RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BAALC-AS2P0C853 105 aa3.8□□□□□ -1.8
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HIST3H2BBQ8N257 126 aa3.8□□□□□ -1.8
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C14orf144Q96I85 54 aa3.8□□□□□ -1.8
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 K7ERJ3 54 aa3.79□□□□□ -1.8
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MT1EP04732 61 aa3.79□□□□□ -1.8
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FXYD2P54710 66 aa3.79□□□□□ -1.8
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa3.79□□□□□ -1.8
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.79□□□□□ -1.8
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A1B0GW54 56 aa3.78□□□□□ -1.8
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 M0QZ58 72 aa3.78□□□□□ -1.8
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NDUFC1O43677 76 aa3.78□□□□□ -1.8
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 Q8N9L7 120 aa3.78□□□□□ -1.8
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DLEU1O43261 78 aa3.76□□□□□ -1.81
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HIGD1BQ9P298 99 aa3.76□□□□□ -1.81
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C14orf132Q9NPU4 83 aa3.75□□□□□ -1.81
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BPY2O14599 106 aa3.74□□□□□ -1.81
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SCGB1C2P0DMR2 95 aa3.74□□□□□ -1.81
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PAM16Q9Y3D7 125 aa3.74□□□□□ -1.81
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 P0C880 135 aa3.72□□□□□ -1.81
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 K7EP34 96 aa3.71□□□□□ -1.82
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HIST1H2BLQ99880 126 aa3.71□□□□□ -1.82
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MT1GP13640 62 aa3.7□□□□□ -1.82
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 S100A2P29034 98 aa3.7□□□□□ -1.82
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PP632Q6XCG6 107 aa3.69□□□□□ -1.82
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.68□□□□□ -1.82
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.67□□□□□ -1.82
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MT1MQ8N339 61 aa3.67□□□□□ -1.82
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPATA45Q537H7 98 aa3.66□□□□□ -1.82
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MUC5ACP98088 5654 aa3.65□□□□□ -1.82
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BATFQ16520 125 aa3.65□□□□□ -1.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa3.64□□□□□ -1.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 S100A1P23297 94 aa3.62□□□□□ -1.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C20orf197Q8N268 126 aa3.62□□□□□ -1.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ATXN8Q156A1 80 aa3.61□□□□□ -1.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa3.58□□□□□ -1.84
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 VAMP8Q9BV40 100 aa3.58□□□□□ -1.84
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MT-ATP8P03928 68 aa3.57□□□□□ -1.84
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HSD52Q0P140 79 aa3.57□□□□□ -1.84
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ACYP1P07311 99 aa3.56□□□□□ -1.84
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa3.56□□□□□ -1.84
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A1W2PPM0 123 aa3.55□□□□□ -1.84
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa3.55□□□□□ -1.84
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa3.53□□□□□ -1.84
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MT1LQ93083 61 aa3.52□□□□□ -1.85
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 S100A6P06703 90 aa3.5□□□□□ -1.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.5□□□□□ -1.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa3.48□□□□□ -1.85
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TSTD3H0UI37 97 aa3.43□□□□□ -1.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPCS1Q9Y6A9 102 aa3.4□□□□□ -1.87
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UBL5Q9BZL1 73 aa3.37□□□□□ -1.87
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.3□□□□□ -1.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 H3BT86 120 aa3.3□□□□□ -1.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ATOX1O00244 68 aa3.27□□□□□ -1.89
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PCP4P48539 62 aa3.27□□□□□ -1.89
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C10orf95Q9H7T3 257 aa3.27□□□□□ -1.89
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PCP4L1A6NKN8 68 aa3.26□□□□□ -1.89
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SMIM6P0DI80 62 aa3.26□□□□□ -1.89
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UQCRQO14949 82 aa3.24□□□□□ -1.89
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PYY3Q5JQD4 70 aa3.23□□□□□ -1.89
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LINC00208Q96KT6 92 aa3.23□□□□□ -1.89
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LCE3AQ5TA76 89 aa3.19□□□□□ -1.9
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 M0R143 59 aa3.18□□□□□ -1.9
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TAX1BP3O14907 124 aa3.16□□□□□ -1.9
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DMAC1Q96GE9 116 aa3.16□□□□□ -1.9
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPINT4Q6UDR6 99 aa3.1□□□□□ -1.91
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa3.09□□□□□ -1.91
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MP68P56378 58 aa3.08□□□□□ -1.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C9orf118A6NHY6 69 aa3.07□□□□□ -1.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRAV7A0A075B6U4 112 aa3.06□□□□□ -1.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SEC61GP60059 68 aa3.06□□□□□ -1.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPTSSBQ8NFR3 76 aa3.06□□□□□ -1.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A1B0GV90 55 aa3.05□□□□□ -1.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRTAP12-3P60328 96 aa3.04□□□□□ -1.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.04□□□□□ -1.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.03□□□□□ -1.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.02□□□□□ -1.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa3.01□□□□□ -1.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ACYP2P14621 99 aa2.99□□□□□ -1.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa2.99□□□□□ -1.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa2.98□□□□□ -1.93
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