RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489344.5

RBM3-208, Transcript of RNA binding motif protein 3, human

TSL 2

Gene RBM3, Length 724 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM3-208	ENST00000489344	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
RBM3-208	ENST00000489344		Q1T7F1	81 aa		5.46	□□□□□ -1.54
RBM3-208	ENST00000489344	SPINT4	Q6UDR6	99 aa		5.46	□□□□□ -1.54
RBM3-208	ENST00000489344		A8MU10	97 aa		5.45	□□□□□ -1.54
RBM3-208	ENST00000489344	CAMK2N1	Q7Z7J9	78 aa		5.45	□□□□□ -1.54
RBM3-208	ENST00000489344	KRTAP12-1	P59990	96 aa		5.44	□□□□□ -1.54
RBM3-208	ENST00000489344	UQCR11	O14957	56 aa		5.43	□□□□□ -1.54
RBM3-208	ENST00000489344	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		5.42	□□□□□ -1.54
RBM3-208	ENST00000489344	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		5.4	□□□□□ -1.54
RBM3-208	ENST00000489344	PSPHP1	O15172	72 aa		5.4	□□□□□ -1.54
RBM3-208	ENST00000489344	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		5.33	□□□□□ -1.56
RBM3-208	ENST00000489344	MT4	P47944	62 aa		5.28	□□□□□ -1.56
RBM3-208	ENST00000489344	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		5.28	□□□□□ -1.56
RBM3-208	ENST00000489344	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		5.24	□□□□□ -1.57
RBM3-208	ENST00000489344		A6NED7	52 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RBM3-208	ENST00000489344	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RBM3-208	ENST00000489344		K7ERS5	55 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBM3-208	ENST00000489344	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBM3-208	ENST00000489344	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		5.16	□□□□□ -1.58
RBM3-208	ENST00000489344	MT1E	P04732	61 aa		5.15	□□□□□ -1.59
RBM3-208	ENST00000489344	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RBM3-208	ENST00000489344	TNP1	P09430	55 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RBM3-208	ENST00000489344	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM3-208	ENST00000489344	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RBM3-208	ENST00000489344	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RBM3-208	ENST00000489344	MT1G	P13640	62 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RBM3-208	ENST00000489344	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RBM3-208	ENST00000489344	PP632	Q6XCG6	107 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM3-208	ENST00000489344	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM3-208	ENST00000489344	LCE3A	Q5TA76	89 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM3-208	ENST00000489344	MT1M	Q8N339	61 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM3-208	ENST00000489344	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM3-208	ENST00000489344	ROMO1	P60602	79 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM3-208	ENST00000489344	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM3-208	ENST00000489344	BRK1	Q8WUW1	75 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM3-208	ENST00000489344	MT1L	Q93083	61 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM3-208	ENST00000489344	KRTAP12-3	P60328	96 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RBM3-208	ENST00000489344	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RBM3-208	ENST00000489344	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RBM3-208	ENST00000489344	KRTAP12-4	P60329	112 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM3-208	ENST00000489344	SVIP	Q8NHG7	77 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM3-208	ENST00000489344	PMAIP1	Q13794	54 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM3-208	ENST00000489344	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RBM3-208	ENST00000489344	MUC5AC	P98088	5654 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM3-208	ENST00000489344	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
RBM3-208	ENST00000489344	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
RBM3-208	ENST00000489344	PRO0628	Q9UI54	55 aa		4.47	□□□□□ -1.69
RBM3-208	ENST00000489344	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		4.44	□□□□□ -1.7
RBM3-208	ENST00000489344	KRTAP5-8	O75690	187 aa		4.39	□□□□□ -1.71
RBM3-208	ENST00000489344	PRAC1	Q96KF2	57 aa		4.31	□□□□□ -1.72
RBM3-208	ENST00000489344	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		4.29	□□□□□ -1.72
RBM3-208	ENST00000489344	MT3	P25713	68 aa		4.27	□□□□□ -1.73
RBM3-208	ENST00000489344		A0A0A0MQY5	61 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RBM3-208	ENST00000489344	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RBM3-208	ENST00000489344	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBM3-208	ENST00000489344	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RBM3-208	ENST00000489344	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RBM3-208	ENST00000489344	MT1A	P04731	61 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM3-208	ENST00000489344	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RBM3-208	ENST00000489344	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.96	□□□□□ -1.78
RBM3-208	ENST00000489344	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RBM3-208	ENST00000489344	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RBM3-208	ENST00000489344	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.69	□□□□□ -1.82
RBM3-208	ENST00000489344	NDUFAF8	A1L188	74 aa		3.63	□□□□□ -1.83
RBM3-208	ENST00000489344	LUZP6	Q538Z0	58 aa		3.61	□□□□□ -1.83
RBM3-208	ENST00000489344	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RBM3-208	ENST00000489344	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.47	□□□□□ -1.85
RBM3-208	ENST00000489344	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.32	□□□□□ -1.88
RBM3-208	ENST00000489344	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3.27	□□□□□ -1.89
RBM3-208	ENST00000489344	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RBM3-208	ENST00000489344	PHGR1	C9JFL3	82 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RBM3-208	ENST00000489344	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3	□□□□□ -1.93
RBM3-208	ENST00000489344	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.71	□□□□□ -1.98
RBM3-208	ENST00000489344	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.63	□□□□□ -1.99
RBM3-208	ENST00000489344	INE1	O15225	51 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RBM3-208	ENST00000489344	PRM1	P04553	51 aa		2.51	□□□□□ -2.01
RBM3-208	ENST00000489344	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.36	□□□□□ -2.03
RBM3-208	ENST00000489344	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.87	□□□□□ -2.11

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