RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559460.5

SMAD3-211, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-211ENST00000559460 KRTAP23-1A1A580 65 aa3.44□□□□□ -1.86
SMAD3-211ENST00000559460 Q1T7F1 81 aa3.44□□□□□ -1.86
SMAD3-211ENST00000559460 SEC61GP60059 68 aa3.43□□□□□ -1.86
SMAD3-211ENST00000559460 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa3.43□□□□□ -1.86
SMAD3-211ENST00000559460 PRR15LQ9BU68 103 aa3.42□□□□□ -1.86
SMAD3-211ENST00000559460 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa3.39□□□□□ -1.87
SMAD3-211ENST00000559460 A0A1B0GU69 56 aa3.38□□□□□ -1.87
SMAD3-211ENST00000559460 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa3.38□□□□□ -1.87
SMAD3-211ENST00000559460 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.38□□□□□ -1.87
SMAD3-211ENST00000559460 KRTAP12-4P60329 112 aa3.37□□□□□ -1.87
SMAD3-211ENST00000559460 MT1LQ93083 61 aa3.34□□□□□ -1.87
SMAD3-211ENST00000559460 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
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SMAD3-211ENST00000559460 A0A0D9SG42 100 aa3.32□□□□□ -1.88
SMAD3-211ENST00000559460 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.31□□□□□ -1.88
SMAD3-211ENST00000559460 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa3.31□□□□□ -1.88
SMAD3-211ENST00000559460 A0A1B0GU33 70 aa3.3□□□□□ -1.88
SMAD3-211ENST00000559460 UQCR11O14957 56 aa3.3□□□□□ -1.88
SMAD3-211ENST00000559460 PSPHP1O15172 72 aa3.29□□□□□ -1.88
SMAD3-211ENST00000559460 A0A0A0MQY5 61 aa3.27□□□□□ -1.89
SMAD3-211ENST00000559460 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.26□□□□□ -1.89
SMAD3-211ENST00000559460 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
SMAD3-211ENST00000559460 KRTAP5-8O75690 187 aa3.24□□□□□ -1.89
SMAD3-211ENST00000559460 A6NED7 52 aa3.23□□□□□ -1.89
SMAD3-211ENST00000559460 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa3.23□□□□□ -1.89
SMAD3-211ENST00000559460 SPATA8Q6RVD6 105 aa3.23□□□□□ -1.89
SMAD3-211ENST00000559460 MIR22HGQ0VDD5 57 aa3.22□□□□□ -1.89
SMAD3-211ENST00000559460 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.2□□□□□ -1.9
SMAD3-211ENST00000559460 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa3.2□□□□□ -1.9
SMAD3-211ENST00000559460 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
SMAD3-211ENST00000559460 K7ERS5 55 aa3.15□□□□□ -1.91
SMAD3-211ENST00000559460 SPINT4Q6UDR6 99 aa3.15□□□□□ -1.91
SMAD3-211ENST00000559460 C10orf95Q9H7T3 257 aa3.13□□□□□ -1.91
SMAD3-211ENST00000559460 BRK1Q8WUW1 75 aa3.12□□□□□ -1.91
SMAD3-211ENST00000559460 A8MU10 97 aa3.1□□□□□ -1.91
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SMAD3-211ENST00000559460 PRO0628Q9UI54 55 aa3.08□□□□□ -1.92
SMAD3-211ENST00000559460 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.07□□□□□ -1.92
SMAD3-211ENST00000559460 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
SMAD3-211ENST00000559460 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.05□□□□□ -1.92
SMAD3-211ENST00000559460 LCE3AQ5TA76 89 aa3.04□□□□□ -1.92
SMAD3-211ENST00000559460 PMAIP1Q13794 54 aa2.99□□□□□ -1.93
SMAD3-211ENST00000559460 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.96□□□□□ -1.93
SMAD3-211ENST00000559460 ROMO1P60602 79 aa2.96□□□□□ -1.94
SMAD3-211ENST00000559460 TNP1P09430 55 aa2.94□□□□□ -1.94
SMAD3-211ENST00000559460 KRTAP12-3P60328 96 aa2.94□□□□□ -1.94
SMAD3-211ENST00000559460 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa2.92□□□□□ -1.94
SMAD3-211ENST00000559460 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa2.87□□□□□ -1.95
SMAD3-211ENST00000559460 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa2.86□□□□□ -1.95
SMAD3-211ENST00000559460 MT1AP04731 61 aa2.85□□□□□ -1.95
SMAD3-211ENST00000559460 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa2.85□□□□□ -1.95
SMAD3-211ENST00000559460 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.85□□□□□ -1.95
SMAD3-211ENST00000559460 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa2.84□□□□□ -1.95
SMAD3-211ENST00000559460 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.83□□□□□ -1.96
SMAD3-211ENST00000559460 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.74□□□□□ -1.97
SMAD3-211ENST00000559460 PRAC1Q96KF2 57 aa2.7□□□□□ -1.98
SMAD3-211ENST00000559460 MT3P25713 68 aa2.67□□□□□ -1.98
SMAD3-211ENST00000559460 LCE3CQ5T5A8 94 aa2.63□□□□□ -1.99
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SMAD3-211ENST00000559460 NDUFAF8A1L188 74 aa2.53□□□□□ -2
SMAD3-211ENST00000559460 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.5□□□□□ -2.01
SMAD3-211ENST00000559460 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.44□□□□□ -2.02
SMAD3-211ENST00000559460 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa2.41□□□□□ -2.02
SMAD3-211ENST00000559460 PHGR1C9JFL3 82 aa2.39□□□□□ -2.03
SMAD3-211ENST00000559460 LCE1CQ5T751 118 aa2.37□□□□□ -2.03
SMAD3-211ENST00000559460 LUZP6Q538Z0 58 aa2.35□□□□□ -2.03
SMAD3-211ENST00000559460 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.29□□□□□ -2.04
SMAD3-211ENST00000559460 LCE1FQ5T754 118 aa2.27□□□□□ -2.05
SMAD3-211ENST00000559460 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.04□□□□□ -2.08
SMAD3-211ENST00000559460 INE1O15225 51 aa1.88□□□□□ -2.11
SMAD3-211ENST00000559460 LCE3DQ9BYE3 92 aa1.87□□□□□ -2.11
SMAD3-211ENST00000559460 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.85□□□□□ -2.11
SMAD3-211ENST00000559460 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.83□□□□□ -2.12
SMAD3-211ENST00000559460 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.83□□□□□ -2.12
SMAD3-211ENST00000559460 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa1.82□□□□□ -2.12
SMAD3-211ENST00000559460 LCE3EQ5T5B0 92 aa1.81□□□□□ -2.12
SMAD3-211ENST00000559460 PRM1P04553 51 aa1.49□□□□□ -2.17
SMAD3-211ENST00000559460 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.3□□□□□ -2.2
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