RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436289.6

NELFE-204, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 5

Gene NELFE, Length 906 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-204ENST00000436289 DMAC1Q96GE9 116 aa5.32□□□□□ -1.56
NELFE-204ENST00000436289 PMAIP1Q13794 54 aa5.31□□□□□ -1.56
NELFE-204ENST00000436289 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa5.3□□□□□ -1.56
NELFE-204ENST00000436289 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa5.3□□□□□ -1.56
NELFE-204ENST00000436289 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa5.29□□□□□ -1.56
NELFE-204ENST00000436289 PRR15LQ9BU68 103 aa5.28□□□□□ -1.56
NELFE-204ENST00000436289 A0A0D9SG42 100 aa5.24□□□□□ -1.57
NELFE-204ENST00000436289 MT1LQ93083 61 aa5.24□□□□□ -1.57
NELFE-204ENST00000436289 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.24□□□□□ -1.57
NELFE-204ENST00000436289 A6NED7 52 aa5.23□□□□□ -1.57
NELFE-204ENST00000436289 SEC61GP60059 68 aa5.22□□□□□ -1.57
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NELFE-204ENST00000436289 ACYP2P14621 99 aa5.21□□□□□ -1.58
NELFE-204ENST00000436289 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.18□□□□□ -1.58
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NELFE-204ENST00000436289 KRTAP12-4P60329 112 aa5.1□□□□□ -1.59
NELFE-204ENST00000436289 A8MU10 97 aa5.09□□□□□ -1.59
NELFE-204ENST00000436289 A0A1B0GU69 56 aa5.05□□□□□ -1.6
NELFE-204ENST00000436289 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa5.04□□□□□ -1.6
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NELFE-204ENST00000436289 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
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NELFE-204ENST00000436289 C10orf95Q9H7T3 257 aa4.95□□□□□ -1.62
NELFE-204ENST00000436289 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.91□□□□□ -1.62
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NELFE-204ENST00000436289 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
NELFE-204ENST00000436289 H3BS24 57 aa4.88□□□□□ -1.63
NELFE-204ENST00000436289 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.88□□□□□ -1.63
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NELFE-204ENST00000436289 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
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NELFE-204ENST00000436289 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.7□□□□□ -1.66
NELFE-204ENST00000436289 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa4.64□□□□□ -1.67
NELFE-204ENST00000436289 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.6□□□□□ -1.67
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NELFE-204ENST00000436289 ROMO1P60602 79 aa4.56□□□□□ -1.68
NELFE-204ENST00000436289 MT1AP04731 61 aa4.47□□□□□ -1.69
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NELFE-204ENST00000436289 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.3□□□□□ -1.72
NELFE-204ENST00000436289 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.23□□□□□ -1.73
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NELFE-204ENST00000436289 A0A0A0MQY5 61 aa3.8□□□□□ -1.8
NELFE-204ENST00000436289 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.73□□□□□ -1.81
NELFE-204ENST00000436289 LCE1CQ5T751 118 aa3.7□□□□□ -1.82
NELFE-204ENST00000436289 LCE1FQ5T754 118 aa3.5□□□□□ -1.85
NELFE-204ENST00000436289 INE1O15225 51 aa3.49□□□□□ -1.85
NELFE-204ENST00000436289 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.49□□□□□ -1.85
NELFE-204ENST00000436289 PHGR1C9JFL3 82 aa3.4□□□□□ -1.87
NELFE-204ENST00000436289 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
NELFE-204ENST00000436289 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.99□□□□□ -1.93
NELFE-204ENST00000436289 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.95□□□□□ -1.94
NELFE-204ENST00000436289 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.84□□□□□ -1.95
NELFE-204ENST00000436289 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.73□□□□□ -1.97
NELFE-204ENST00000436289 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.71□□□□□ -1.98
NELFE-204ENST00000436289 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.64□□□□□ -1.99
NELFE-204ENST00000436289 PRM1P04553 51 aa2.36□□□□□ -2.03
NELFE-204ENST00000436289 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.99□□□□□ -2.09
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