RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477486.1

RBMS1-211, Transcript of RNA binding motif single stranded interacting protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene RBMS1, Length 562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBMS1-211ENST00000477486 PRR15LQ9BU68 103 aa7.71□□□□□ -1.18
RBMS1-211ENST00000477486 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa7.67□□□□□ -1.18
RBMS1-211ENST00000477486 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa7.61□□□□□ -1.19
RBMS1-211ENST00000477486 CCDC179H3BU77 68 aa7.58□□□□□ -1.2
RBMS1-211ENST00000477486 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
RBMS1-211ENST00000477486 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa7.51□□□□□ -1.21
RBMS1-211ENST00000477486 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa7.5□□□□□ -1.21
RBMS1-211ENST00000477486 HMCN1Q96RW7 5635 aa7.49□□□□□ -1.21
RBMS1-211ENST00000477486 KRTAP12-3P60328 96 aa7.49□□□□□ -1.21
RBMS1-211ENST00000477486 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.44□□□□□ -1.22
RBMS1-211ENST00000477486 UQCR11O14957 56 aa7.42□□□□□ -1.22
RBMS1-211ENST00000477486 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa7.42□□□□□ -1.22
RBMS1-211ENST00000477486 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa7.42□□□□□ -1.22
RBMS1-211ENST00000477486 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa7.28□□□□□ -1.24
RBMS1-211ENST00000477486 TMEM258P61165 79 aa7.27□□□□□ -1.25
RBMS1-211ENST00000477486 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa7.25□□□□□ -1.25
RBMS1-211ENST00000477486 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa7.24□□□□□ -1.25
RBMS1-211ENST00000477486 MIR22HGQ0VDD5 57 aa7.23□□□□□ -1.25
RBMS1-211ENST00000477486 K7ERS5 55 aa7.2□□□□□ -1.26
RBMS1-211ENST00000477486 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa7.13□□□□□ -1.27
RBMS1-211ENST00000477486 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RBMS1-211ENST00000477486 KRTAP12-4P60329 112 aa7.11□□□□□ -1.27
RBMS1-211ENST00000477486 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa7.11□□□□□ -1.27
RBMS1-211ENST00000477486 H3BS24 57 aa7.1□□□□□ -1.27
RBMS1-211ENST00000477486 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa7.08□□□□□ -1.28
RBMS1-211ENST00000477486 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa7.02□□□□□ -1.29
RBMS1-211ENST00000477486 PSPHP1O15172 72 aa7.01□□□□□ -1.29
RBMS1-211ENST00000477486 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa7.01□□□□□ -1.29
RBMS1-211ENST00000477486 V9GYY9 64 aa6.97□□□□□ -1.29
RBMS1-211ENST00000477486 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.94□□□□□ -1.3
RBMS1-211ENST00000477486 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.91□□□□□ -1.3
RBMS1-211ENST00000477486 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.87□□□□□ -1.31
RBMS1-211ENST00000477486 Q1T7F1 81 aa6.86□□□□□ -1.31
RBMS1-211ENST00000477486 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
RBMS1-211ENST00000477486 A6NED7 52 aa6.77□□□□□ -1.33
RBMS1-211ENST00000477486 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa6.77□□□□□ -1.33
RBMS1-211ENST00000477486 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.75□□□□□ -1.33
RBMS1-211ENST00000477486 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.65□□□□□ -1.34
RBMS1-211ENST00000477486 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RBMS1-211ENST00000477486 MT1AP04731 61 aa6.63□□□□□ -1.35
RBMS1-211ENST00000477486 ROMO1P60602 79 aa6.61□□□□□ -1.35
RBMS1-211ENST00000477486 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa6.61□□□□□ -1.35
RBMS1-211ENST00000477486 KRTAP5-2Q701N4 177 aa6.52□□□□□ -1.37
RBMS1-211ENST00000477486 SVIPQ8NHG7 77 aa6.5□□□□□ -1.37
RBMS1-211ENST00000477486 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa6.43□□□□□ -1.38
RBMS1-211ENST00000477486 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa6.38□□□□□ -1.39
RBMS1-211ENST00000477486 KRTAP5-8O75690 187 aa6.32□□□□□ -1.4
RBMS1-211ENST00000477486 OBSCNQ5VST9 7968 aa6.18□□□□□ -1.42
RBMS1-211ENST00000477486 MT3P25713 68 aa6.12□□□□□ -1.43
RBMS1-211ENST00000477486 MUC5ACP98088 5654 aa6.03□□□□□ -1.44
RBMS1-211ENST00000477486 PCP4P48539 62 aa6□□□□□ -1.45
RBMS1-211ENST00000477486 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
RBMS1-211ENST00000477486 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
RBMS1-211ENST00000477486 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa5.9□□□□□ -1.46
RBMS1-211ENST00000477486 LCE1EQ5T753 118 aa5.61□□□□□ -1.51
RBMS1-211ENST00000477486 BRK1Q8WUW1 75 aa5.57□□□□□ -1.52
RBMS1-211ENST00000477486 A0A0A0MQY5 61 aa5.43□□□□□ -1.54
RBMS1-211ENST00000477486 LCE1BQ5T7P3 118 aa5.4□□□□□ -1.54
RBMS1-211ENST00000477486 PMAIP1Q13794 54 aa5.22□□□□□ -1.57
RBMS1-211ENST00000477486 LCE1CQ5T751 118 aa5.21□□□□□ -1.58
RBMS1-211ENST00000477486 PRAC1Q96KF2 57 aa5.07□□□□□ -1.6
RBMS1-211ENST00000477486 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.94□□□□□ -1.62
RBMS1-211ENST00000477486 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.71□□□□□ -1.66
RBMS1-211ENST00000477486 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
RBMS1-211ENST00000477486 LCE1FQ5T754 118 aa4.64□□□□□ -1.67
RBMS1-211ENST00000477486 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.62□□□□□ -1.67
RBMS1-211ENST00000477486 PRO0628Q9UI54 55 aa4.52□□□□□ -1.69
RBMS1-211ENST00000477486 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.41□□□□□ -1.7
RBMS1-211ENST00000477486 LUZP6Q538Z0 58 aa4.4□□□□□ -1.71
RBMS1-211ENST00000477486 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.33□□□□□ -1.72
RBMS1-211ENST00000477486 PHGR1C9JFL3 82 aa4.31□□□□□ -1.72
RBMS1-211ENST00000477486 NDUFAF8A1L188 74 aa4.25□□□□□ -1.73
RBMS1-211ENST00000477486 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.07□□□□□ -1.76
RBMS1-211ENST00000477486 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.8□□□□□ -1.8
RBMS1-211ENST00000477486 PRM1P04553 51 aa3.37□□□□□ -1.87
RBMS1-211ENST00000477486 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3.26□□□□□ -1.89
RBMS1-211ENST00000477486 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.72□□□□□ -1.97
RBMS1-211ENST00000477486 INE1O15225 51 aa2.48□□□□□ -2.01
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 269 ms