RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549076.1

ARFGAP1-222, Transcript of ADP ribosylation factor GTPase activating protein 1, human

TSL 2

Gene ARFGAP1, Length 913 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARFGAP1-222	ENST00000549076	TMEM258	P61165	79 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ARFGAP1-222	ENST00000549076	LCE4A	Q5TA78	99 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ARFGAP1-222	ENST00000549076	LCE1D	Q5T752	114 aa		5.88	□□□□□ -1.47
ARFGAP1-222	ENST00000549076	MT4	P47944	62 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ARFGAP1-222	ENST00000549076	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ARFGAP1-222	ENST00000549076	KRTAP12-3	P60328	96 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ARFGAP1-222	ENST00000549076	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ARFGAP1-222	ENST00000549076	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ARFGAP1-222	ENST00000549076		K7ERS5	55 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ARFGAP1-222	ENST00000549076	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ARFGAP1-222	ENST00000549076	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ARFGAP1-222	ENST00000549076	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ARFGAP1-222	ENST00000549076		V9GYY9	64 aa		5.66	□□□□□ -1.5
ARFGAP1-222	ENST00000549076	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		5.63	□□□□□ -1.51
ARFGAP1-222	ENST00000549076	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		5.62	□□□□□ -1.51
ARFGAP1-222	ENST00000549076	PSPHP1	O15172	72 aa		5.59	□□□□□ -1.51
ARFGAP1-222	ENST00000549076		Q1T7F1	81 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ARFGAP1-222	ENST00000549076	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		5.54	□□□□□ -1.52
ARFGAP1-222	ENST00000549076	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ARFGAP1-222	ENST00000549076	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ARFGAP1-222	ENST00000549076	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	5.47	□□□□□ -1.53
ARFGAP1-222	ENST00000549076	KRTAP12-4	P60329	112 aa		5.45	□□□□□ -1.54
ARFGAP1-222	ENST00000549076		A6NED7	52 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ARFGAP1-222	ENST00000549076	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ARFGAP1-222	ENST00000549076	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ARFGAP1-222	ENST00000549076	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		5.42	□□□□□ -1.54
ARFGAP1-222	ENST00000549076	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		5.38	□□□□□ -1.55
ARFGAP1-222	ENST00000549076	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		5.38	□□□□□ -1.55
ARFGAP1-222	ENST00000549076	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ARFGAP1-222	ENST00000549076	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ARFGAP1-222	ENST00000549076	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	5.3	□□□□□ -1.56
ARFGAP1-222	ENST00000549076	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		5.29	□□□□□ -1.56
ARFGAP1-222	ENST00000549076	ROMO1	P60602	79 aa		5.27	□□□□□ -1.57
ARFGAP1-222	ENST00000549076	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
ARFGAP1-222	ENST00000549076	PCP4	P48539	62 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ARFGAP1-222	ENST00000549076	MT1A	P04731	61 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ARFGAP1-222	ENST00000549076	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ARFGAP1-222	ENST00000549076	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ARFGAP1-222	ENST00000549076	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ARFGAP1-222	ENST00000549076	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ARFGAP1-222	ENST00000549076	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARFGAP1-222	ENST00000549076	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARFGAP1-222	ENST00000549076	KRTAP5-8	O75690	187 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ARFGAP1-222	ENST00000549076	MT3	P25713	68 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ARFGAP1-222	ENST00000549076	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ARFGAP1-222	ENST00000549076	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
ARFGAP1-222	ENST00000549076	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ARFGAP1-222	ENST00000549076	MUC5AC	P98088	5654 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ARFGAP1-222	ENST00000549076	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ARFGAP1-222	ENST00000549076	SVIP	Q8NHG7	77 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ARFGAP1-222	ENST00000549076	BRK1	Q8WUW1	75 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARFGAP1-222	ENST00000549076	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ARFGAP1-222	ENST00000549076	PRO0628	Q9UI54	55 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ARFGAP1-222	ENST00000549076	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ARFGAP1-222	ENST00000549076	PMAIP1	Q13794	54 aa		4.29	□□□□□ -1.72
ARFGAP1-222	ENST00000549076	PRAC1	Q96KF2	57 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ARFGAP1-222	ENST00000549076	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ARFGAP1-222	ENST00000549076	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ARFGAP1-222	ENST00000549076	LCE1C	Q5T751	118 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ARFGAP1-222	ENST00000549076	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ARFGAP1-222	ENST00000549076	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ARFGAP1-222	ENST00000549076	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		3.71	□□□□□ -1.82
ARFGAP1-222	ENST00000549076	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.63	□□□□□ -1.83
ARFGAP1-222	ENST00000549076	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.63	□□□□□ -1.83
ARFGAP1-222	ENST00000549076	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.62	□□□□□ -1.83
ARFGAP1-222	ENST00000549076	LUZP6	Q538Z0	58 aa		3.61	□□□□□ -1.83
ARFGAP1-222	ENST00000549076	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ARFGAP1-222	ENST00000549076	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ARFGAP1-222	ENST00000549076	PHGR1	C9JFL3	82 aa		3.23	□□□□□ -1.89
ARFGAP1-222	ENST00000549076		H3BS24	57 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ARFGAP1-222	ENST00000549076	NDUFAF8	A1L188	74 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ARFGAP1-222	ENST00000549076		A0A0A0MQY5	61 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ARFGAP1-222	ENST00000549076	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ARFGAP1-222	ENST00000549076	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.93	□□□□□ -1.94
ARFGAP1-222	ENST00000549076	INE1	O15225	51 aa		2.79	□□□□□ -1.96
ARFGAP1-222	ENST00000549076	PRM1	P04553	51 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ARFGAP1-222	ENST00000549076	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.47	□□□□□ -2.01
ARFGAP1-222	ENST00000549076	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		2.04	□□□□□ -2.08

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