RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460236.5

PHF20L1-211, Transcript of PHD finger protein 20 like 1, humanhuman

TSL 5

Gene PHF20L1, Length 3,393 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF20L1-211ENST00000460236 SPINT4Q6UDR6 99 aa3.2□□□□□ -1.9
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PHF20L1-211ENST00000460236 PCOTHQ58A44 107 aa3.19□□□□□ -1.9
PHF20L1-211ENST00000460236 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa3.19□□□□□ -1.9
PHF20L1-211ENST00000460236 CRIPTQ9P021 101 aa3.19□□□□□ -1.9
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PHF20L1-211ENST00000460236 IGKV2-30P06310 120 aa3.17□□□□□ -1.9
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PHF20L1-211ENST00000460236 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa2.99□□□□□ -1.93
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PHF20L1-211ENST00000460236 RPL37P61927 97 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
PHF20L1-211ENST00000460236 COX6B2Q6YFQ2 88 aa2.94□□□□□ -1.94
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PHF20L1-211ENST00000460236 PRO2289Q9P1D8 64 aa2.92□□□□□ -1.94
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PHF20L1-211ENST00000460236 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.69□□□□□ -1.98
PHF20L1-211ENST00000460236 FSIP2Q5CZC0 6907 aa2.69□□□□□ -1.98
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PHF20L1-211ENST00000460236 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa2.67□□□□□ -1.98
PHF20L1-211ENST00000460236 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa2.67□□□□□ -1.98
PHF20L1-211ENST00000460236 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa2.66□□□□□ -1.98
PHF20L1-211ENST00000460236 KRTAP10-10P60014 251 aa2.65□□□□□ -1.99
PHF20L1-211ENST00000460236 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa2.64□□□□□ -1.99
PHF20L1-211ENST00000460236 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa2.64□□□□□ -1.99
PHF20L1-211ENST00000460236 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
PHF20L1-211ENST00000460236 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa2.64□□□□□ -1.99
PHF20L1-211ENST00000460236 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.64□□□□□ -1.99
PHF20L1-211ENST00000460236 MT1HP80294 61 aa2.63□□□□□ -1.99
PHF20L1-211ENST00000460236 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa2.63□□□□□ -1.99
PHF20L1-211ENST00000460236 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP2.61□□□□□ -1.99
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PHF20L1-211ENST00000460236 USH2AO75445 5202 aa2.56□□□□□ -2
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PHF20L1-211ENST00000460236 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa2.56□□□□□ -2
PHF20L1-211ENST00000460236 KRTAP12-2P59991 146 aa2.55□□□□□ -2
PHF20L1-211ENST00000460236 MT1FP04733 61 aa2.54□□□□□ -2
PHF20L1-211ENST00000460236 MT2AP02795 61 aa2.53□□□□□ -2
PHF20L1-211ENST00000460236 LCE3BQ5TA77 95 aa2.52□□□□□ -2.01
PHF20L1-211ENST00000460236 KRTAP12-1P59990 96 aa2.5□□□□□ -2.01
PHF20L1-211ENST00000460236 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.46□□□□□ -2.02
PHF20L1-211ENST00000460236 PP632Q6XCG6 107 aa2.46□□□□□ -2.02
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PHF20L1-211ENST00000460236 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa2.43□□□□□ -2.02
PHF20L1-211ENST00000460236 LCE4AQ5TA78 99 aa2.43□□□□□ -2.02
PHF20L1-211ENST00000460236 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa2.42□□□□□ -2.02
PHF20L1-211ENST00000460236 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa2.42□□□□□ -2.02
PHF20L1-211ENST00000460236 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa2.4□□□□□ -2.03
PHF20L1-211ENST00000460236 LCE1DQ5T752 114 aa2.39□□□□□ -2.03
PHF20L1-211ENST00000460236 SPRR2GQ9BYE4 73 aa2.39□□□□□ -2.03
PHF20L1-211ENST00000460236 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa2.39□□□□□ -2.03
PHF20L1-211ENST00000460236 LCE1FQ5T754 118 aa2.38□□□□□ -2.03
PHF20L1-211ENST00000460236 KMT2DO14686 5537 aa2.37□□□□□ -2.03
PHF20L1-211ENST00000460236 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.37□□□□□ -2.03
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