RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488186.5

C9orf3-219, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 5

Gene C9orf3, Length 1,211 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-219ENST00000488186 MT2AP02795 61 aa7.5□□□□□ -1.21
C9orf3-219ENST00000488186 SNURFQ9Y675 71 aa7.48□□□□□ -1.21
C9orf3-219ENST00000488186 C20orf197Q8N268 126 aa7.47□□□□□ -1.21
C9orf3-219ENST00000488186 NDUFC1O43677 76 aa7.46□□□□□ -1.22
C9orf3-219ENST00000488186 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa7.45□□□□□ -1.22
C9orf3-219ENST00000488186 MT1FP04733 61 aa7.44□□□□□ -1.22
C9orf3-219ENST00000488186 DMAC1Q96GE9 116 aa7.41□□□□□ -1.22
C9orf3-219ENST00000488186 CRCT1Q9UGL9 99 aa7.4□□□□□ -1.22
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C9orf3-219ENST00000488186 FSIP2Q5CZC0 6907 aa7.39□□□□□ -1.23
C9orf3-219ENST00000488186 ACYP2P14621 99 aa7.38□□□□□ -1.23
C9orf3-219ENST00000488186 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa7.36□□□□□ -1.23
C9orf3-219ENST00000488186 ANAPC13Q9BS18 74 aa7.35□□□□□ -1.23
C9orf3-219ENST00000488186 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa7.31□□□□□ -1.24
C9orf3-219ENST00000488186 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa7.28□□□□□ -1.24
C9orf3-219ENST00000488186 SPTSSBQ8NFR3 76 aa7.26□□□□□ -1.25
C9orf3-219ENST00000488186 USH2AO75445 5202 aa7.24□□□□□ -1.25
C9orf3-219ENST00000488186 LOC100996750A0A140TA64 210 aa7.22□□□□□ -1.25
C9orf3-219ENST00000488186 H0YAA0 97 aa7.22□□□□□ -1.25
C9orf3-219ENST00000488186 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa7.22□□□□□ -1.25
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C9orf3-219ENST00000488186 H7BZZ5 65 aa7.17□□□□□ -1.26
C9orf3-219ENST00000488186 CRIPTQ9P021 101 aa7.16□□□□□ -1.26
C9orf3-219ENST00000488186 CCDC179H3BU77 68 aa7.14□□□□□ -1.27
C9orf3-219ENST00000488186 CYSTM1Q9H1C7 97 aa7.14□□□□□ -1.27
C9orf3-219ENST00000488186 SSPOA2VEC9 5147 aa7.13□□□□□ -1.27
C9orf3-219ENST00000488186 COA5Q86WW8 74 aa7.1□□□□□ -1.27
C9orf3-219ENST00000488186 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa7.08□□□□□ -1.28
C9orf3-219ENST00000488186 SPRR2GQ9BYE4 73 aa7.07□□□□□ -1.28
C9orf3-219ENST00000488186 P0C880 135 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf3-219ENST00000488186 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf3-219ENST00000488186 Q5VV11 94 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf3-219ENST00000488186 R4GN34 69 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf3-219ENST00000488186 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
C9orf3-219ENST00000488186 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
C9orf3-219ENST00000488186 M0QZ58 72 aa6.97□□□□□ -1.29
C9orf3-219ENST00000488186 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.96□□□□□ -1.3
C9orf3-219ENST00000488186 SEC61GP60059 68 aa6.95□□□□□ -1.3
C9orf3-219ENST00000488186 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.92□□□□□ -1.3
C9orf3-219ENST00000488186 TMEM258P61165 79 aa6.91□□□□□ -1.3
C9orf3-219ENST00000488186 MT1BP07438 61 aa6.9□□□□□ -1.3
C9orf3-219ENST00000488186 LINC01554Q52M75 96 aa6.88□□□□□ -1.31
C9orf3-219ENST00000488186 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
C9orf3-219ENST00000488186 PLAC4Q8WY50 150 aa6.85□□□□□ -1.31
C9orf3-219ENST00000488186 A6NN06 94 aa6.79□□□□□ -1.32
C9orf3-219ENST00000488186 A0A1B0GU69 56 aa6.78□□□□□ -1.32
C9orf3-219ENST00000488186 A0A1B0GU33 70 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf3-219ENST00000488186 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.72□□□□□ -1.33
C9orf3-219ENST00000488186 KRTAP10-5P60370 271 aa6.71□□□□□ -1.34
C9orf3-219ENST00000488186 PRR15LQ9BU68 103 aa6.71□□□□□ -1.34
C9orf3-219ENST00000488186 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
C9orf3-219ENST00000488186 PCP4P48539 62 aa6.7□□□□□ -1.34
C9orf3-219ENST00000488186 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.68□□□□□ -1.34
C9orf3-219ENST00000488186 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.68□□□□□ -1.34
C9orf3-219ENST00000488186 SPATA8Q6RVD6 105 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf3-219ENST00000488186 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf3-219ENST00000488186 A0A0D9SG42 100 aa6.62□□□□□ -1.35
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C9orf3-219ENST00000488186 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.55□□□□□ -1.36
C9orf3-219ENST00000488186 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa6.54□□□□□ -1.36
C9orf3-219ENST00000488186 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.53□□□□□ -1.36
C9orf3-219ENST00000488186 V9GYY9 64 aa6.53□□□□□ -1.36
C9orf3-219ENST00000488186 UQCR11O14957 56 aa6.46□□□□□ -1.38
C9orf3-219ENST00000488186 A8MU10 97 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf3-219ENST00000488186 Q1T7F1 81 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf3-219ENST00000488186 KRTAP12-1P59990 96 aa6.42□□□□□ -1.38
C9orf3-219ENST00000488186 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
C9orf3-219ENST00000488186 PSPHP1O15172 72 aa6.41□□□□□ -1.38
C9orf3-219ENST00000488186 KRTAP12-2P59991 146 aa6.38□□□□□ -1.39
C9orf3-219ENST00000488186 KRTAP5-9P26371 169 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf3-219ENST00000488186 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.34□□□□□ -1.39
C9orf3-219ENST00000488186 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
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C9orf3-219ENST00000488186 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa6.25□□□□□ -1.41
C9orf3-219ENST00000488186 A6NED7 52 aa6.24□□□□□ -1.41
C9orf3-219ENST00000488186 KRTAP10-12P60413 245 aa6.24□□□□□ -1.41
C9orf3-219ENST00000488186 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.24□□□□□ -1.41
C9orf3-219ENST00000488186 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.23□□□□□ -1.41
C9orf3-219ENST00000488186 K7ERS5 55 aa6.23□□□□□ -1.41
C9orf3-219ENST00000488186 LCE3BQ5TA77 95 aa6.22□□□□□ -1.41
C9orf3-219ENST00000488186 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf3-219ENST00000488186 NEBP20929 6669 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf3-219ENST00000488186 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.15□□□□□ -1.42
C9orf3-219ENST00000488186 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.15□□□□□ -1.42
C9orf3-219ENST00000488186 SPRR2FQ96RM1 72 aa6.14□□□□□ -1.43
C9orf3-219ENST00000488186 C10orf95Q9H7T3 257 aa6.11□□□□□ -1.43
C9orf3-219ENST00000488186 MDN1Q9NU22 5596 aa6.09□□□□□ -1.43
C9orf3-219ENST00000488186 TNP1P09430 55 aa6.09□□□□□ -1.43
C9orf3-219ENST00000488186 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.99□□□□□ -1.45
C9orf3-219ENST00000488186 SPRR2EP22531 72 aa5.97□□□□□ -1.45
C9orf3-219ENST00000488186 SPRR2BP35325 72 aa5.97□□□□□ -1.45
C9orf3-219ENST00000488186 SPRR2AP35326 72 aa5.97□□□□□ -1.45
C9orf3-219ENST00000488186 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.96□□□□□ -1.46
C9orf3-219ENST00000488186 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.91□□□□□ -1.46
C9orf3-219ENST00000488186 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.9□□□□□ -1.46
C9orf3-219ENST00000488186 LCE3AQ5TA76 89 aa5.88□□□□□ -1.47
C9orf3-219ENST00000488186 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.86□□□□□ -1.47
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