RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517083.1

RNU6-548P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 548, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-548P, Length 115 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-548P-201ENST00000517083 CASC2Q6XLA1 102 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-548P-201ENST00000517083 A0A096LNJ9 63 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-548P-201ENST00000517083 DPM2O94777 84 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-548P-201ENST00000517083 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-548P-201ENST00000517083 SEC11CQ9BY50 192 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-548P-201ENST00000517083 E9PLD3 99 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-548P-201ENST00000517083 H3BQ85 93 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-548P-201ENST00000517083 DNAL4O96015 105 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-548P-201ENST00000517083 IGKCP01834 107 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-548P-201ENST00000517083 SRP19P09132 144 aaKnown RBP0.41□□□□□ -2.34
RNU6-548P-201ENST00000517083 H0YGX0 51 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-548P-201ENST00000517083 MT-ND4LP03901 98 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-548P-201ENST00000517083 TNP1P09430 55 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-548P-201ENST00000517083 C9JAW5 83 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-548P-201ENST00000517083 RGS21Q2M5E4 152 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-548P-201ENST00000517083 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-548P-201ENST00000517083 HIST1H4GQ99525 98 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-548P-201ENST00000517083 PMCHL2Q9BQD1 86 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-548P-201ENST00000517083 ORMDL1Q9P0S3 153 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-548P-201ENST00000517083 A0A1B0GX51 115 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-548P-201ENST00000517083 SMLR1H3BR10 107 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-548P-201ENST00000517083 HSBP1O75506 76 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-548P-201ENST00000517083 LEPROTL1O95214 131 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-548P-201ENST00000517083 NREPQ16612 68 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-548P-201ENST00000517083 COX19Q49B96 90 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-548P-201ENST00000517083 PET117Q6UWS5 81 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-548P-201ENST00000517083 C18orf32Q8TCD1 76 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-548P-201ENST00000517083 YPEL4Q96NS1 127 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRAV22A0A0B4J277 110 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-548P-201ENST00000517083 PEA15Q15121 130 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPINT4Q6UDR6 99 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC51BQ86UW2 128 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-548P-201ENST00000517083 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP0.37□□□□□ -2.35
RNU6-548P-201ENST00000517083 A0A1B0GW54 56 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-548P-201ENST00000517083 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-548P-201ENST00000517083 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-548P-201ENST00000517083 HIGD1BQ9P298 99 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-548P-201ENST00000517083 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-548P-201ENST00000517083 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-548P-201ENST00000517083 BPY2O14599 106 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-548P-201ENST00000517083 KRTDAPP60985 99 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-548P-201ENST00000517083 UBE2V1Q13404 147 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-548P-201ENST00000517083 LCE3CQ5T5A8 94 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-548P-201ENST00000517083 TTTY13Q9BZ97 58 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-548P-201ENST00000517083 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-548P-201ENST00000517083 BAALC-AS2P0C853 105 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-548P-201ENST00000517083 FABP4P15090 132 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-548P-201ENST00000517083 SCGB1A1P11684 91 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-548P-201ENST00000517083 ACYP2P14621 99 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRAV7A0A075B6U4 112 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-548P-201ENST00000517083 SNAPINO95295 136 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-548P-201ENST00000517083 Q8N9L7 120 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPTSSBQ8NFR3 76 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-548P-201ENST00000517083 TSTD3H0UI37 97 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-548P-201ENST00000517083 LINC01545Q5VT33 79 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-548P-201ENST00000517083 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-548P-201ENST00000517083 COX6CP09669 75 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-548P-201ENST00000517083 PSMB2P49721 201 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-548P-201ENST00000517083 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-548P-201ENST00000517083 ATOX1O00244 68 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-548P-201ENST00000517083 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-548P-201ENST00000517083 LINC00208Q96KT6 92 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-548P-201ENST00000517083 A0A0B4J2C4 111 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRIAP1O43715 76 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-548P-201ENST00000517083 LCE3EQ5T5B0 92 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-548P-201ENST00000517083 H0Y9P7 68 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-548P-201ENST00000517083 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-548P-201ENST00000517083 C14orf132Q9NPU4 83 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-548P-201ENST00000517083 A8MU10 97 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-548P-201ENST00000517083 HSBP1L1C9JCN9 74 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-548P-201ENST00000517083 SCGB1C2P0DMR2 95 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-548P-201ENST00000517083 KRTAP12-1P59990 96 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-548P-201ENST00000517083 PRO1854Q9UHT4 67 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPCS1Q9Y6A9 102 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-548P-201ENST00000517083 ATOH7Q8N100 152 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-548P-201ENST00000517083 HIST1H2BLQ99880 126 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM218A2RU14 115 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-548P-201ENST00000517083 H7BZZ5 65 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-548P-201ENST00000517083 SEC61GP60059 68 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-548P-201ENST00000517083 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP0.24□□□□□ -2.37
RNU6-548P-201ENST00000517083 CLLU1Q5K131 121 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPATA8Q6RVD6 105 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-548P-201ENST00000517083 DMAC1Q96GE9 116 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-548P-201ENST00000517083 UQCRQO14949 82 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-548P-201ENST00000517083 ATXN8Q156A1 80 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-548P-201ENST00000517083 HIST3H2BBQ8N257 126 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-548P-201ENST00000517083 UBL5Q9BZL1 73 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-548P-201ENST00000517083 SERP1Q9Y6X1 66 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-548P-201ENST00000517083 SMIM26A0A096LP01 95 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-548P-201ENST00000517083 MP68P56378 58 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-548P-201ENST00000517083 VAMP8Q9BV40 100 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-548P-201ENST00000517083 LCE3DQ9BYE3 92 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-548P-201ENST00000517083 A0A1B0GU33 70 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPATA45Q537H7 98 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-548P-201ENST00000517083 SERP2Q8N6R1 65 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-548P-201ENST00000517083 K7ERJ3 54 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-548P-201ENST00000517083 TAX1BP3O14907 124 aa0.17□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms