Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPT1

Vmn1r63, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r63Q9EPT1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Vmn1r63Q9EPT1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vmn1r63Q9EPT1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vmn1r63Q9EPT1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vmn1r63Q9EPT1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vmn1r63Q9EPT1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vmn1r63Q9EPT1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Vmn1r63Q9EPT1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Vmn1r63Q9EPT1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Vmn1r63Q9EPT1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vmn1r63Q9EPT1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vmn1r63Q9EPT1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Vmn1r63Q9EPT1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vmn1r63Q9EPT1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vmn1r63Q9EPT1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Vmn1r63Q9EPT1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vmn1r63Q9EPT1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vmn1r63Q9EPT1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vmn1r63Q9EPT1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmn1r63Q9EPT1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Vmn1r63Q9EPT1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn1r63Q9EPT1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vmn1r63Q9EPT1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn1r63Q9EPT1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn1r63Q9EPT1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r63Q9EPT1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn1r63Q9EPT1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn1r63Q9EPT1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn1r63Q9EPT1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn1r63Q9EPT1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn1r63Q9EPT1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn1r63Q9EPT1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r63Q9EPT1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r63Q9EPT1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r63Q9EPT1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r63Q9EPT1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r63Q9EPT1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r63Q9EPT1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r63Q9EPT1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn1r63Q9EPT1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vmn1r63Q9EPT1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn1r63Q9EPT1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn1r63Q9EPT1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn1r63Q9EPT1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn1r63Q9EPT1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn1r63Q9EPT1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn1r63Q9EPT1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r63Q9EPT1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn1r63Q9EPT1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn1r63Q9EPT1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r63Q9EPT1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn1r63Q9EPT1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vmn1r63Q9EPT1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn1r63Q9EPT1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn1r63Q9EPT1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn1r63Q9EPT1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn1r63Q9EPT1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r63Q9EPT1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r63Q9EPT1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r63Q9EPT1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r63Q9EPT1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r63Q9EPT1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r63Q9EPT1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn1r63Q9EPT1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r63Q9EPT1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn1r63Q9EPT1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn1r63Q9EPT1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r63Q9EPT1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn1r63Q9EPT1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn1r63Q9EPT1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn1r63Q9EPT1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r63Q9EPT1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r63Q9EPT1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r63Q9EPT1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r63Q9EPT1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r63Q9EPT1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn1r63Q9EPT1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn1r63Q9EPT1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn1r63Q9EPT1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn1r63Q9EPT1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r63Q9EPT1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn1r63Q9EPT1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn1r63Q9EPT1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r63Q9EPT1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r63Q9EPT1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r63Q9EPT1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r63Q9EPT1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r63Q9EPT1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r63Q9EPT1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r63Q9EPT1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r63Q9EPT1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn1r63Q9EPT1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r63Q9EPT1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vmn1r63Q9EPT1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vmn1r63Q9EPT1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r63Q9EPT1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn1r63Q9EPT1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn1r63Q9EPT1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn1r63Q9EPT1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn1r63Q9EPT1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms