RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533644.5

BBS1-223, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 3

Gene BBS1, Length 910 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-223	ENST00000533644	LCE1D	Q5T752	114 aa		6.26	□□□□□ -1.41
BBS1-223	ENST00000533644	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		6.26	□□□□□ -1.41
BBS1-223	ENST00000533644	UQCR11	O14957	56 aa		6.2	□□□□□ -1.42
BBS1-223	ENST00000533644	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		6.18	□□□□□ -1.42
BBS1-223	ENST00000533644	MT4	P47944	62 aa		6.13	□□□□□ -1.43
BBS1-223	ENST00000533644	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		6.12	□□□□□ -1.43
BBS1-223	ENST00000533644	LCE4A	Q5TA78	99 aa		6.1	□□□□□ -1.43
BBS1-223	ENST00000533644	KRTAP12-3	P60328	96 aa		6.08	□□□□□ -1.44
BBS1-223	ENST00000533644	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		6.05	□□□□□ -1.44
BBS1-223	ENST00000533644	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		6.03	□□□□□ -1.44
BBS1-223	ENST00000533644	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		6.02	□□□□□ -1.45
BBS1-223	ENST00000533644	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		5.99	□□□□□ -1.45
BBS1-223	ENST00000533644	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		5.98	□□□□□ -1.45
BBS1-223	ENST00000533644		V9GYY9	64 aa		5.95	□□□□□ -1.46
BBS1-223	ENST00000533644		K7ERS5	55 aa		5.93	□□□□□ -1.46
BBS1-223	ENST00000533644	PSPHP1	O15172	72 aa		5.92	□□□□□ -1.46
BBS1-223	ENST00000533644		Q1T7F1	81 aa		5.92	□□□□□ -1.46
BBS1-223	ENST00000533644	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		5.92	□□□□□ -1.46
BBS1-223	ENST00000533644	SVIP	Q8NHG7	77 aa		5.85	□□□□□ -1.47
BBS1-223	ENST00000533644	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		5.84	□□□□□ -1.47
BBS1-223	ENST00000533644	PCP4	P48539	62 aa		5.8	□□□□□ -1.48
BBS1-223	ENST00000533644	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
BBS1-223	ENST00000533644	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		5.78	□□□□□ -1.48
BBS1-223	ENST00000533644	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		5.78	□□□□□ -1.48
BBS1-223	ENST00000533644	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		5.76	□□□□□ -1.49
BBS1-223	ENST00000533644		A6NED7	52 aa		5.72	□□□□□ -1.49
BBS1-223	ENST00000533644	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		5.68	□□□□□ -1.5
BBS1-223	ENST00000533644	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		5.66	□□□□□ -1.5
BBS1-223	ENST00000533644	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		5.66	□□□□□ -1.5
BBS1-223	ENST00000533644	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		5.64	□□□□□ -1.51
BBS1-223	ENST00000533644	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		5.63	□□□□□ -1.51
BBS1-223	ENST00000533644	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		5.6	□□□□□ -1.51
BBS1-223	ENST00000533644	KRTAP12-4	P60329	112 aa		5.59	□□□□□ -1.51
BBS1-223	ENST00000533644	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	5.58	□□□□□ -1.52
BBS1-223	ENST00000533644	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	5.55	□□□□□ -1.52
BBS1-223	ENST00000533644	ROMO1	P60602	79 aa		5.54	□□□□□ -1.52
BBS1-223	ENST00000533644	MT1A	P04731	61 aa		5.37	□□□□□ -1.55
BBS1-223	ENST00000533644	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		5.33	□□□□□ -1.56
BBS1-223	ENST00000533644	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		5.31	□□□□□ -1.56
BBS1-223	ENST00000533644	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		5.28	□□□□□ -1.56
BBS1-223	ENST00000533644	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BBS1-223	ENST00000533644	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		5.18	□□□□□ -1.58
BBS1-223	ENST00000533644	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
BBS1-223	ENST00000533644	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
BBS1-223	ENST00000533644	MUC5AC	P98088	5654 aa		5.15	□□□□□ -1.58
BBS1-223	ENST00000533644	KRTAP5-8	O75690	187 aa		5.09	□□□□□ -1.59
BBS1-223	ENST00000533644	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		5.09	□□□□□ -1.59
BBS1-223	ENST00000533644	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		5.01	□□□□□ -1.61
BBS1-223	ENST00000533644	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BBS1-223	ENST00000533644		H3BS24	57 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS1-223	ENST00000533644	MT3	P25713	68 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS1-223	ENST00000533644	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS1-223	ENST00000533644	BRK1	Q8WUW1	75 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS1-223	ENST00000533644	PRO0628	Q9UI54	55 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BBS1-223	ENST00000533644	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		4.72	□□□□□ -1.65
BBS1-223	ENST00000533644	PMAIP1	Q13794	54 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS1-223	ENST00000533644	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.52	□□□□□ -1.69
BBS1-223	ENST00000533644	PRAC1	Q96KF2	57 aa		4.42	□□□□□ -1.7
BBS1-223	ENST00000533644	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		4.35	□□□□□ -1.71
BBS1-223	ENST00000533644	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.34	□□□□□ -1.71
BBS1-223	ENST00000533644	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		4.21	□□□□□ -1.74
BBS1-223	ENST00000533644	LCE1C	Q5T751	118 aa		4.19	□□□□□ -1.74
BBS1-223	ENST00000533644	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		4.02	□□□□□ -1.77
BBS1-223	ENST00000533644	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.79
BBS1-223	ENST00000533644	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBS1-223	ENST00000533644	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.78	□□□□□ -1.8
BBS1-223	ENST00000533644	LUZP6	Q538Z0	58 aa		3.72	□□□□□ -1.81
BBS1-223	ENST00000533644	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.7	□□□□□ -1.82
BBS1-223	ENST00000533644		A0A0A0MQY5	61 aa		3.59	□□□□□ -1.83
BBS1-223	ENST00000533644	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		3.53	□□□□□ -1.84
BBS1-223	ENST00000533644	PHGR1	C9JFL3	82 aa		3.52	□□□□□ -1.85
BBS1-223	ENST00000533644	NDUFAF8	A1L188	74 aa		3.44	□□□□□ -1.86
BBS1-223	ENST00000533644	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.19	□□□□□ -1.9
BBS1-223	ENST00000533644	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		3.1	□□□□□ -1.91
BBS1-223	ENST00000533644	INE1	O15225	51 aa		3	□□□□□ -1.93
BBS1-223	ENST00000533644	PRM1	P04553	51 aa		2.83	□□□□□ -1.96
BBS1-223	ENST00000533644	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.66	□□□□□ -1.98
BBS1-223	ENST00000533644	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		2.17	□□□□□ -2.06

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