RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490575.1

PTPRVP-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRVP, Length 953 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-202ENST00000490575 MP68P56378 58 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRVP-202ENST00000490575 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRVP-202ENST00000490575 LINC00208Q96KT6 92 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRVP-202ENST00000490575 TRAV7A0A075B6U4 112 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRVP-202ENST00000490575 CSAG1Q6PB30 78 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRVP-202ENST00000490575 SVIPQ8NHG7 77 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRVP-202ENST00000490575 H3BPC8 53 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRVP-202ENST00000490575 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRVP-202ENST00000490575 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRVP-202ENST00000490575 SERP2Q8N6R1 65 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRVP-202ENST00000490575 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRVP-202ENST00000490575 MT1BP07438 61 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRVP-202ENST00000490575 SPRR2GQ9BYE4 73 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRVP-202ENST00000490575 A8MUN3 132 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRVP-202ENST00000490575 COX7CP15954 63 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRVP-202ENST00000490575 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRVP-202ENST00000490575 C20orf197Q8N268 126 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRVP-202ENST00000490575 NDUFC1O43677 76 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRVP-202ENST00000490575 ANAPC13Q9BS18 74 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRVP-202ENST00000490575 SNURFQ9Y675 71 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRVP-202ENST00000490575 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRVP-202ENST00000490575 DMAC1Q96GE9 116 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRVP-202ENST00000490575 H0YAA0 97 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRVP-202ENST00000490575 Q5VV11 94 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRVP-202ENST00000490575 ADM2Q7Z4H4 148 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRVP-202ENST00000490575 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRVP-202ENST00000490575 CRIPTQ9P021 101 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRVP-202ENST00000490575 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRVP-202ENST00000490575 P0C880 135 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRVP-202ENST00000490575 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRVP-202ENST00000490575 CCDC179H3BU77 68 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRVP-202ENST00000490575 ACYP2P14621 99 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRVP-202ENST00000490575 KRTAP10-5P60370 271 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRVP-202ENST00000490575 A6NN06 94 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRVP-202ENST00000490575 H7BZZ5 65 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRVP-202ENST00000490575 CYSTM1Q9H1C7 97 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRVP-202ENST00000490575 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRVP-202ENST00000490575 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRVP-202ENST00000490575 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
PTPRVP-202ENST00000490575 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRVP-202ENST00000490575 R4GN34 69 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRVP-202ENST00000490575 M0QZ58 72 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRVP-202ENST00000490575 MT1XP80297 61 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRVP-202ENST00000490575 TMEM258P61165 79 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRVP-202ENST00000490575 COA5Q86WW8 74 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRVP-202ENST00000490575 PCP4P48539 62 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRVP-202ENST00000490575 LINC01554Q52M75 96 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRVP-202ENST00000490575 PLAC4Q8WY50 150 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRVP-202ENST00000490575 KMT2DO14686 5537 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRVP-202ENST00000490575 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRVP-202ENST00000490575 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRVP-202ENST00000490575 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRVP-202ENST00000490575 KRTAP5-9P26371 169 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRVP-202ENST00000490575 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRVP-202ENST00000490575 SEC61GP60059 68 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRVP-202ENST00000490575 NEBP20929 6669 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRVP-202ENST00000490575 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRVP-202ENST00000490575 KRTAP12-2P59991 146 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRVP-202ENST00000490575 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRVP-202ENST00000490575 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRVP-202ENST00000490575 A0A1B0GU69 56 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRVP-202ENST00000490575 H3BS24 57 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRVP-202ENST00000490575 MDN1Q9NU22 5596 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRVP-202ENST00000490575 KRTAP10-12P60413 245 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRVP-202ENST00000490575 SPATA8Q6RVD6 105 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRVP-202ENST00000490575 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRVP-202ENST00000490575 SPRR2FQ96RM1 72 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRVP-202ENST00000490575 PRR15LQ9BU68 103 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRVP-202ENST00000490575 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRVP-202ENST00000490575 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRVP-202ENST00000490575 A0A0D9SG42 100 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRVP-202ENST00000490575 A0A1B0GU33 70 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRVP-202ENST00000490575 V9GYY9 64 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRVP-202ENST00000490575 SMIM26A0A096LP01 95 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRVP-202ENST00000490575 Q1T7F1 81 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRVP-202ENST00000490575 SPRR2EP22531 72 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRVP-202ENST00000490575 SPRR2BP35325 72 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRVP-202ENST00000490575 SPRR2AP35326 72 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRVP-202ENST00000490575 KRTAP12-1P59990 96 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRVP-202ENST00000490575 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRVP-202ENST00000490575 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRVP-202ENST00000490575 A8MU10 97 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRVP-202ENST00000490575 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRVP-202ENST00000490575 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRVP-202ENST00000490575 UQCR11O14957 56 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRVP-202ENST00000490575 PSPHP1O15172 72 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRVP-202ENST00000490575 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRVP-202ENST00000490575 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRVP-202ENST00000490575 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRVP-202ENST00000490575 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRVP-202ENST00000490575 SPRR2DP22532 72 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRVP-202ENST00000490575 A6NED7 52 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRVP-202ENST00000490575 C10orf95Q9H7T3 257 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRVP-202ENST00000490575 MT1EP04732 61 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRVP-202ENST00000490575 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRVP-202ENST00000490575 K7ERS5 55 aa6□□□□□ -1.45
PTPRVP-202ENST00000490575 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRVP-202ENST00000490575 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRVP-202ENST00000490575 LCE3BQ5TA77 95 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRVP-202ENST00000490575 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.97□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.8 ms