RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486204.5

SSR4-211, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

TSL 3

Gene SSR4, Length 658 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-211ENST00000486204 IMUPQ9GZP8 106 aa6.14□□□□□ -1.43
SSR4-211ENST00000486204 LINC00208Q96KT6 92 aa6.11□□□□□ -1.43
SSR4-211ENST00000486204 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.1□□□□□ -1.43
SSR4-211ENST00000486204 MP68P56378 58 aa6.08□□□□□ -1.44
SSR4-211ENST00000486204 KLKP1Q107X0 134 aa6.08□□□□□ -1.44
SSR4-211ENST00000486204 C5orf47Q569G3 176 aa6.08□□□□□ -1.44
SSR4-211ENST00000486204 S4R3F8 94 aa6.08□□□□□ -1.44
SSR4-211ENST00000486204 LCA10Q71F78 164 aa6.07□□□□□ -1.44
SSR4-211ENST00000486204 SCGB1A1P11684 91 aa6.06□□□□□ -1.44
SSR4-211ENST00000486204 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa6.05□□□□□ -1.44
SSR4-211ENST00000486204 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.05□□□□□ -1.44
SSR4-211ENST00000486204 H3BPC8 53 aa6.04□□□□□ -1.44
SSR4-211ENST00000486204 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.04□□□□□ -1.44
SSR4-211ENST00000486204 TRAV7A0A075B6U4 112 aa5.99□□□□□ -1.45
SSR4-211ENST00000486204 CSAG1Q6PB30 78 aa5.99□□□□□ -1.45
SSR4-211ENST00000486204 A8MUN3 132 aa5.98□□□□□ -1.45
SSR4-211ENST00000486204 SMIM20Q8N5G0 67 aa5.97□□□□□ -1.45
SSR4-211ENST00000486204 PCP4P48539 62 aa5.92□□□□□ -1.46
SSR4-211ENST00000486204 DMAC1Q96GE9 116 aa5.91□□□□□ -1.46
SSR4-211ENST00000486204 NDUFC1O43677 76 aa5.88□□□□□ -1.47
SSR4-211ENST00000486204 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.86□□□□□ -1.47
SSR4-211ENST00000486204 SERP2Q8N6R1 65 aa5.86□□□□□ -1.47
SSR4-211ENST00000486204 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.86□□□□□ -1.47
SSR4-211ENST00000486204 SNURFQ9Y675 71 aa5.84□□□□□ -1.47
SSR4-211ENST00000486204 H0YAA0 97 aa5.83□□□□□ -1.48
SSR4-211ENST00000486204 SPRR2GQ9BYE4 73 aa5.82□□□□□ -1.48
SSR4-211ENST00000486204 C20orf197Q8N268 126 aa5.81□□□□□ -1.48
SSR4-211ENST00000486204 MDN1Q9NU22 5596 aa5.81□□□□□ -1.48
SSR4-211ENST00000486204 KMT2DO14686 5537 aa5.78□□□□□ -1.48
SSR4-211ENST00000486204 KRTAP5-9P26371 169 aa5.78□□□□□ -1.48
SSR4-211ENST00000486204 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa5.76□□□□□ -1.49
SSR4-211ENST00000486204 MT1BP07438 61 aa5.75□□□□□ -1.49
SSR4-211ENST00000486204 ACYP2P14621 99 aa5.75□□□□□ -1.49
SSR4-211ENST00000486204 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa5.75□□□□□ -1.49
SSR4-211ENST00000486204 A6NN06 94 aa5.74□□□□□ -1.49
SSR4-211ENST00000486204 COX7CP15954 63 aa5.74□□□□□ -1.49
SSR4-211ENST00000486204 ADM2Q7Z4H4 148 aa5.74□□□□□ -1.49
SSR4-211ENST00000486204 CRIPTQ9P021 101 aa5.74□□□□□ -1.49
SSR4-211ENST00000486204 ANAPC13Q9BS18 74 aa5.7□□□□□ -1.5
SSR4-211ENST00000486204 Q5VV11 94 aa5.69□□□□□ -1.5
SSR4-211ENST00000486204 P0C880 135 aa5.68□□□□□ -1.5
SSR4-211ENST00000486204 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa5.68□□□□□ -1.5
SSR4-211ENST00000486204 CYSTM1Q9H1C7 97 aa5.68□□□□□ -1.5
SSR4-211ENST00000486204 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa5.63□□□□□ -1.51
SSR4-211ENST00000486204 H7BZZ5 65 aa5.63□□□□□ -1.51
SSR4-211ENST00000486204 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.63□□□□□ -1.51
SSR4-211ENST00000486204 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.63□□□□□ -1.51
SSR4-211ENST00000486204 SPTSSBQ8NFR3 76 aa5.62□□□□□ -1.51
SSR4-211ENST00000486204 COA5Q86WW8 74 aa5.57□□□□□ -1.52
SSR4-211ENST00000486204 R4GN34 69 aa5.57□□□□□ -1.52
SSR4-211ENST00000486204 CCDC179H3BU77 68 aa5.56□□□□□ -1.52
SSR4-211ENST00000486204 SPRR2EP22531 72 aa5.56□□□□□ -1.52
SSR4-211ENST00000486204 SPRR2BP35325 72 aa5.56□□□□□ -1.52
SSR4-211ENST00000486204 SPRR2AP35326 72 aa5.56□□□□□ -1.52
SSR4-211ENST00000486204 KRTAP10-5P60370 271 aa5.55□□□□□ -1.52
SSR4-211ENST00000486204 M0QZ58 72 aa5.54□□□□□ -1.52
SSR4-211ENST00000486204 GPR98Q8WXG9 6306 aa5.54□□□□□ -1.52
SSR4-211ENST00000486204 SPRR2FQ96RM1 72 aa5.49□□□□□ -1.53
SSR4-211ENST00000486204 TMEM258P61165 79 aa5.43□□□□□ -1.54
SSR4-211ENST00000486204 MT1XP80297 61 aa5.43□□□□□ -1.54
SSR4-211ENST00000486204 LINC01554Q52M75 96 aa5.43□□□□□ -1.54
SSR4-211ENST00000486204 PLAC4Q8WY50 150 aa5.42□□□□□ -1.54
SSR4-211ENST00000486204 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa5.41□□□□□ -1.54
SSR4-211ENST00000486204 SPRR2DP22532 72 aa5.39□□□□□ -1.55
SSR4-211ENST00000486204 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.39□□□□□ -1.55
SSR4-211ENST00000486204 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
SSR4-211ENST00000486204 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
SSR4-211ENST00000486204 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.35□□□□□ -1.55
SSR4-211ENST00000486204 SEC61GP60059 68 aa5.32□□□□□ -1.56
SSR4-211ENST00000486204 SERP1Q9Y6X1 66 aa5.32□□□□□ -1.56
SSR4-211ENST00000486204 LCE3BQ5TA77 95 aa5.29□□□□□ -1.56
SSR4-211ENST00000486204 A0A1B0GU33 70 aa5.26□□□□□ -1.57
SSR4-211ENST00000486204 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.26□□□□□ -1.57
SSR4-211ENST00000486204 A0A1B0GU69 56 aa5.25□□□□□ -1.57
SSR4-211ENST00000486204 KRTAP12-2P59991 146 aa5.25□□□□□ -1.57
SSR4-211ENST00000486204 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.25□□□□□ -1.57
SSR4-211ENST00000486204 A0A0D9SG42 100 aa5.19□□□□□ -1.58
SSR4-211ENST00000486204 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa5.18□□□□□ -1.58
SSR4-211ENST00000486204 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
SSR4-211ENST00000486204 KRTAP12-1P59990 96 aa5.15□□□□□ -1.59
SSR4-211ENST00000486204 KRTAP10-12P60413 245 aa5.15□□□□□ -1.59
SSR4-211ENST00000486204 SMIM26A0A096LP01 95 aa5.14□□□□□ -1.59
SSR4-211ENST00000486204 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
SSR4-211ENST00000486204 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa5.13□□□□□ -1.59
SSR4-211ENST00000486204 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.12□□□□□ -1.59
SSR4-211ENST00000486204 PRR15LQ9BU68 103 aa5.12□□□□□ -1.59
SSR4-211ENST00000486204 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.12□□□□□ -1.59
SSR4-211ENST00000486204 A8MU10 97 aa5.11□□□□□ -1.59
SSR4-211ENST00000486204 SPINT4Q6UDR6 99 aa5.1□□□□□ -1.59
SSR4-211ENST00000486204 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.1□□□□□ -1.59
SSR4-211ENST00000486204 Q1T7F1 81 aa5.01□□□□□ -1.61
SSR4-211ENST00000486204 V9GYY9 64 aa5□□□□□ -1.61
SSR4-211ENST00000486204 UQCR11O14957 56 aa4.99□□□□□ -1.61
SSR4-211ENST00000486204 PSPHP1O15172 72 aa4.92□□□□□ -1.62
SSR4-211ENST00000486204 C10orf95Q9H7T3 257 aa4.91□□□□□ -1.62
SSR4-211ENST00000486204 MIR22HGQ0VDD5 57 aa4.89□□□□□ -1.63
SSR4-211ENST00000486204 LCE1DQ5T752 114 aa4.88□□□□□ -1.63
SSR4-211ENST00000486204 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa4.86□□□□□ -1.63
SSR4-211ENST00000486204 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa4.86□□□□□ -1.63
SSR4-211ENST00000486204 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.85□□□□□ -1.63
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