RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531474.2

NXF1-209, Transcript of nuclear RNA export factor 1, human

TSL 3

Gene NXF1, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NXF1-209	ENST00000531474	COA5	Q86WW8	74 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NXF1-209	ENST00000531474	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NXF1-209	ENST00000531474	C4orf26	Q17RF5	130 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NXF1-209	ENST00000531474	DMAC1	Q96GE9	116 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NXF1-209	ENST00000531474		A8MUN3	132 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NXF1-209	ENST00000531474	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NXF1-209	ENST00000531474	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
NXF1-209	ENST00000531474	CHKB-CPT1B	H3BT56	60 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NXF1-209	ENST00000531474	RPL37	P61927	97 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
NXF1-209	ENST00000531474	ATP11AUN	Q6ZP68	121 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NXF1-209	ENST00000531474	RNF213	Q63HN8	5207 aa		5.03	□□□□□ -1.6
NXF1-209	ENST00000531474	SPINK7	P58062	85 aa		5	□□□□□ -1.61
NXF1-209	ENST00000531474	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		5	□□□□□ -1.61
NXF1-209	ENST00000531474	MUC17	Q685J3	4493 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NXF1-209	ENST00000531474	SPTSSB	Q8NFR3	76 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NXF1-209	ENST00000531474	KRTAP4-1	Q9BYQ7	146 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NXF1-209	ENST00000531474	PSPHP1	O15172	72 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NXF1-209	ENST00000531474	PRR15L	Q9BU68	103 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NXF1-209	ENST00000531474	LCE3B	Q5TA77	95 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NXF1-209	ENST00000531474		Q5VV11	94 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NXF1-209	ENST00000531474	COX6B2	Q6YFQ2	88 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NXF1-209	ENST00000531474	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NXF1-209	ENST00000531474	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NXF1-209	ENST00000531474	PRO0628	Q9UI54	55 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NXF1-209	ENST00000531474	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NXF1-209	ENST00000531474	SEC61G	P60059	68 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NXF1-209	ENST00000531474	BRK1	Q8WUW1	75 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NXF1-209	ENST00000531474	MUC2	Q02817	5179 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NXF1-209	ENST00000531474		A0A1B0GU69	56 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NXF1-209	ENST00000531474		A6NED7	52 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NXF1-209	ENST00000531474	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NXF1-209	ENST00000531474	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NXF1-209	ENST00000531474	RBM12B-AS1	Q9P1G2	102 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NXF1-209	ENST00000531474	UQCR11	O14957	56 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NXF1-209	ENST00000531474	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NXF1-209	ENST00000531474	KRTAP19-2	Q3LHN2	52 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NXF1-209	ENST00000531474	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NXF1-209	ENST00000531474	H1FX-AS1	Q4G0G2	97 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NXF1-209	ENST00000531474	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NXF1-209	ENST00000531474		S4R3F8	94 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NXF1-209	ENST00000531474	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NXF1-209	ENST00000531474	SPATA8	Q6RVD6	105 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NXF1-209	ENST00000531474	LCA10	Q71F78	164 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NXF1-209	ENST00000531474	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NXF1-209	ENST00000531474	MT1H	P80294	61 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NXF1-209	ENST00000531474		A0A1B0GU33	70 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NXF1-209	ENST00000531474		M0R2T5	61 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NXF1-209	ENST00000531474	PMAIP1	Q13794	54 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NXF1-209	ENST00000531474	CSAG1	Q6PB30	78 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NXF1-209	ENST00000531474		A8MU10	97 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NXF1-209	ENST00000531474	FLG	P20930	4061 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NXF1-209	ENST00000531474		H0YAA0	97 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NXF1-209	ENST00000531474	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NXF1-209	ENST00000531474	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NXF1-209	ENST00000531474	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NXF1-209	ENST00000531474		A6NN06	94 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NXF1-209	ENST00000531474		K7ERS5	55 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NXF1-209	ENST00000531474	ADM2	Q7Z4H4	148 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NXF1-209	ENST00000531474	KRTAP19-1	Q8IUB9	90 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NXF1-209	ENST00000531474		M0QZ58	72 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NXF1-209	ENST00000531474	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NXF1-209	ENST00000531474	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.5	□□□□□ -1.69
NXF1-209	ENST00000531474	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		4.5	□□□□□ -1.69
NXF1-209	ENST00000531474		P0C880	135 aa		4.48	□□□□□ -1.69
NXF1-209	ENST00000531474	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		4.47	□□□□□ -1.69
NXF1-209	ENST00000531474	MT2A	P02795	61 aa		4.45	□□□□□ -1.7
NXF1-209	ENST00000531474	MT1F	P04733	61 aa		4.42	□□□□□ -1.7
NXF1-209	ENST00000531474	KRTAP10-10	P60014	251 aa		4.42	□□□□□ -1.7
NXF1-209	ENST00000531474	KRTAP13-4	Q3LI77	160 aa		4.41	□□□□□ -1.7
NXF1-209	ENST00000531474		R4GN34	69 aa		4.4	□□□□□ -1.71
NXF1-209	ENST00000531474		A0A0D9SG42	100 aa		4.39	□□□□□ -1.71
NXF1-209	ENST00000531474	CRIPT	Q9P021	101 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NXF1-209	ENST00000531474	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		4.32	□□□□□ -1.72
NXF1-209	ENST00000531474	KRTAP12-1	P59990	96 aa		4.31	□□□□□ -1.72
NXF1-209	ENST00000531474	ROMO1	P60602	79 aa		4.31	□□□□□ -1.72
NXF1-209	ENST00000531474	SPINT4	Q6UDR6	99 aa		4.31	□□□□□ -1.72
NXF1-209	ENST00000531474	PRAC1	Q96KF2	57 aa		4.3	□□□□□ -1.72
NXF1-209	ENST00000531474	KRTAP12-2	P59991	146 aa		4.28	□□□□□ -1.72
NXF1-209	ENST00000531474	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.28	□□□□□ -1.72
NXF1-209	ENST00000531474	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.26	□□□□□ -1.73
NXF1-209	ENST00000531474	LINC01554	Q52M75	96 aa		4.26	□□□□□ -1.73
NXF1-209	ENST00000531474	USH2A	O75445	5202 aa		4.23	□□□□□ -1.73
NXF1-209	ENST00000531474	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NXF1-209	ENST00000531474	CRCT1	Q9UGL9	99 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NXF1-209	ENST00000531474	SPRR2G	Q9BYE4	73 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NXF1-209	ENST00000531474	FSIP2	Q5CZC0	6907 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NXF1-209	ENST00000531474	CAMK2N1	Q7Z7J9	78 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NXF1-209	ENST00000531474	KRTAP19-8	Q3LI54	63 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NXF1-209	ENST00000531474	SSPO	A2VEC9	5147 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NXF1-209	ENST00000531474	MT1B	P07438	61 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NXF1-209	ENST00000531474	PLAC4	Q8WY50	150 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NXF1-209	ENST00000531474	KRTAP19-6	Q3LI70	58 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NXF1-209	ENST00000531474	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NXF1-209	ENST00000531474	PP632	Q6XCG6	107 aa		4.02	□□□□□ -1.77
NXF1-209	ENST00000531474	FCGBP	Q9Y6R7	5405 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
NXF1-209	ENST00000531474	NDUFAF8	A1L188	74 aa		4	□□□□□ -1.77
NXF1-209	ENST00000531474	TNP1	P09430	55 aa		4	□□□□□ -1.77
NXF1-209	ENST00000531474	KRTAP10-5	P60370	271 aa		3.97	□□□□□ -1.77
NXF1-209	ENST00000531474	LCE4A	Q5TA78	99 aa		3.93	□□□□□ -1.78
NXF1-209	ENST00000531474	PRO2289	Q9P1D8	64 aa		3.92	□□□□□ -1.78

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