RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533644.5

BBS1-223, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 3

Gene BBS1, Length 910 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-223	ENST00000533644	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		43.75	■■■■■ 4.59
BBS1-223	ENST00000533644	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		39.08	■■■■□ 3.85
BBS1-223	ENST00000533644	ABCC9	O60706	1549 aa		38.5	■■■■□ 3.75
BBS1-223	ENST00000533644	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		36.91	■■■■□ 3.5
BBS1-223	ENST00000533644	NACAD	O15069	1562 aa		36.81	■■■■□ 3.48
BBS1-223	ENST00000533644	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		36.53	■■■■□ 3.44
BBS1-223	ENST00000533644	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		36.52	■■■■□ 3.44
BBS1-223	ENST00000533644	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	36.39	■■■■□ 3.42
BBS1-223	ENST00000533644	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		36.23	■■■■□ 3.39
BBS1-223	ENST00000533644	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		36.19	■■■■□ 3.38
BBS1-223	ENST00000533644	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		36.08	■■■■□ 3.37
BBS1-223	ENST00000533644	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	35.88	■■■■□ 3.33
BBS1-223	ENST00000533644	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		35.85	■■■■□ 3.33
BBS1-223	ENST00000533644	SCRIB	Q14160	1630 aa		35.57	■■■■□ 3.29
BBS1-223	ENST00000533644	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		35.48	■■■■□ 3.27
BBS1-223	ENST00000533644	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	34.91	■■■■□ 3.18
BBS1-223	ENST00000533644	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		34.84	■■■■□ 3.17
BBS1-223	ENST00000533644	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		34.65	■■■■□ 3.14
BBS1-223	ENST00000533644	SMARCA4	P51532	1647 aa		34.02	■■■■□ 3.04
BBS1-223	ENST00000533644	NCAPD3	P42695	1498 aa		33.97	■■■■□ 3.03
BBS1-223	ENST00000533644	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	33.94	■■■■□ 3.02
BBS1-223	ENST00000533644	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		33.93	■■■■□ 3.02
BBS1-223	ENST00000533644	SMARCA2	P51531	1590 aa		33.86	■■■■□ 3.01
BBS1-223	ENST00000533644	HMGXB3	Q12766	1538 aa		33.79	■■■■□ 3
BBS1-223	ENST00000533644	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		33.74	■■■□□ 2.99
BBS1-223	ENST00000533644	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		33.7	■■■□□ 2.99
BBS1-223	ENST00000533644	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	33.61	■■■□□ 2.97
BBS1-223	ENST00000533644	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		33.36	■■■□□ 2.93
BBS1-223	ENST00000533644	WIZ	O95785	1651 aa		33.3	■■■□□ 2.92
BBS1-223	ENST00000533644	NES	P48681	1621 aa		33.23	■■■□□ 2.91
BBS1-223	ENST00000533644	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	33.19	■■■□□ 2.9
BBS1-223	ENST00000533644	ERCC6	Q03468	1493 aa		33.19	■■■□□ 2.9
BBS1-223	ENST00000533644	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		33.12	■■■□□ 2.89
BBS1-223	ENST00000533644	CUX2	O14529	1486 aa		33.09	■■■□□ 2.89
BBS1-223	ENST00000533644	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	32.97	■■■□□ 2.87
BBS1-223	ENST00000533644	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		32.94	■■■□□ 2.86
BBS1-223	ENST00000533644	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		32.88	■■■□□ 2.85
BBS1-223	ENST00000533644	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	32.85	■■■□□ 2.85
BBS1-223	ENST00000533644	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		32.83	■■■□□ 2.85
BBS1-223	ENST00000533644	CFTR	P13569	1480 aa		32.69	■■■□□ 2.82
BBS1-223	ENST00000533644	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		32.59	■■■□□ 2.81
BBS1-223	ENST00000533644	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		32.55	■■■□□ 2.8
BBS1-223	ENST00000533644	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		32.54	■■■□□ 2.8
BBS1-223	ENST00000533644	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		32.54	■■■□□ 2.8
BBS1-223	ENST00000533644	WDR62	O43379	1518 aa		32.52	■■■□□ 2.8
BBS1-223	ENST00000533644	PRDM2	Q13029	1718 aa		32.4	■■■□□ 2.78
BBS1-223	ENST00000533644	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	32.27	■■■□□ 2.76
BBS1-223	ENST00000533644	TOPBP1	Q92547	1522 aa		32.01	■■■□□ 2.72
BBS1-223	ENST00000533644	ABCC8	Q09428	1581 aa		31.98	■■■□□ 2.71
BBS1-223	ENST00000533644	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	31.96	■■■□□ 2.71
BBS1-223	ENST00000533644	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		31.95	■■■□□ 2.71
BBS1-223	ENST00000533644	IFT140	Q96RY7	1462 aa		31.89	■■■□□ 2.7
BBS1-223	ENST00000533644	TRIM41	Q8WV44	630 aa		31.8	■■■□□ 2.68
BBS1-223	ENST00000533644	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	31.78	■■■□□ 2.68
BBS1-223	ENST00000533644	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	31.72	■■■□□ 2.67
BBS1-223	ENST00000533644	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	31.71	■■■□□ 2.67
BBS1-223	ENST00000533644	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	31.65	■■■□□ 2.66
BBS1-223	ENST00000533644	CUX1	P39880	1505 aa		31.65	■■■□□ 2.66
BBS1-223	ENST00000533644	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		31.58	■■■□□ 2.65
BBS1-223	ENST00000533644	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		31.55	■■■□□ 2.64
BBS1-223	ENST00000533644	SOGA1	O94964	1423 aa		31.54	■■■□□ 2.64
BBS1-223	ENST00000533644	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		31.53	■■■□□ 2.64
BBS1-223	ENST00000533644	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	31.52	■■■□□ 2.64	3e-6	■■■■□ 24.7
BBS1-223	ENST00000533644	WDR97	A6NE52	1622 aa		31.46	■■■□□ 2.63
BBS1-223	ENST00000533644	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	31.4	■■■□□ 2.62
BBS1-223	ENST00000533644	CHD1	O14646	1710 aa		31.29	■■■□□ 2.6
BBS1-223	ENST00000533644	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		31.29	■■■□□ 2.6
BBS1-223	ENST00000533644	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	31.29	■■■□□ 2.6
BBS1-223	ENST00000533644	TOP2B	Q02880	1626 aa		31.28	■■■□□ 2.6
BBS1-223	ENST00000533644	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		31.28	■■■□□ 2.6
BBS1-223	ENST00000533644	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		31.25	■■■□□ 2.59
BBS1-223	ENST00000533644	SYNJ1	O43426	1573 aa		31.25	■■■□□ 2.59
BBS1-223	ENST00000533644	GRIN2B	Q13224	1484 aa		31.24	■■■□□ 2.59
BBS1-223	ENST00000533644	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	31.21	■■■□□ 2.59
BBS1-223	ENST00000533644	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		31.2	■■■□□ 2.58
BBS1-223	ENST00000533644	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		31.2	■■■□□ 2.58
BBS1-223	ENST00000533644	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		31.2	■■■□□ 2.58
BBS1-223	ENST00000533644	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		31.2	■■■□□ 2.58
BBS1-223	ENST00000533644	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		31.19	■■■□□ 2.58
BBS1-223	ENST00000533644	PBRM1	Q86U86	1689 aa		31.15	■■■□□ 2.58
BBS1-223	ENST00000533644	FBLN2	P98095	1184 aa		31.13	■■■□□ 2.57
BBS1-223	ENST00000533644	SYNJ2	O15056	1496 aa		31.08	■■■□□ 2.57
BBS1-223	ENST00000533644	ARHGEF11	O15085	1522 aa		31.08	■■■□□ 2.57
BBS1-223	ENST00000533644	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	31.03	■■■□□ 2.56
BBS1-223	ENST00000533644	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		30.99	■■■□□ 2.55
BBS1-223	ENST00000533644	ADAMTS12	P58397	1594 aa		30.92	■■■□□ 2.54
BBS1-223	ENST00000533644	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		30.89	■■■□□ 2.54
BBS1-223	ENST00000533644	GRIN2A	Q12879	1464 aa		30.85	■■■□□ 2.53
BBS1-223	ENST00000533644	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		30.82	■■■□□ 2.52
BBS1-223	ENST00000533644	ARAP1	Q96P48	1450 aa		30.82	■■■□□ 2.52
BBS1-223	ENST00000533644	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		30.81	■■■□□ 2.52
BBS1-223	ENST00000533644	NUP160	Q12769	1436 aa		30.75	■■■□□ 2.51
BBS1-223	ENST00000533644	CEP170	Q5SW79	1584 aa		30.71	■■■□□ 2.51
BBS1-223	ENST00000533644	KIF27	Q86VH2	1401 aa		30.65	■■■□□ 2.5
BBS1-223	ENST00000533644	IGF1R	P08069	1367 aa		30.58	■■■□□ 2.49
BBS1-223	ENST00000533644	SHROOM2	Q13796	1616 aa		30.57	■■■□□ 2.48
BBS1-223	ENST00000533644	CUL7	Q14999	1698 aa		30.54	■■■□□ 2.48
BBS1-223	ENST00000533644	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	30.53	■■■□□ 2.48
BBS1-223	ENST00000533644	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		30.51	■■■□□ 2.47
BBS1-223	ENST00000533644	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		30.47	■■■□□ 2.47

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