RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493436.5

SH3BP4-211, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 481 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-211ENST00000493436 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4-211ENST00000493436 LCE1DQ5T752 114 aa5.77□□□□□ -1.49
SH3BP4-211ENST00000493436 LCE4AQ5TA78 99 aa5.77□□□□□ -1.49
SH3BP4-211ENST00000493436 KRTAP12-3P60328 96 aa5.76□□□□□ -1.49
SH3BP4-211ENST00000493436 MIR22HGQ0VDD5 57 aa5.76□□□□□ -1.49
SH3BP4-211ENST00000493436 MT4P47944 62 aa5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4-211ENST00000493436 GPR98Q8WXG9 6306 aa5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4-211ENST00000493436 K7ERS5 55 aa5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4-211ENST00000493436 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4-211ENST00000493436 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4-211ENST00000493436 PSPHP1O15172 72 aa5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4-211ENST00000493436 V9GYY9 64 aa5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4-211ENST00000493436 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4-211ENST00000493436 HMCN1Q96RW7 5635 aa5.61□□□□□ -1.51
SH3BP4-211ENST00000493436 Q1T7F1 81 aa5.61□□□□□ -1.51
SH3BP4-211ENST00000493436 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4-211ENST00000493436 SVIPQ8NHG7 77 aa5.47□□□□□ -1.53
SH3BP4-211ENST00000493436 A6NED7 52 aa5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4-211ENST00000493436 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.45□□□□□ -1.54
SH3BP4-211ENST00000493436 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa5.44□□□□□ -1.54
SH3BP4-211ENST00000493436 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4-211ENST00000493436 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4-211ENST00000493436 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4-211ENST00000493436 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.37□□□□□ -1.55
SH3BP4-211ENST00000493436 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.36□□□□□ -1.55
SH3BP4-211ENST00000493436 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4-211ENST00000493436 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4-211ENST00000493436 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4-211ENST00000493436 KRTAP12-4P60329 112 aa5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4-211ENST00000493436 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4-211ENST00000493436 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4-211ENST00000493436 ROMO1P60602 79 aa5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4-211ENST00000493436 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4-211ENST00000493436 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.57
SH3BP4-211ENST00000493436 PCP4P48539 62 aa5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4-211ENST00000493436 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4-211ENST00000493436 MT1AP04731 61 aa5.07□□□□□ -1.6
SH3BP4-211ENST00000493436 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.04□□□□□ -1.6
SH3BP4-211ENST00000493436 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5□□□□□ -1.61
SH3BP4-211ENST00000493436 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4-211ENST00000493436 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4-211ENST00000493436 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.88□□□□□ -1.63
SH3BP4-211ENST00000493436 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.82□□□□□ -1.64
SH3BP4-211ENST00000493436 KRTAP5-8O75690 187 aa4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4-211ENST00000493436 H3BS24 57 aa4.65□□□□□ -1.67
SH3BP4-211ENST00000493436 BRK1Q8WUW1 75 aa4.65□□□□□ -1.67
SH3BP4-211ENST00000493436 MT3P25713 68 aa4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4-211ENST00000493436 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4-211ENST00000493436 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.48□□□□□ -1.69
SH3BP4-211ENST00000493436 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
SH3BP4-211ENST00000493436 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
SH3BP4-211ENST00000493436 MUC5ACP98088 5654 aa4.44□□□□□ -1.7
SH3BP4-211ENST00000493436 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.44□□□□□ -1.7
SH3BP4-211ENST00000493436 PMAIP1Q13794 54 aa4.36□□□□□ -1.71
SH3BP4-211ENST00000493436 LCE1EQ5T753 118 aa4.25□□□□□ -1.73
SH3BP4-211ENST00000493436 PRAC1Q96KF2 57 aa4.23□□□□□ -1.73
SH3BP4-211ENST00000493436 PRO0628Q9UI54 55 aa4.09□□□□□ -1.75
SH3BP4-211ENST00000493436 A0A0A0MQY5 61 aa4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4-211ENST00000493436 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.03□□□□□ -1.76
SH3BP4-211ENST00000493436 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.02□□□□□ -1.77
SH3BP4-211ENST00000493436 LCE1CQ5T751 118 aa3.94□□□□□ -1.78
SH3BP4-211ENST00000493436 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.82□□□□□ -1.8
SH3BP4-211ENST00000493436 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.81□□□□□ -1.8
SH3BP4-211ENST00000493436 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.66□□□□□ -1.82
SH3BP4-211ENST00000493436 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.6□□□□□ -1.83
SH3BP4-211ENST00000493436 LUZP6Q538Z0 58 aa3.58□□□□□ -1.84
SH3BP4-211ENST00000493436 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
SH3BP4-211ENST00000493436 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.57□□□□□ -1.84
SH3BP4-211ENST00000493436 LCE1FQ5T754 118 aa3.48□□□□□ -1.85
SH3BP4-211ENST00000493436 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.31□□□□□ -1.88
SH3BP4-211ENST00000493436 PHGR1C9JFL3 82 aa3.13□□□□□ -1.91
SH3BP4-211ENST00000493436 NDUFAF8A1L188 74 aa3.11□□□□□ -1.91
SH3BP4-211ENST00000493436 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.06□□□□□ -1.92
SH3BP4-211ENST00000493436 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.86□□□□□ -1.95
SH3BP4-211ENST00000493436 PRM1P04553 51 aa2.7□□□□□ -1.98
SH3BP4-211ENST00000493436 INE1O15225 51 aa2.61□□□□□ -1.99
SH3BP4-211ENST00000493436 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.37□□□□□ -2.03
SH3BP4-211ENST00000493436 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.08□□□□□ -2.08
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