RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592170.5

SEH1L-209, Transcript of SEH1 like nucleoporin, humanhuman

TSL 5

Gene SEH1L, Length 787 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1L-209ENST00000592170 COX7CP15954 63 aa5.5□□□□□ -1.53
SEH1L-209ENST00000592170 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa5.49□□□□□ -1.53
SEH1L-209ENST00000592170 LINC00208Q96KT6 92 aa5.49□□□□□ -1.53
SEH1L-209ENST00000592170 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa5.48□□□□□ -1.53
SEH1L-209ENST00000592170 H3BPC8 53 aa5.48□□□□□ -1.53
SEH1L-209ENST00000592170 C7orf65Q6ZTY9 151 aa5.48□□□□□ -1.53
SEH1L-209ENST00000592170 C1orf64Q8NEQ6 169 aa5.48□□□□□ -1.53
SEH1L-209ENST00000592170 SPINK7P58062 85 aa5.46□□□□□ -1.54
SEH1L-209ENST00000592170 C20orf197Q8N268 126 aa5.46□□□□□ -1.54
SEH1L-209ENST00000592170 PCP4P48539 62 aa5.45□□□□□ -1.54
SEH1L-209ENST00000592170 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.45□□□□□ -1.54
SEH1L-209ENST00000592170 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa5.45□□□□□ -1.54
SEH1L-209ENST00000592170 SNURFQ9Y675 71 aa5.45□□□□□ -1.54
SEH1L-209ENST00000592170 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa5.44□□□□□ -1.54
SEH1L-209ENST00000592170 FSIP2Q5CZC0 6907 aa5.43□□□□□ -1.54
SEH1L-209ENST00000592170 CCDC179H3BU77 68 aa5.42□□□□□ -1.54
SEH1L-209ENST00000592170 KLKP1Q107X0 134 aa5.41□□□□□ -1.54
SEH1L-209ENST00000592170 HRES1P13985 223 aa5.4□□□□□ -1.54
SEH1L-209ENST00000592170 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.4□□□□□ -1.54
SEH1L-209ENST00000592170 CYSTM1Q9H1C7 97 aa5.37□□□□□ -1.55
SEH1L-209ENST00000592170 A0A0A0MQY5 61 aa5.34□□□□□ -1.55
SEH1L-209ENST00000592170 NDUFC1O43677 76 aa5.34□□□□□ -1.55
SEH1L-209ENST00000592170 C4orf26Q17RF5 130 aa5.34□□□□□ -1.55
SEH1L-209ENST00000592170 H7BZZ5 65 aa5.33□□□□□ -1.56
SEH1L-209ENST00000592170 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa5.33□□□□□ -1.56
SEH1L-209ENST00000592170 COX6B2Q6YFQ2 88 aa5.31□□□□□ -1.56
SEH1L-209ENST00000592170 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa5.29□□□□□ -1.56
SEH1L-209ENST00000592170 FAM236CP0DP71 79 aa5.29□□□□□ -1.56
SEH1L-209ENST00000592170 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa5.28□□□□□ -1.56
SEH1L-209ENST00000592170 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa5.27□□□□□ -1.57
SEH1L-209ENST00000592170 DMAC1Q96GE9 116 aa5.25□□□□□ -1.57
SEH1L-209ENST00000592170 A8MUN3 132 aa5.24□□□□□ -1.57
SEH1L-209ENST00000592170 TMEM258P61165 79 aa5.23□□□□□ -1.57
SEH1L-209ENST00000592170 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa5.23□□□□□ -1.57
SEH1L-209ENST00000592170 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
SEH1L-209ENST00000592170 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
SEH1L-209ENST00000592170 ACYP2P14621 99 aa5.19□□□□□ -1.58
SEH1L-209ENST00000592170 S4R3F8 94 aa5.16□□□□□ -1.58
SEH1L-209ENST00000592170 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.14□□□□□ -1.59
SEH1L-209ENST00000592170 LCA10Q71F78 164 aa5.13□□□□□ -1.59
SEH1L-209ENST00000592170 COA5Q86WW8 74 aa5.13□□□□□ -1.59
SEH1L-209ENST00000592170 MT1HP80294 61 aa5.12□□□□□ -1.59
SEH1L-209ENST00000592170 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa5.11□□□□□ -1.59
SEH1L-209ENST00000592170 M0R2T5 61 aa5.09□□□□□ -1.59
SEH1L-209ENST00000592170 SERP1Q9Y6X1 66 aa5.06□□□□□ -1.6
SEH1L-209ENST00000592170 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
SEH1L-209ENST00000592170 CSAG1Q6PB30 78 aa5.05□□□□□ -1.6
SEH1L-209ENST00000592170 SPTSSBQ8NFR3 76 aa5.04□□□□□ -1.6
SEH1L-209ENST00000592170 RPS28P62857 69 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
SEH1L-209ENST00000592170 MT3P25713 68 aa4.95□□□□□ -1.62
SEH1L-209ENST00000592170 H0YAA0 97 aa4.93□□□□□ -1.62
SEH1L-209ENST00000592170 ADM2Q7Z4H4 148 aa4.91□□□□□ -1.62
SEH1L-209ENST00000592170 SMIM26A0A096LP01 95 aa4.9□□□□□ -1.63
SEH1L-209ENST00000592170 SSPOA2VEC9 5147 aa4.89□□□□□ -1.63
SEH1L-209ENST00000592170 USH2AO75445 5202 aa4.89□□□□□ -1.63
SEH1L-209ENST00000592170 MT2AP02795 61 aa4.89□□□□□ -1.63
SEH1L-209ENST00000592170 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa4.87□□□□□ -1.63
SEH1L-209ENST00000592170 MT1FP04733 61 aa4.86□□□□□ -1.63
SEH1L-209ENST00000592170 SEC61GP60059 68 aa4.86□□□□□ -1.63
SEH1L-209ENST00000592170 A0A1B0GU69 56 aa4.85□□□□□ -1.63
SEH1L-209ENST00000592170 P0C880 135 aa4.85□□□□□ -1.63
SEH1L-209ENST00000592170 KRTAP10-10P60014 251 aa4.84□□□□□ -1.63
SEH1L-209ENST00000592170 Q1T7F1 81 aa4.84□□□□□ -1.63
SEH1L-209ENST00000592170 V9GYY9 64 aa4.84□□□□□ -1.63
SEH1L-209ENST00000592170 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
SEH1L-209ENST00000592170 PRR15LQ9BU68 103 aa4.81□□□□□ -1.64
SEH1L-209ENST00000592170 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
SEH1L-209ENST00000592170 PSPHP1O15172 72 aa4.77□□□□□ -1.65
SEH1L-209ENST00000592170 CRIPTQ9P021 101 aa4.77□□□□□ -1.65
SEH1L-209ENST00000592170 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
SEH1L-209ENST00000592170 A0A1B0GU33 70 aa4.75□□□□□ -1.65
SEH1L-209ENST00000592170 R4GN34 69 aa4.74□□□□□ -1.65
SEH1L-209ENST00000592170 M0QZ58 72 aa4.73□□□□□ -1.65
SEH1L-209ENST00000592170 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
SEH1L-209ENST00000592170 Q5VV11 94 aa4.73□□□□□ -1.65
SEH1L-209ENST00000592170 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa4.71□□□□□ -1.66
SEH1L-209ENST00000592170 SPRR2GQ9BYE4 73 aa4.7□□□□□ -1.66
SEH1L-209ENST00000592170 SPATA8Q6RVD6 105 aa4.68□□□□□ -1.66
SEH1L-209ENST00000592170 UQCR11O14957 56 aa4.67□□□□□ -1.66
SEH1L-209ENST00000592170 LINC01554Q52M75 96 aa4.65□□□□□ -1.67
SEH1L-209ENST00000592170 A6NED7 52 aa4.63□□□□□ -1.67
SEH1L-209ENST00000592170 LCE1EQ5T753 118 aa4.63□□□□□ -1.67
SEH1L-209ENST00000592170 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.62□□□□□ -1.67
SEH1L-209ENST00000592170 A0A0D9SG42 100 aa4.61□□□□□ -1.67
SEH1L-209ENST00000592170 MIR22HGQ0VDD5 57 aa4.61□□□□□ -1.67
SEH1L-209ENST00000592170 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa4.61□□□□□ -1.67
SEH1L-209ENST00000592170 A8MU10 97 aa4.6□□□□□ -1.67
SEH1L-209ENST00000592170 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.58□□□□□ -1.68
SEH1L-209ENST00000592170 A6NN06 94 aa4.56□□□□□ -1.68
SEH1L-209ENST00000592170 MT1BP07438 61 aa4.56□□□□□ -1.68
SEH1L-209ENST00000592170 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa4.56□□□□□ -1.68
SEH1L-209ENST00000592170 LCE1FQ5T754 118 aa4.53□□□□□ -1.68
SEH1L-209ENST00000592170 KRTAP12-1P59990 96 aa4.52□□□□□ -1.69
SEH1L-209ENST00000592170 PLAC4Q8WY50 150 aa4.52□□□□□ -1.69
SEH1L-209ENST00000592170 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa4.52□□□□□ -1.69
SEH1L-209ENST00000592170 KRTAP12-2P59991 146 aa4.5□□□□□ -1.69
SEH1L-209ENST00000592170 SPINT4Q6UDR6 99 aa4.5□□□□□ -1.69
SEH1L-209ENST00000592170 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
SEH1L-209ENST00000592170 NEBP20929 6669 aa4.48□□□□□ -1.69
SEH1L-209ENST00000592170 BRK1Q8WUW1 75 aa4.46□□□□□ -1.7
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