RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047793.5

Hoxd1-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd1, Length 1,862 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Snx22Q8C084 192 aa15.99■□□□□ 0.15
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 D630044L22RikQ8C701 164 aa15.99■□□□□ 0.15
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 9530053A07RikE9PVG8 2581 aa15.99■□□□□ 0.15
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Smr3aQ61900 147 aa15.99■□□□□ 0.15
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Vsig8Q6P3A4 417 aa15.99■□□□□ 0.15
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr981Q8VEU2 310 aa15.99■□□□□ 0.15
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tmem210Q9D2F0 147 aa15.99■□□□□ 0.15
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 TroQ6DIC6 2087 aa15.99■□□□□ 0.15
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ighv1-23A0A0A6YVW3 117 aa15.98■□□□□ 0.15
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 BC107364E9Q5A2 140 aa15.98■□□□□ 0.15
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gp9O88186 177 aa15.98■□□□□ 0.15
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gng4P50153 75 aa15.98■□□□□ 0.15
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm5464Q3UY29 175 aa15.98■□□□□ 0.15
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Hspe1Q64433 102 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Hif1anQ8BLR9 349 aa15.98■□□□□ 0.15
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm10118Q8C8J5 116 aa15.98■□□□□ 0.15
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mrpl33Q9CQP0 65 aa15.98■□□□□ 0.15
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Uqcrfs1Q9CR68 274 aa15.98■□□□□ 0.15
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rnf114Q9ET26 229 aa15.98■□□□□ 0.15
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Arpc1aQ9R0Q6 370 aa15.98■□□□□ 0.15
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Utp20Q5XG71 2788 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Trav9d-1A0A075B699 112 aa15.97■□□□□ 0.15
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 OtorQ9JIE3 128 aa15.97■□□□□ 0.15
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slc25a20Q9Z2Z6 301 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Celsr2Q9R0M0 2920 aa15.97■□□□□ 0.15
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm15293D3YX02 93 aa15.97■□□□□ 0.15
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Omt2bD3YX29 119 aa15.97■□□□□ 0.15
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm26602M0QWA4 95 aa15.97■□□□□ 0.15
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mtatp8P03930 67 aa15.97■□□□□ 0.15
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Defb30Q30KN4 75 aa15.97■□□□□ 0.15
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tmem136Q3TYE7 245 aa15.97■□□□□ 0.15
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm7489Q3UT34 171 aa15.97■□□□□ 0.15
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Vwc2lQ505H4 222 aa15.97■□□□□ 0.15
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 RpeQ8VEE0 228 aa15.97■□□□□ 0.15
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Col6a4A2AX52 2309 aa15.96■□□□□ 0.15
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm6525A0A0A6YW33 106 aa15.96■□□□□ 0.15
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Vsig4F6TUL9 280 aa15.96■□□□□ 0.15
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Prrx2Q06348 247 aa15.96■□□□□ 0.15
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cox11Q6P8I6 275 aa15.96■□□□□ 0.15
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ighv7-3A0A075B5R2 120 aa15.95■□□□□ 0.14
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 A0A1Y7VMQ4 148 aa15.95■□□□□ 0.14
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Htr1dQ61224 374 aa15.95■□□□□ 0.14
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Chac1Q8R3J5 223 aa15.95■□□□□ 0.14
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nav2E9Q842 2432 aa15.95■□□□□ 0.14
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ighv3-1A0A075B5S6 116 aa15.95■□□□□ 0.14
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zfp493E9Q1L8 384 aa15.95■□□□□ 0.14
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Esp3J3QN49 87 aa15.95■□□□□ 0.14
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ighv1-4A0A075B5T4 117 aa15.94■□□□□ 0.14
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cox7cP17665 63 aa15.94■□□□□ 0.14
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Defa9P50707 93 aa15.94■□□□□ 0.14
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 AcanQ61282 2132 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm4763Q8CFJ5 196 aa15.93■□□□□ 0.14
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Spcs1Q9D958 161 aa15.93■□□□□ 0.14
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm26938S4R185 226 aa15.93■□□□□ 0.14
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ighv7-4A0A0A6YXL5 121 aa15.93■□□□□ 0.14
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Igkv4-57A0A0A6YYE7 117 aa15.93■□□□□ 0.14
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1520401A03RikA0A0J9YVH6 598 aa15.93■□□□□ 0.14
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm28038F7BCN9 126 aa15.93■□□□□ 0.14
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Bak1O08734 209 aa15.93■□□□□ 0.14
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ccl21aP84444 133 aa15.93■□□□□ 0.14
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ccl21bP86792 133 aa15.93■□□□□ 0.14
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ccl21cP86793 133 aa15.93■□□□□ 0.14
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zfand3Q497H0 227 aa15.93■□□□□ 0.14
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm5941Q497P9 117 aa15.93■□□□□ 0.14
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Trpt1Q8K3A2 249 aa15.93■□□□□ 0.14
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 CrygbP04344 175 aa15.92■□□□□ 0.14
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Defb2P82020 71 aa15.92■□□□□ 0.14
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Khdc1aQ3UWR2 166 aa15.92■□□□□ 0.14
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Foxc2Q61850 494 aa15.92■□□□□ 0.14
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cd52Q64389 74 aa15.92■□□□□ 0.14
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tppp3Q9CRB6 176 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gnb1lQ9EQ15 326 aa15.92■□□□□ 0.14
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ankhd1E9PUR0 2548 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Igkv4-90A0A075B5L3 117 aa15.91■□□□□ 0.14
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ighv1-53A0A075B5W3 117 aa15.91■□□□□ 0.14
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Hbb-bsA8DUK4 147 aa15.91■□□□□ 0.14
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Hbb-b1P02088 147 aa15.91■□□□□ 0.14
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tal2Q62282 108 aa15.91■□□□□ 0.14
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Psmb11Q8BG41 302 aa15.91■□□□□ 0.14
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tmem97Q8VD00 176 aa15.91■□□□□ 0.14
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Q9D131 166 aa15.91■□□□□ 0.14
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 RhohQ9D3G9 191 aa15.91■□□□□ 0.14
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Trav16d-dv11A0A075B617 117 aa15.91■□□□□ 0.14
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ighv8-8A0A0A6YXQ0 119 aa15.91■□□□□ 0.14
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Esp4A8R0T8 117 aa15.91■□□□□ 0.14
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Myod1P10085 318 aa15.9■□□□□ 0.14
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 NdpP48744 131 aa15.9■□□□□ 0.14
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Q9CX25 107 aa15.9■□□□□ 0.14
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tenm4Q3UHK6 2771 aa15.9■□□□□ 0.14
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ighv6-7A0A0A6YWU3 119 aa15.89■□□□□ 0.13
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Q3UNZ8 350 aa15.89■□□□□ 0.13
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fam24aQ8CF27 98 aa15.89■□□□□ 0.13
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Vmn1r63Q9EPT1 300 aa15.89■□□□□ 0.13
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Erg28Q9ERY9 140 aa15.89■□□□□ 0.13
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 SelenokQ9JLJ1 94 aa15.89■□□□□ 0.13
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dkk2Q9QYZ8 259 aa15.89■□□□□ 0.13
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Med12A2AGH6 2190 aa15.89■□□□□ 0.13
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm5157A0A087WRH8 301 aa15.88■□□□□ 0.13
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 P06334 169 aa15.88■□□□□ 0.13
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Lynx1P0DP60 116 aa15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 46.9 ms