RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAV7	A0A075B6U4	112 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SKAP2-209	ENST00000497511		H3BPC8	53 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A0D9SG42	100 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SKAP2-209	ENST00000497511	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SKAP2-209	ENST00000497511	MT1M	Q8N339	61 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM240A	A0A1B0GVK7	77 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SKAP2-209	ENST00000497511	ACYP2	P14621	99 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SKAP2-209	ENST00000497511	CHKB-CPT1B	H3BT56	60 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC00643	Q86TS7	51 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SKAP2-209	ENST00000497511	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SKAP2-209	ENST00000497511	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP13-4	Q3LI77	160 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SKAP2-209	ENST00000497511	MT1L	Q93083	61 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1B0GV90	55 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SKAP2-209	ENST00000497511	SCGB1A1	P11684	91 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SKAP2-209	ENST00000497511	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SKAP2-209	ENST00000497511	SPINT4	Q6UDR6	99 aa		3.71	□□□□□ -1.82
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		3.71	□□□□□ -1.82
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		3.69	□□□□□ -1.82
SKAP2-209	ENST00000497511		K7ERU9	68 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SKAP2-209	ENST00000497511		J3QR89	54 aa		3.65	□□□□□ -1.83
SKAP2-209	ENST00000497511	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		3.65	□□□□□ -1.83
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP12-4	P60329	112 aa		3.62	□□□□□ -1.83
SKAP2-209	ENST00000497511	SEC61G	P60059	68 aa		3.61	□□□□□ -1.83
SKAP2-209	ENST00000497511	SPATA8	Q6RVD6	105 aa		3.6	□□□□□ -1.83
SKAP2-209	ENST00000497511	SERP1	Q9Y6X1	66 aa		3.6	□□□□□ -1.83
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP12-1	P59990	96 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SKAP2-209	ENST00000497511	TNP1	P09430	55 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SKAP2-209	ENST00000497511	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
SKAP2-209	ENST00000497511	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1B0GU33	70 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SKAP2-209	ENST00000497511	SMIM20	Q8N5G0	67 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SKAP2-209	ENST00000497511	SNURF	Q9Y675	71 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SKAP2-209	ENST00000497511	SPANXA2-OT1	Q8N9U9	137 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP12-3	P60328	96 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SKAP2-209	ENST00000497511	MUC5AC	P98088	5654 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SKAP2-209	ENST00000497511	SMIM26	A0A096LP01	95 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SKAP2-209	ENST00000497511	COA5	Q86WW8	74 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SKAP2-209	ENST00000497511	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	3.45	□□□□□ -1.86
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP5-8	O75690	187 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SKAP2-209	ENST00000497511	SERP2	Q8N6R1	65 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1B0GU69	56 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SKAP2-209	ENST00000497511	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SKAP2-209	ENST00000497511	COX7C	P15954	63 aa		3.27	□□□□□ -1.89
SKAP2-209	ENST00000497511	MT1A	P04731	61 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC179	H3BU77	68 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM258	P61165	79 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SKAP2-209	ENST00000497511	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SKAP2-209	ENST00000497511		H7BZZ5	65 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SKAP2-209	ENST00000497511	PRR15L	Q9BU68	103 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SKAP2-209	ENST00000497511	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SKAP2-209	ENST00000497511	UQCR11	O14957	56 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SKAP2-209	ENST00000497511		V9GYY9	64 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SKAP2-209	ENST00000497511		K7ERS5	55 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SKAP2-209	ENST00000497511		Q1T7F1	81 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SKAP2-209	ENST00000497511	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SKAP2-209	ENST00000497511	PRO0628	Q9UI54	55 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SKAP2-209	ENST00000497511	PSPHP1	O15172	72 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SKAP2-209	ENST00000497511	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SKAP2-209	ENST00000497511		A6NED7	52 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SKAP2-209	ENST00000497511	BRK1	Q8WUW1	75 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SKAP2-209	ENST00000497511	ROMO1	P60602	79 aa		2.63	□□□□□ -1.99
SKAP2-209	ENST00000497511	PMAIP1	Q13794	54 aa		2.63	□□□□□ -1.99
SKAP2-209	ENST00000497511	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		2.55	□□□□□ -2
SKAP2-209	ENST00000497511	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.4	□□□□□ -2.03
SKAP2-209	ENST00000497511	LUZP6	Q538Z0	58 aa		2.12	□□□□□ -2.07
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		1.82	□□□□□ -2.12
SKAP2-209	ENST00000497511	INE1	O15225	51 aa		1.74	□□□□□ -2.13
SKAP2-209	ENST00000497511	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.4	□□□□□ -2.19
SKAP2-209	ENST00000497511	PRM1	P04553	51 aa		1.32	□□□□□ -2.2

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