RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486418.5

TIMMDC1-205, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene TIMMDC1, Length 551 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1-205ENST00000486418 V9GYY9 64 aa5.34□□□□□ -1.55
TIMMDC1-205ENST00000486418 K7ERS5 55 aa5.3□□□□□ -1.56
TIMMDC1-205ENST00000486418 PSPHP1O15172 72 aa5.29□□□□□ -1.56
TIMMDC1-205ENST00000486418 Q1T7F1 81 aa5.29□□□□□ -1.56
TIMMDC1-205ENST00000486418 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.27□□□□□ -1.57
TIMMDC1-205ENST00000486418 KRTAP12-3P60328 96 aa5.26□□□□□ -1.57
TIMMDC1-205ENST00000486418 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.24□□□□□ -1.57
TIMMDC1-205ENST00000486418 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.22□□□□□ -1.57
TIMMDC1-205ENST00000486418 LCE4AQ5TA78 99 aa5.19□□□□□ -1.58
TIMMDC1-205ENST00000486418 LCE1DQ5T752 114 aa5.15□□□□□ -1.59
TIMMDC1-205ENST00000486418 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.13□□□□□ -1.59
TIMMDC1-205ENST00000486418 A6NED7 52 aa5.12□□□□□ -1.59
TIMMDC1-205ENST00000486418 MT4P47944 62 aa5.11□□□□□ -1.59
TIMMDC1-205ENST00000486418 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa5.07□□□□□ -1.6
TIMMDC1-205ENST00000486418 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.06□□□□□ -1.6
TIMMDC1-205ENST00000486418 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1-205ENST00000486418 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.02□□□□□ -1.61
TIMMDC1-205ENST00000486418 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa4.99□□□□□ -1.61
TIMMDC1-205ENST00000486418 PCP4P48539 62 aa4.98□□□□□ -1.61
TIMMDC1-205ENST00000486418 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.96□□□□□ -1.62
TIMMDC1-205ENST00000486418 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.95□□□□□ -1.62
TIMMDC1-205ENST00000486418 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.93□□□□□ -1.62
TIMMDC1-205ENST00000486418 ROMO1P60602 79 aa4.92□□□□□ -1.62
TIMMDC1-205ENST00000486418 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.9□□□□□ -1.63
TIMMDC1-205ENST00000486418 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
TIMMDC1-205ENST00000486418 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.86□□□□□ -1.63
TIMMDC1-205ENST00000486418 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.85□□□□□ -1.63
TIMMDC1-205ENST00000486418 KRTAP12-4P60329 112 aa4.81□□□□□ -1.64
TIMMDC1-205ENST00000486418 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa4.79□□□□□ -1.64
TIMMDC1-205ENST00000486418 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.78□□□□□ -1.64
TIMMDC1-205ENST00000486418 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa4.75□□□□□ -1.65
TIMMDC1-205ENST00000486418 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.73□□□□□ -1.65
TIMMDC1-205ENST00000486418 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.67□□□□□ -1.66
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TIMMDC1-205ENST00000486418 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.68
TIMMDC1-205ENST00000486418 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.57□□□□□ -1.68
TIMMDC1-205ENST00000486418 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.55□□□□□ -1.68
TIMMDC1-205ENST00000486418 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.54□□□□□ -1.68
TIMMDC1-205ENST00000486418 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.46□□□□□ -1.7
TIMMDC1-205ENST00000486418 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.44□□□□□ -1.7
TIMMDC1-205ENST00000486418 BRK1Q8WUW1 75 aa4.42□□□□□ -1.7
TIMMDC1-205ENST00000486418 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.37□□□□□ -1.71
TIMMDC1-205ENST00000486418 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.35□□□□□ -1.71
TIMMDC1-205ENST00000486418 MT3P25713 68 aa4.23□□□□□ -1.73
TIMMDC1-205ENST00000486418 KRTAP5-8O75690 187 aa4.21□□□□□ -1.74
TIMMDC1-205ENST00000486418 PMAIP1Q13794 54 aa4.18□□□□□ -1.74
TIMMDC1-205ENST00000486418 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.06□□□□□ -1.76
TIMMDC1-205ENST00000486418 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-205ENST00000486418 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.98□□□□□ -1.77
TIMMDC1-205ENST00000486418 PRAC1Q96KF2 57 aa3.98□□□□□ -1.77
TIMMDC1-205ENST00000486418 PRO0628Q9UI54 55 aa3.94□□□□□ -1.78
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TIMMDC1-205ENST00000486418 MUC5ACP98088 5654 aa3.87□□□□□ -1.79
TIMMDC1-205ENST00000486418 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
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TIMMDC1-205ENST00000486418 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.66□□□□□ -1.82
TIMMDC1-205ENST00000486418 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.63□□□□□ -1.83
TIMMDC1-205ENST00000486418 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.61□□□□□ -1.83
TIMMDC1-205ENST00000486418 LCE1CQ5T751 118 aa3.57□□□□□ -1.84
TIMMDC1-205ENST00000486418 SVIPQ8NHG7 77 aa3.53□□□□□ -1.84
TIMMDC1-205ENST00000486418 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.52□□□□□ -1.85
TIMMDC1-205ENST00000486418 LUZP6Q538Z0 58 aa3.41□□□□□ -1.86
TIMMDC1-205ENST00000486418 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.33□□□□□ -1.88
TIMMDC1-205ENST00000486418 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.28□□□□□ -1.88
TIMMDC1-205ENST00000486418 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
TIMMDC1-205ENST00000486418 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.21□□□□□ -1.9
TIMMDC1-205ENST00000486418 LCE1FQ5T754 118 aa3.15□□□□□ -1.91
TIMMDC1-205ENST00000486418 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.99□□□□□ -1.93
TIMMDC1-205ENST00000486418 NDUFAF8A1L188 74 aa2.8□□□□□ -1.96
TIMMDC1-205ENST00000486418 PHGR1C9JFL3 82 aa2.78□□□□□ -1.96
TIMMDC1-205ENST00000486418 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.75□□□□□ -1.97
TIMMDC1-205ENST00000486418 A0A0A0MQY5 61 aa2.51□□□□□ -2.01
TIMMDC1-205ENST00000486418 PRM1P04553 51 aa2.5□□□□□ -2.01
TIMMDC1-205ENST00000486418 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.5□□□□□ -2.01
TIMMDC1-205ENST00000486418 INE1O15225 51 aa2.37□□□□□ -2.03
TIMMDC1-205ENST00000486418 H3BS24 57 aa2.32□□□□□ -2.04
TIMMDC1-205ENST00000486418 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.11□□□□□ -2.07
TIMMDC1-205ENST00000486418 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.81□□□□□ -2.12
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