RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589329.5

TXNL1-208, Transcript of thioredoxin like 1, humanhuman

TSL 3

Gene TXNL1, Length 896 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNL1-208ENST00000589329 KLKP1Q107X0 134 aa6.92□□□□□ -1.3
TXNL1-208ENST00000589329 A8MUN3 132 aa6.9□□□□□ -1.3
TXNL1-208ENST00000589329 Q5VV11 94 aa6.9□□□□□ -1.3
TXNL1-208ENST00000589329 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-208ENST00000589329 A0A1B0GV90 55 aa6.88□□□□□ -1.31
TXNL1-208ENST00000589329 CRIPTQ9P021 101 aa6.88□□□□□ -1.31
TXNL1-208ENST00000589329 NDUFC1O43677 76 aa6.87□□□□□ -1.31
TXNL1-208ENST00000589329 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.87□□□□□ -1.31
TXNL1-208ENST00000589329 IMUPQ9GZP8 106 aa6.87□□□□□ -1.31
TXNL1-208ENST00000589329 J3QR89 54 aa6.86□□□□□ -1.31
TXNL1-208ENST00000589329 MP68P56378 58 aa6.86□□□□□ -1.31
TXNL1-208ENST00000589329 MT1BP07438 61 aa6.85□□□□□ -1.31
TXNL1-208ENST00000589329 LINC00208Q96KT6 92 aa6.85□□□□□ -1.31
TXNL1-208ENST00000589329 OCR1Q9BZK8 76 aa6.85□□□□□ -1.31
TXNL1-208ENST00000589329 H0YAA0 97 aa6.83□□□□□ -1.32
TXNL1-208ENST00000589329 A6NN06 94 aa6.81□□□□□ -1.32
TXNL1-208ENST00000589329 H3BPC8 53 aa6.79□□□□□ -1.32
TXNL1-208ENST00000589329 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.77□□□□□ -1.33
TXNL1-208ENST00000589329 SCGB1A1P11684 91 aa6.72□□□□□ -1.33
TXNL1-208ENST00000589329 KRTAP10-5P60370 271 aa6.72□□□□□ -1.33
TXNL1-208ENST00000589329 PCP4P48539 62 aa6.69□□□□□ -1.34
TXNL1-208ENST00000589329 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.68□□□□□ -1.34
TXNL1-208ENST00000589329 DMAC1Q96GE9 116 aa6.66□□□□□ -1.34
TXNL1-208ENST00000589329 C20orf197Q8N268 126 aa6.63□□□□□ -1.35
TXNL1-208ENST00000589329 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.59□□□□□ -1.35
TXNL1-208ENST00000589329 K7ERU9 68 aa6.58□□□□□ -1.36
TXNL1-208ENST00000589329 R4GN34 69 aa6.56□□□□□ -1.36
TXNL1-208ENST00000589329 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.55□□□□□ -1.36
TXNL1-208ENST00000589329 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.54□□□□□ -1.36
TXNL1-208ENST00000589329 MT-ATP8P03928 68 aa6.53□□□□□ -1.36
TXNL1-208ENST00000589329 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.53□□□□□ -1.36
TXNL1-208ENST00000589329 P0C880 135 aa6.52□□□□□ -1.37
TXNL1-208ENST00000589329 ACYP2P14621 99 aa6.51□□□□□ -1.37
TXNL1-208ENST00000589329 PLAC4Q8WY50 150 aa6.51□□□□□ -1.37
TXNL1-208ENST00000589329 NEBP20929 6669 aa6.5□□□□□ -1.37
TXNL1-208ENST00000589329 M0QZ58 72 aa6.48□□□□□ -1.37
TXNL1-208ENST00000589329 KRTAP5-9P26371 169 aa6.47□□□□□ -1.37
TXNL1-208ENST00000589329 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.47□□□□□ -1.37
TXNL1-208ENST00000589329 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.46□□□□□ -1.38
TXNL1-208ENST00000589329 MT1XP80297 61 aa6.43□□□□□ -1.38
TXNL1-208ENST00000589329 KMT2DO14686 5537 aa6.43□□□□□ -1.38
TXNL1-208ENST00000589329 MDN1Q9NU22 5596 aa6.39□□□□□ -1.39
TXNL1-208ENST00000589329 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.39□□□□□ -1.39
TXNL1-208ENST00000589329 LINC01554Q52M75 96 aa6.36□□□□□ -1.39
TXNL1-208ENST00000589329 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.35□□□□□ -1.39
TXNL1-208ENST00000589329 SNURFQ9Y675 71 aa6.35□□□□□ -1.39
TXNL1-208ENST00000589329 KRTAP12-2P59991 146 aa6.33□□□□□ -1.4
TXNL1-208ENST00000589329 SERP2Q8N6R1 65 aa6.31□□□□□ -1.4
TXNL1-208ENST00000589329 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa6.25□□□□□ -1.41
TXNL1-208ENST00000589329 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.25□□□□□ -1.41
TXNL1-208ENST00000589329 SPRR2FQ96RM1 72 aa6.25□□□□□ -1.41
TXNL1-208ENST00000589329 SPRR2EP22531 72 aa6.15□□□□□ -1.42
TXNL1-208ENST00000589329 SPRR2BP35325 72 aa6.15□□□□□ -1.42
TXNL1-208ENST00000589329 SPRR2AP35326 72 aa6.15□□□□□ -1.42
TXNL1-208ENST00000589329 SEC61GP60059 68 aa6.15□□□□□ -1.42
TXNL1-208ENST00000589329 KRTAP10-12P60413 245 aa6.13□□□□□ -1.43
TXNL1-208ENST00000589329 COA5Q86WW8 74 aa6.12□□□□□ -1.43
TXNL1-208ENST00000589329 COX7CP15954 63 aa6.11□□□□□ -1.43
TXNL1-208ENST00000589329 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
TXNL1-208ENST00000589329 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.1□□□□□ -1.43
TXNL1-208ENST00000589329 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6.1□□□□□ -1.43
TXNL1-208ENST00000589329 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.1□□□□□ -1.43
TXNL1-208ENST00000589329 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.1□□□□□ -1.43
TXNL1-208ENST00000589329 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.08□□□□□ -1.44
TXNL1-208ENST00000589329 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.08□□□□□ -1.44
TXNL1-208ENST00000589329 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.05□□□□□ -1.44
TXNL1-208ENST00000589329 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa6.03□□□□□ -1.44
TXNL1-208ENST00000589329 H7BZZ5 65 aa6.01□□□□□ -1.45
TXNL1-208ENST00000589329 SPRR2DP22532 72 aa5.95□□□□□ -1.46
TXNL1-208ENST00000589329 A0A1B0GU33 70 aa5.93□□□□□ -1.46
TXNL1-208ENST00000589329 CYSTM1Q9H1C7 97 aa5.93□□□□□ -1.46
TXNL1-208ENST00000589329 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.91□□□□□ -1.46
TXNL1-208ENST00000589329 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.91□□□□□ -1.46
TXNL1-208ENST00000589329 A0A0D9SG42 100 aa5.9□□□□□ -1.46
TXNL1-208ENST00000589329 V9GYY9 64 aa5.89□□□□□ -1.47
TXNL1-208ENST00000589329 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.88□□□□□ -1.47
TXNL1-208ENST00000589329 ANAPC13Q9BS18 74 aa5.88□□□□□ -1.47
TXNL1-208ENST00000589329 SPINT4Q6UDR6 99 aa5.84□□□□□ -1.47
TXNL1-208ENST00000589329 A0A1B0GU69 56 aa5.83□□□□□ -1.48
TXNL1-208ENST00000589329 SMIM26A0A096LP01 95 aa5.8□□□□□ -1.48
TXNL1-208ENST00000589329 KRTAP12-1P59990 96 aa5.8□□□□□ -1.48
TXNL1-208ENST00000589329 LCE3BQ5TA77 95 aa5.79□□□□□ -1.48
TXNL1-208ENST00000589329 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
TXNL1-208ENST00000589329 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.74□□□□□ -1.49
TXNL1-208ENST00000589329 CCDC179H3BU77 68 aa5.72□□□□□ -1.49
TXNL1-208ENST00000589329 MT1EP04732 61 aa5.71□□□□□ -1.5
TXNL1-208ENST00000589329 PRR15LQ9BU68 103 aa5.71□□□□□ -1.5
TXNL1-208ENST00000589329 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.69□□□□□ -1.5
TXNL1-208ENST00000589329 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa5.67□□□□□ -1.5
TXNL1-208ENST00000589329 A8MU10 97 aa5.65□□□□□ -1.5
TXNL1-208ENST00000589329 H3BS24 57 aa5.64□□□□□ -1.51
TXNL1-208ENST00000589329 A0A0A0MQY5 61 aa5.63□□□□□ -1.51
TXNL1-208ENST00000589329 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
TXNL1-208ENST00000589329 PRO0628Q9UI54 55 aa5.6□□□□□ -1.51
TXNL1-208ENST00000589329 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa5.6□□□□□ -1.51
TXNL1-208ENST00000589329 TMEM258P61165 79 aa5.59□□□□□ -1.51
TXNL1-208ENST00000589329 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa5.59□□□□□ -1.51
TXNL1-208ENST00000589329 TNP1P09430 55 aa5.58□□□□□ -1.52
TXNL1-208ENST00000589329 MT1GP13640 62 aa5.56□□□□□ -1.52
TXNL1-208ENST00000589329 PP632Q6XCG6 107 aa5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.8 ms