RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491139.5

NELFE-210, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-210ENST00000491139 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa7.45□□□□□ -1.22
NELFE-210ENST00000491139 MT1MQ8N339 61 aa7.45□□□□□ -1.22
NELFE-210ENST00000491139 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa7.43□□□□□ -1.22
NELFE-210ENST00000491139 A8MU10 97 aa7.42□□□□□ -1.22
NELFE-210ENST00000491139 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa7.4□□□□□ -1.22
NELFE-210ENST00000491139 MT1LQ93083 61 aa7.34□□□□□ -1.23
NELFE-210ENST00000491139 UQCR11O14957 56 aa7.32□□□□□ -1.24
NELFE-210ENST00000491139 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa7.32□□□□□ -1.24
NELFE-210ENST00000491139 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa7.3□□□□□ -1.24
NELFE-210ENST00000491139 V9GYY9 64 aa7.27□□□□□ -1.25
NELFE-210ENST00000491139 Q1T7F1 81 aa7.21□□□□□ -1.26
NELFE-210ENST00000491139 C10orf95Q9H7T3 257 aa7.18□□□□□ -1.26
NELFE-210ENST00000491139 TNP1P09430 55 aa7.15□□□□□ -1.26
NELFE-210ENST00000491139 MIR22HGQ0VDD5 57 aa7.15□□□□□ -1.26
NELFE-210ENST00000491139 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa7.12□□□□□ -1.27
NELFE-210ENST00000491139 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa7.08□□□□□ -1.28
NELFE-210ENST00000491139 PSPHP1O15172 72 aa7.07□□□□□ -1.28
NELFE-210ENST00000491139 PCP4P48539 62 aa7.04□□□□□ -1.28
NELFE-210ENST00000491139 RPS28P62857 69 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
NELFE-210ENST00000491139 LCE3AQ5TA76 89 aa7.01□□□□□ -1.29
NELFE-210ENST00000491139 K7ERS5 55 aa7□□□□□ -1.29
NELFE-210ENST00000491139 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.95□□□□□ -1.3
NELFE-210ENST00000491139 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.9□□□□□ -1.3
NELFE-210ENST00000491139 A6NED7 52 aa6.89□□□□□ -1.31
NELFE-210ENST00000491139 KRTAP12-4P60329 112 aa6.89□□□□□ -1.31
NELFE-210ENST00000491139 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
NELFE-210ENST00000491139 KRTAP12-3P60328 96 aa6.78□□□□□ -1.32
NELFE-210ENST00000491139 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.76□□□□□ -1.33
NELFE-210ENST00000491139 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.72□□□□□ -1.33
NELFE-210ENST00000491139 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
NELFE-210ENST00000491139 H3BS24 57 aa6.71□□□□□ -1.34
NELFE-210ENST00000491139 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.67□□□□□ -1.34
NELFE-210ENST00000491139 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.62□□□□□ -1.35
NELFE-210ENST00000491139 ROMO1P60602 79 aa6.56□□□□□ -1.36
NELFE-210ENST00000491139 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.55□□□□□ -1.36
NELFE-210ENST00000491139 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
NELFE-210ENST00000491139 MUC5ACP98088 5654 aa6.47□□□□□ -1.37
NELFE-210ENST00000491139 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.41□□□□□ -1.38
NELFE-210ENST00000491139 KRTAP5-2Q701N4 177 aa6.41□□□□□ -1.38
NELFE-210ENST00000491139 KRTAP5-8O75690 187 aa6.4□□□□□ -1.38
NELFE-210ENST00000491139 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
NELFE-210ENST00000491139 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.25□□□□□ -1.41
NELFE-210ENST00000491139 OBSCNQ5VST9 7968 aa6.25□□□□□ -1.41
NELFE-210ENST00000491139 MT1AP04731 61 aa6.23□□□□□ -1.41
NELFE-210ENST00000491139 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa6.23□□□□□ -1.41
NELFE-210ENST00000491139 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.2□□□□□ -1.42
NELFE-210ENST00000491139 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa6.19□□□□□ -1.42
NELFE-210ENST00000491139 BRK1Q8WUW1 75 aa6.12□□□□□ -1.43
NELFE-210ENST00000491139 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.09□□□□□ -1.43
NELFE-210ENST00000491139 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa6.08□□□□□ -1.44
NELFE-210ENST00000491139 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.88□□□□□ -1.47
NELFE-210ENST00000491139 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa5.87□□□□□ -1.47
NELFE-210ENST00000491139 MT3P25713 68 aa5.75□□□□□ -1.49
NELFE-210ENST00000491139 PMAIP1Q13794 54 aa5.75□□□□□ -1.49
NELFE-210ENST00000491139 PRO0628Q9UI54 55 aa5.55□□□□□ -1.52
NELFE-210ENST00000491139 PRAC1Q96KF2 57 aa5.47□□□□□ -1.53
NELFE-210ENST00000491139 LCE1EQ5T753 118 aa5.42□□□□□ -1.54
NELFE-210ENST00000491139 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.29□□□□□ -1.56
NELFE-210ENST00000491139 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.28□□□□□ -1.56
NELFE-210ENST00000491139 LCE1BQ5T7P3 118 aa5.16□□□□□ -1.58
NELFE-210ENST00000491139 LCE1CQ5T751 118 aa5.02□□□□□ -1.61
NELFE-210ENST00000491139 SVIPQ8NHG7 77 aa4.95□□□□□ -1.62
NELFE-210ENST00000491139 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.66□□□□□ -1.66
NELFE-210ENST00000491139 LUZP6Q538Z0 58 aa4.65□□□□□ -1.67
NELFE-210ENST00000491139 LCE1FQ5T754 118 aa4.62□□□□□ -1.67
NELFE-210ENST00000491139 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.54□□□□□ -1.68
NELFE-210ENST00000491139 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
NELFE-210ENST00000491139 PHGR1C9JFL3 82 aa4.48□□□□□ -1.69
NELFE-210ENST00000491139 A0A0A0MQY5 61 aa4.43□□□□□ -1.7
NELFE-210ENST00000491139 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.31□□□□□ -1.72
NELFE-210ENST00000491139 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.1□□□□□ -1.75
NELFE-210ENST00000491139 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.88□□□□□ -1.79
NELFE-210ENST00000491139 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.87□□□□□ -1.79
NELFE-210ENST00000491139 NDUFAF8A1L188 74 aa3.84□□□□□ -1.79
NELFE-210ENST00000491139 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3.41□□□□□ -1.86
NELFE-210ENST00000491139 PRM1P04553 51 aa3.33□□□□□ -1.88
NELFE-210ENST00000491139 INE1O15225 51 aa3.22□□□□□ -1.89
NELFE-210ENST00000491139 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.67□□□□□ -1.98
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