RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		4.18	□□□□□ -1.74
LETMD1-238	ENST00000623495	LINC00483	Q53H64	154 aa		4.18	□□□□□ -1.74
LETMD1-238	ENST00000623495	DMAC1	Q96GE9	116 aa		4.18	□□□□□ -1.74
LETMD1-238	ENST00000623495	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LETMD1-238	ENST00000623495	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		4.16	□□□□□ -1.74
LETMD1-238	ENST00000623495	MT1HL1	P0DM35	61 aa		4.16	□□□□□ -1.74
LETMD1-238	ENST00000623495	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		4.16	□□□□□ -1.74
LETMD1-238	ENST00000623495	C8orf17	Q9NRJ1	99 aa		4.16	□□□□□ -1.74
LETMD1-238	ENST00000623495	RNF213	Q63HN8	5207 aa		4.15	□□□□□ -1.74
LETMD1-238	ENST00000623495	KRTAP16-1	A8MUX0	517 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LETMD1-238	ENST00000623495	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LETMD1-238	ENST00000623495		A8MUU9	505 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LETMD1-238	ENST00000623495	MRPL34	Q9BQ48	92 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
LETMD1-238	ENST00000623495	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LETMD1-238	ENST00000623495	SPRR1B	P22528	89 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LETMD1-238	ENST00000623495	LPA	P08519	4548 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LETMD1-238	ENST00000623495	KRTAP10-8	P60410	259 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A1B0GVX0	72 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LETMD1-238	ENST00000623495	MUC2	Q02817	5179 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LETMD1-238	ENST00000623495	C20orf166-AS1	Q96NR2	134 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LETMD1-238	ENST00000623495	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LETMD1-238	ENST00000623495		Q96NJ1	140 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LETMD1-238	ENST00000623495	C9orf92	A6NGG3	77 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LETMD1-238	ENST00000623495	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LETMD1-238	ENST00000623495	HMCN2	Q8NDA2	5059 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LETMD1-238	ENST00000623495	NDUFAF8	A1L188	74 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LETMD1-238	ENST00000623495	TNXB	P22105	4242 aa		4.04	□□□□□ -1.76
LETMD1-238	ENST00000623495		Q5W150	140 aa		4.03	□□□□□ -1.76
LETMD1-238	ENST00000623495	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		4.02	□□□□□ -1.77
LETMD1-238	ENST00000623495	SPINT4	Q6UDR6	99 aa		4.02	□□□□□ -1.77
LETMD1-238	ENST00000623495	SPINK1	P00995	79 aa		4.01	□□□□□ -1.77
LETMD1-238	ENST00000623495		H0YAA0	97 aa		3.99	□□□□□ -1.77
LETMD1-238	ENST00000623495		K7ERS5	55 aa		3.99	□□□□□ -1.77
LETMD1-238	ENST00000623495	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		3.99	□□□□□ -1.77
LETMD1-238	ENST00000623495	IGKV2-30	P06310	120 aa		3.98	□□□□□ -1.77
LETMD1-238	ENST00000623495	LUZP6	Q538Z0	58 aa		3.97	□□□□□ -1.77
LETMD1-238	ENST00000623495	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		3.93	□□□□□ -1.78
LETMD1-238	ENST00000623495	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		3.92	□□□□□ -1.78
LETMD1-238	ENST00000623495	CRIPT	Q9P021	101 aa		3.92	□□□□□ -1.78
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A1B0GU33	70 aa		3.91	□□□□□ -1.78
LETMD1-238	ENST00000623495	H1FX-AS1	Q4G0G2	97 aa		3.89	□□□□□ -1.79
LETMD1-238	ENST00000623495	XP32	Q5T750	250 aa		3.86	□□□□□ -1.79
LETMD1-238	ENST00000623495	TPRXL	Q17RH7	258 aa		3.85	□□□□□ -1.79
LETMD1-238	ENST00000623495	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
LETMD1-238	ENST00000623495	COX6B2	Q6YFQ2	88 aa		3.81	□□□□□ -1.8
LETMD1-238	ENST00000623495	FSIP2	Q5CZC0	6907 aa		3.79	□□□□□ -1.8
LETMD1-238	ENST00000623495	RPL37	P61927	97 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
LETMD1-238	ENST00000623495	KRTAP4-1	Q9BYQ7	146 aa		3.77	□□□□□ -1.81
LETMD1-238	ENST00000623495	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LETMD1-238	ENST00000623495		M0R2T5	61 aa		3.75	□□□□□ -1.81
LETMD1-238	ENST00000623495	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		3.73	□□□□□ -1.81
LETMD1-238	ENST00000623495	LCE4A	Q5TA78	99 aa		3.68	□□□□□ -1.82
LETMD1-238	ENST00000623495	CAMK2N1	Q7Z7J9	78 aa		3.67	□□□□□ -1.82
LETMD1-238	ENST00000623495	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		3.66	□□□□□ -1.82
LETMD1-238	ENST00000623495	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		3.66	□□□□□ -1.82
LETMD1-238	ENST00000623495	KRTAP19-1	Q8IUB9	90 aa		3.65	□□□□□ -1.82
LETMD1-238	ENST00000623495		S4R3F8	94 aa		3.6	□□□□□ -1.83
LETMD1-238	ENST00000623495	MUC17	Q685J3	4493 aa		3.58	□□□□□ -1.84
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A0D9SG42	100 aa		3.58	□□□□□ -1.84
LETMD1-238	ENST00000623495	PLAC4	Q8WY50	150 aa		3.58	□□□□□ -1.84
LETMD1-238	ENST00000623495	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		3.58	□□□□□ -1.84
LETMD1-238	ENST00000623495	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		3.58	□□□□□ -1.84
LETMD1-238	ENST00000623495	KRTAP13-4	Q3LI77	160 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LETMD1-238	ENST00000623495	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
LETMD1-238	ENST00000623495	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LETMD1-238	ENST00000623495	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LETMD1-238	ENST00000623495	MT1H	P80294	61 aa		3.54	□□□□□ -1.84
LETMD1-238	ENST00000623495	KRTAP19-2	Q3LHN2	52 aa		3.52	□□□□□ -1.85
LETMD1-238	ENST00000623495	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		3.52	□□□□□ -1.85
LETMD1-238	ENST00000623495	USH2A	O75445	5202 aa		3.52	□□□□□ -1.85
LETMD1-238	ENST00000623495	KRTAP12-2	P59991	146 aa		3.51	□□□□□ -1.85
LETMD1-238	ENST00000623495	KRTAP12-1	P59990	96 aa		3.48	□□□□□ -1.85
LETMD1-238	ENST00000623495	PRO2289	Q9P1D8	64 aa		3.48	□□□□□ -1.85
LETMD1-238	ENST00000623495	KRTAP10-10	P60014	251 aa		3.46	□□□□□ -1.86
LETMD1-238	ENST00000623495	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		3.46	□□□□□ -1.86
LETMD1-238	ENST00000623495	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		3.44	□□□□□ -1.86
LETMD1-238	ENST00000623495	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	3.43	□□□□□ -1.86
LETMD1-238	ENST00000623495	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		3.43	□□□□□ -1.86
LETMD1-238	ENST00000623495	FLG	P20930	4061 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
LETMD1-238	ENST00000623495		M0QZ58	72 aa		3.38	□□□□□ -1.87
LETMD1-238	ENST00000623495	PP632	Q6XCG6	107 aa		3.37	□□□□□ -1.87
LETMD1-238	ENST00000623495	MT1F	P04733	61 aa		3.36	□□□□□ -1.87
LETMD1-238	ENST00000623495	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		3.36	□□□□□ -1.87
LETMD1-238	ENST00000623495	MT2A	P02795	61 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LETMD1-238	ENST00000623495	INE1	O15225	51 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LETMD1-238	ENST00000623495	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LETMD1-238	ENST00000623495	LCE3B	Q5TA77	95 aa		3.32	□□□□□ -1.88
LETMD1-238	ENST00000623495		R4GN34	69 aa		3.3	□□□□□ -1.88
LETMD1-238	ENST00000623495	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		3.29	□□□□□ -1.88
LETMD1-238	ENST00000623495	SSPO	A2VEC9	5147 aa		3.26	□□□□□ -1.89
LETMD1-238	ENST00000623495	CRCT1	Q9UGL9	99 aa		3.23	□□□□□ -1.89
LETMD1-238	ENST00000623495	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
LETMD1-238	ENST00000623495	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
LETMD1-238	ENST00000623495	FCGBP	Q9Y6R7	5405 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.9
LETMD1-238	ENST00000623495	KMT2D	O14686	5537 aa		3.11	□□□□□ -1.91
LETMD1-238	ENST00000623495	LCE1D	Q5T752	114 aa		3.1	□□□□□ -1.91
LETMD1-238	ENST00000623495	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		3.06	□□□□□ -1.92
LETMD1-238	ENST00000623495	MT1B	P07438	61 aa		3.06	□□□□□ -1.92
LETMD1-238	ENST00000623495	SPRR2G	Q9BYE4	73 aa		3.06	□□□□□ -1.92
LETMD1-238	ENST00000623495	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		3.03	□□□□□ -1.92

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