	ENST00000567147	PCP4	P48539	62 aa		5.27	□□□□□ -1.57
RNPS1-222	ENST00000567147	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		5.26	□□□□□ -1.57
RNPS1-222	ENST00000567147	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		5.24	□□□□□ -1.57
RNPS1-222	ENST00000567147	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RNPS1-222	ENST00000567147	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RNPS1-222	ENST00000567147	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RNPS1-222	ENST00000567147	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RNPS1-222	ENST00000567147	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RNPS1-222	ENST00000567147	MT3	P25713	68 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RNPS1-222	ENST00000567147	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RNPS1-222	ENST00000567147		H3BS24	57 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RNPS1-222	ENST00000567147	BRK1	Q8WUW1	75 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RNPS1-222	ENST00000567147	PMAIP1	Q13794	54 aa		4.46	□□□□□ -1.7
RNPS1-222	ENST00000567147	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.45	□□□□□ -1.7
RNPS1-222	ENST00000567147	PRAC1	Q96KF2	57 aa		4.32	□□□□□ -1.72
RNPS1-222	ENST00000567147	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		4.27	□□□□□ -1.73
RNPS1-222	ENST00000567147	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RNPS1-222	ENST00000567147	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RNPS1-222	ENST00000567147	LCE1C	Q5T751	118 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RNPS1-222	ENST00000567147	SVIP	Q8NHG7	77 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RNPS1-222	ENST00000567147	PRO0628	Q9UI54	55 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RNPS1-222	ENST00000567147	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RNPS1-222	ENST00000567147	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		3.86	□□□□□ -1.79
RNPS1-222	ENST00000567147	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RNPS1-222	ENST00000567147	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
RNPS1-222	ENST00000567147	PHGR1	C9JFL3	82 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RNPS1-222	ENST00000567147	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RNPS1-222	ENST00000567147	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.72	□□□□□ -1.81
RNPS1-222	ENST00000567147	LUZP6	Q538Z0	58 aa		3.66	□□□□□ -1.82
RNPS1-222	ENST00000567147	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		3.47	□□□□□ -1.85
RNPS1-222	ENST00000567147		A0A0A0MQY5	61 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RNPS1-222	ENST00000567147	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.25	□□□□□ -1.89
RNPS1-222	ENST00000567147	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RNPS1-222	ENST00000567147	NDUFAF8	A1L188	74 aa		2.82	□□□□□ -1.96
RNPS1-222	ENST00000567147	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.8	□□□□□ -1.96
RNPS1-222	ENST00000567147	PRM1	P04553	51 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RNPS1-222	ENST00000567147	INE1	O15225	51 aa		2.22	□□□□□ -2.05
RNPS1-222	ENST00000567147	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		2.19	□□□□□ -2.06

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