RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576691.5

TBCD-223, Transcript of tubulin folding cofactor D, human

TSL 3

Gene TBCD, Length 929 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TBCD-223	ENST00000576691		S4R3F8	94 aa		8.19	□□□□□ -1.1
TBCD-223	ENST00000576691	CCDC179	H3BU77	68 aa		8.17	□□□□□ -1.1
TBCD-223	ENST00000576691		H7BZZ5	65 aa		8.16	□□□□□ -1.1
TBCD-223	ENST00000576691	ACYP2	P14621	99 aa		8.16	□□□□□ -1.1
TBCD-223	ENST00000576691	LCA10	Q71F78	164 aa		8.12	□□□□□ -1.11
TBCD-223	ENST00000576691	CYSTM1	Q9H1C7	97 aa		8.12	□□□□□ -1.11
TBCD-223	ENST00000576691	LOR	P23490	312 aa	Predicted RBP	8.11	□□□□□ -1.11
TBCD-223	ENST00000576691	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	8.1	□□□□□ -1.11
TBCD-223	ENST00000576691	CSAG1	Q6PB30	78 aa		8.1	□□□□□ -1.11
TBCD-223	ENST00000576691	KRTAP3-3	Q9BYR6	98 aa		8.07	□□□□□ -1.12
TBCD-223	ENST00000576691	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	7.99	□□□□□ -1.13
TBCD-223	ENST00000576691	SPTSSB	Q8NFR3	76 aa		7.98	□□□□□ -1.13
TBCD-223	ENST00000576691	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		7.98	□□□□□ -1.13
TBCD-223	ENST00000576691	CHKB-CPT1B	H3BT56	60 aa		7.97	□□□□□ -1.13
TBCD-223	ENST00000576691	TMEM258	P61165	79 aa		7.95	□□□□□ -1.14
TBCD-223	ENST00000576691	PCP4	P48539	62 aa		7.94	□□□□□ -1.14
TBCD-223	ENST00000576691	COA5	Q86WW8	74 aa		7.92	□□□□□ -1.14
TBCD-223	ENST00000576691	MT2A	P02795	61 aa		7.9	□□□□□ -1.14
TBCD-223	ENST00000576691		H0YAA0	97 aa		7.89	□□□□□ -1.15
TBCD-223	ENST00000576691	KRTAP10-10	P60014	251 aa		7.85	□□□□□ -1.15
TBCD-223	ENST00000576691	MT1F	P04733	61 aa		7.83	□□□□□ -1.16
TBCD-223	ENST00000576691	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		7.8	□□□□□ -1.16
TBCD-223	ENST00000576691	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	7.77	□□□□□ -1.17
TBCD-223	ENST00000576691	ADM2	Q7Z4H4	148 aa		7.76	□□□□□ -1.17
TBCD-223	ENST00000576691	SSPO	A2VEC9	5147 aa		7.75	□□□□□ -1.17
TBCD-223	ENST00000576691	USH2A	O75445	5202 aa		7.73	□□□□□ -1.17
TBCD-223	ENST00000576691	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		7.72	□□□□□ -1.17
TBCD-223	ENST00000576691	CRIPT	Q9P021	101 aa		7.72	□□□□□ -1.17
TBCD-223	ENST00000576691	SERP1	Q9Y6X1	66 aa		7.71	□□□□□ -1.18
TBCD-223	ENST00000576691	KRTAP3-2	Q9BYR7	98 aa		7.68	□□□□□ -1.18
TBCD-223	ENST00000576691	SEC61G	P60059	68 aa		7.64	□□□□□ -1.19
TBCD-223	ENST00000576691		P0C880	135 aa		7.63	□□□□□ -1.19
TBCD-223	ENST00000576691	SPRR2G	Q9BYE4	73 aa		7.6	□□□□□ -1.19
TBCD-223	ENST00000576691	KRTAP19-1	Q8IUB9	90 aa		7.57	□□□□□ -1.2
TBCD-223	ENST00000576691	FCGBP	Q9Y6R7	5405 aa	Predicted RBP	7.56	□□□□□ -1.2
TBCD-223	ENST00000576691	LCE2B	O14633	110 aa		7.55	□□□□□ -1.2
TBCD-223	ENST00000576691	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
TBCD-223	ENST00000576691		R4GN34	69 aa		7.55	□□□□□ -1.2
TBCD-223	ENST00000576691		A0A1B0GU69	56 aa		7.53	□□□□□ -1.2
TBCD-223	ENST00000576691	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		7.52	□□□□□ -1.21
TBCD-223	ENST00000576691		M0QZ58	72 aa		7.51	□□□□□ -1.21
TBCD-223	ENST00000576691	PRR15L	Q9BU68	103 aa		7.49	□□□□□ -1.21
TBCD-223	ENST00000576691		V9GYY9	64 aa		7.47	□□□□□ -1.21
TBCD-223	ENST00000576691	SMIM26	A0A096LP01	95 aa		7.46	□□□□□ -1.22
TBCD-223	ENST00000576691	KRTAP19-8	Q3LI54	63 aa		7.46	□□□□□ -1.22
TBCD-223	ENST00000576691		A0A1B0GU33	70 aa		7.43	□□□□□ -1.22
TBCD-223	ENST00000576691		Q1T7F1	81 aa		7.41	□□□□□ -1.22
TBCD-223	ENST00000576691		Q5VV11	94 aa		7.41	□□□□□ -1.22
TBCD-223	ENST00000576691	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
TBCD-223	ENST00000576691	MT1B	P07438	61 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TBCD-223	ENST00000576691	KRTAP13-4	Q3LI77	160 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TBCD-223	ENST00000576691	LINC01554	Q52M75	96 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TBCD-223	ENST00000576691	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
TBCD-223	ENST00000576691	KRTAP19-6	Q3LI70	58 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TBCD-223	ENST00000576691		A6NN06	94 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TBCD-223	ENST00000576691	PLAC4	Q8WY50	150 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TBCD-223	ENST00000576691	SPATA8	Q6RVD6	105 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TBCD-223	ENST00000576691	UQCR11	O14957	56 aa		7.25	□□□□□ -1.25
TBCD-223	ENST00000576691	PSPHP1	O15172	72 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TBCD-223	ENST00000576691		A0A0D9SG42	100 aa		7.17	□□□□□ -1.26
TBCD-223	ENST00000576691	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		7.17	□□□□□ -1.26
TBCD-223	ENST00000576691	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		7.11	□□□□□ -1.27
TBCD-223	ENST00000576691		A8MU10	97 aa		7.09	□□□□□ -1.27
TBCD-223	ENST00000576691	KRTAP10-5	P60370	271 aa		7.09	□□□□□ -1.27
TBCD-223	ENST00000576691	PRO2289	Q9P1D8	64 aa		7.08	□□□□□ -1.28
TBCD-223	ENST00000576691	KRTAP12-1	P59990	96 aa		7.07	□□□□□ -1.28
TBCD-223	ENST00000576691		A6NED7	52 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TBCD-223	ENST00000576691	SPINT4	Q6UDR6	99 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TBCD-223	ENST00000576691	KRTAP12-2	P59991	146 aa		7.01	□□□□□ -1.29
TBCD-223	ENST00000576691	MT1X	P80297	61 aa		7.01	□□□□□ -1.29
TBCD-223	ENST00000576691	CAMK2N1	Q7Z7J9	78 aa		7.01	□□□□□ -1.29
TBCD-223	ENST00000576691	NEB	P20929	6669 aa		6.93	□□□□□ -1.3
TBCD-223	ENST00000576691		K7ERS5	55 aa		6.92	□□□□□ -1.3
TBCD-223	ENST00000576691	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		6.89	□□□□□ -1.31
TBCD-223	ENST00000576691	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		6.88	□□□□□ -1.31
TBCD-223	ENST00000576691	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		6.81	□□□□□ -1.32
TBCD-223	ENST00000576691	KRTAP5-9	P26371	169 aa		6.7	□□□□□ -1.34
TBCD-223	ENST00000576691	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		6.7	□□□□□ -1.34
TBCD-223	ENST00000576691	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	6.69	□□□□□ -1.34
TBCD-223	ENST00000576691	KRTAP10-12	P60413	245 aa		6.69	□□□□□ -1.34
TBCD-223	ENST00000576691	MDN1	Q9NU22	5596 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TBCD-223	ENST00000576691	KMT2D	O14686	5537 aa		6.66	□□□□□ -1.34
TBCD-223	ENST00000576691	BRK1	Q8WUW1	75 aa		6.65	□□□□□ -1.34
TBCD-223	ENST00000576691	TNP1	P09430	55 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TBCD-223	ENST00000576691	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		6.54	□□□□□ -1.36
TBCD-223	ENST00000576691	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		6.54	□□□□□ -1.36
TBCD-223	ENST00000576691	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		6.54	□□□□□ -1.36
TBCD-223	ENST00000576691	ROMO1	P60602	79 aa		6.52	□□□□□ -1.37
TBCD-223	ENST00000576691	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		6.51	□□□□□ -1.37
TBCD-223	ENST00000576691	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		6.51	□□□□□ -1.37
TBCD-223	ENST00000576691	KRTAP8-1	Q8IUC2	63 aa		6.5	□□□□□ -1.37
TBCD-223	ENST00000576691	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		6.43	□□□□□ -1.38
TBCD-223	ENST00000576691	SPRR2E	P22531	72 aa		6.41	□□□□□ -1.38
TBCD-223	ENST00000576691	SPRR2B	P35325	72 aa		6.41	□□□□□ -1.38
TBCD-223	ENST00000576691	SPRR2A	P35326	72 aa		6.41	□□□□□ -1.38
TBCD-223	ENST00000576691	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		6.37	□□□□□ -1.39
TBCD-223	ENST00000576691	LCE3A	Q5TA76	89 aa		6.35	□□□□□ -1.39
TBCD-223	ENST00000576691	PRO0628	Q9UI54	55 aa		6.34	□□□□□ -1.39
TBCD-223	ENST00000576691	PMAIP1	Q13794	54 aa		6.32	□□□□□ -1.4
TBCD-223	ENST00000576691	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		6.31	□□□□□ -1.4

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.2 ms