RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384546.1

RNU6-1160P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1160, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1160P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1160P-201ENST00000384546 PEG3Q9GZU2 1588 aa-8.8□□□□□ -3.82
RNU6-1160P-201ENST00000384546 DUOX2Q9NRD8 1548 aa-8.81□□□□□ -3.82
RNU6-1160P-201ENST00000384546 TFF3Q07654 80 aa-8.83□□□□□ -3.82
RNU6-1160P-201ENST00000384546 CENPFP49454 3210 aa-8.84□□□□□ -3.82
RNU6-1160P-201ENST00000384546 UGGT1Q9NYU2 1555 aa-8.84□□□□□ -3.82
RNU6-1160P-201ENST00000384546 DEFB133Q30KQ1 61 aa-8.91□□□□□ -3.84
RNU6-1160P-201ENST00000384546 SMIM2Q9BVW6 85 aa-8.91□□□□□ -3.84
RNU6-1160P-201ENST00000384546 VCANP13611 3396 aa-8.95□□□□□ -3.84
RNU6-1160P-201ENST00000384546 IQGAP3Q86VI3 1631 aa-8.96□□□□□ -3.84
RNU6-1160P-201ENST00000384546 AGLP35573 1532 aa-8.96□□□□□ -3.84
RNU6-1160P-201ENST00000384546 BRCA2P51587 3418 aa-9□□□□□ -3.85
RNU6-1160P-201ENST00000384546 CDH23Q9H251 3354 aa-9.05□□□□□ -3.86
RNU6-1160P-201ENST00000384546 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa-9.08□□□□□ -3.86
RNU6-1160P-201ENST00000384546 CCDC18Q5T9S5 1454 aa-9.15□□□□□ -3.87
RNU6-1160P-201ENST00000384546 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP-9.15□□□□□ -3.87
RNU6-1160P-201ENST00000384546 CLTCL1P53675 1640 aa-9.16□□□□□ -3.88
RNU6-1160P-201ENST00000384546 UGGT2Q9NYU1 1516 aa-9.19□□□□□ -3.88
RNU6-1160P-201ENST00000384546 CD52P31358 61 aa-9.2□□□□□ -3.88
RNU6-1160P-201ENST00000384546 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa-9.23□□□□□ -3.89
RNU6-1160P-201ENST00000384546 PLNP26678 52 aa-9.23□□□□□ -3.89
RNU6-1160P-201ENST00000384546 TRPM2O94759 1503 aa-9.25□□□□□ -3.89
RNU6-1160P-201ENST00000384546 HTN1P15515 57 aa-9.27□□□□□ -3.89
RNU6-1160P-201ENST00000384546 GNG2P59768 71 aa-9.33□□□□□ -3.9
RNU6-1160P-201ENST00000384546 CPS1P31327 1500 aa-9.33□□□□□ -3.9
RNU6-1160P-201ENST00000384546 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa-9.34□□□□□ -3.9
RNU6-1160P-201ENST00000384546 VPS13AQ96RL7 3174 aa-9.34□□□□□ -3.91
RNU6-1160P-201ENST00000384546 LINC01590Q5TEZ4 76 aa-9.35□□□□□ -3.91
RNU6-1160P-201ENST00000384546 A0A096LNI7 61 aa-9.37□□□□□ -3.91
RNU6-1160P-201ENST00000384546 TOMM7Q9P0U1 55 aa-9.42□□□□□ -3.92
RNU6-1160P-201ENST00000384546 PRXQ9BXM0 1461 aa-9.5□□□□□ -3.93
RNU6-1160P-201ENST00000384546 IQGAP1P46940 1657 aa-9.51□□□□□ -3.93
RNU6-1160P-201ENST00000384546 NFAT5O94916 1531 aa-9.52□□□□□ -3.93
RNU6-1160P-201ENST00000384546 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa-9.61□□□□□ -3.95
RNU6-1160P-201ENST00000384546 PDCD5O14737 125 aa-9.62□□□□□ -3.95
RNU6-1160P-201ENST00000384546 SMCO4Q9NRQ5 59 aa-9.64□□□□□ -3.95
RNU6-1160P-201ENST00000384546 ADCY10Q96PN6 1610 aa-9.64□□□□□ -3.95
RNU6-1160P-201ENST00000384546 NDUFA1O15239 70 aa-9.68□□□□□ -3.96
RNU6-1160P-201ENST00000384546 EFCAB5A4FU69 1503 aa-9.71□□□□□ -3.96
RNU6-1160P-201ENST00000384546 DEFB124Q8NES8 71 aa-9.77□□□□□ -3.97
RNU6-1160P-201ENST00000384546 A0A087WWC5 75 aa-10□□□□□ -4.01
RNU6-1160P-201ENST00000384546 DUOX1Q9NRD9 1551 aa-10.04□□□□□ -4.02
RNU6-1160P-201ENST00000384546 FANCD2Q9BXW9 1451 aa-10.06□□□□□ -4.02
RNU6-1160P-201ENST00000384546 ABCC8Q09428 1581 aa-10.06□□□□□ -4.02
RNU6-1160P-201ENST00000384546 UTRNP46939 3433 aa-10.14□□□□□ -4.03
RNU6-1160P-201ENST00000384546 CMC2Q9NRP2 79 aa-10.17□□□□□ -4.04
RNU6-1160P-201ENST00000384546 SMIM5Q71RC9 77 aa-10.2□□□□□ -4.04
RNU6-1160P-201ENST00000384546 ERICH3Q5RHP9 1530 aa-10.23□□□□□ -4.05
RNU6-1160P-201ENST00000384546 LINC01556Q5JQF7 62 aa-10.28□□□□□ -4.06
RNU6-1160P-201ENST00000384546 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP-10.35□□□□□ -4.07
RNU6-1160P-201ENST00000384546 RPL39P62891 51 aaKnown RBP-10.42□□□□□ -4.08
RNU6-1160P-201ENST00000384546 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa-10.44□□□□□ -4.08
RNU6-1160P-201ENST00000384546 ATP7AQ04656 1500 aa-10.71□□□□□ -4.12
RNU6-1160P-201ENST00000384546 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP-10.74□□□□□ -4.13
RNU6-1160P-201ENST00000384546 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa-10.78□□□□□ -4.14
RNU6-1160P-201ENST00000384546 H3BUX3 64 aa-10.83□□□□□ -4.14
RNU6-1160P-201ENST00000384546 MROH2BQ7Z745 1585 aa-10.9□□□□□ -4.16
RNU6-1160P-201ENST00000384546 APELAP0DMC3 54 aa-11.33□□□□□ -4.22
RNU6-1160P-201ENST00000384546 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP-11.34□□□□□ -4.23
RNU6-1160P-201ENST00000384546 A0A096LPF7 62 aa-11.46□□□□□ -4.24
RNU6-1160P-201ENST00000384546 K7EIM0 57 aa-11.65□□□□□ -4.27
RNU6-1160P-201ENST00000384546 SNRPGP15A8MWD9 76 aa-11.67□□□□□ -4.28
RNU6-1160P-201ENST00000384546 IQGAP2Q13576 1575 aa-11.78□□□□□ -4.29
RNU6-1160P-201ENST00000384546 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa-11.88□□□□□ -4.31
RNU6-1160P-201ENST00000384546 HTN3P15516 51 aa-11.89□□□□□ -4.31
RNU6-1160P-201ENST00000384546 PRCDQ00LT1 54 aa-11.95□□□□□ -4.32
RNU6-1160P-201ENST00000384546 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa-12.02□□□□□ -4.33
RNU6-1160P-201ENST00000384546 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa-12.11□□□□□ -4.35
RNU6-1160P-201ENST00000384546 TOMM5Q8N4H5 51 aa-12.14□□□□□ -4.35
RNU6-1160P-201ENST00000384546 Q9Y3F1 56 aa-12.66□□□□□ -4.44
RNU6-1160P-201ENST00000384546 H3BSH0 61 aa-12.83□□□□□ -4.46
RNU6-1160P-201ENST00000384546 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP-13□□□□□ -4.49
RNU6-1160P-201ENST00000384546 RPL39P5Q59GN2 51 aa-13.05□□□□□ -4.5
RNU6-1160P-201ENST00000384546 GCC2Q8IWJ2 1684 aa-13.12□□□□□ -4.51
RNU6-1160P-201ENST00000384546 DEFB108AA8MXU0 73 aa-13.21□□□□□ -4.52
RNU6-1160P-201ENST00000384546 COX14Q96I36 57 aa-13.34□□□□□ -4.54
RNU6-1160P-201ENST00000384546 DEFB108BQ8NET1 73 aa-13.97□□□□□ -4.65
RNU6-1160P-201ENST00000384546 STATHP02808 62 aa-14.94□□□□□ -4.8
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 14 ms