RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460236.5

PHF20L1-211, Transcript of PHD finger protein 20 like 1, humanhuman

TSL 5

Gene PHF20L1, Length 3,393 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF20L1-211ENST00000460236 SPINT4Q6UDR6 99 aa3.2□□□□□ -1.9
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PHF20L1-211ENST00000460236 IGKV2-30P06310 120 aa3.17□□□□□ -1.9
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PHF20L1-211ENST00000460236 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa2.64□□□□□ -1.99
PHF20L1-211ENST00000460236 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
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PHF20L1-211ENST00000460236 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.64□□□□□ -1.99
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PHF20L1-211ENST00000460236 USH2AO75445 5202 aa2.56□□□□□ -2
PHF20L1-211ENST00000460236 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.56□□□□□ -2
PHF20L1-211ENST00000460236 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa2.56□□□□□ -2
PHF20L1-211ENST00000460236 KRTAP12-2P59991 146 aa2.55□□□□□ -2
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PHF20L1-211ENST00000460236 MT2AP02795 61 aa2.53□□□□□ -2
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PHF20L1-211ENST00000460236 KRTAP12-1P59990 96 aa2.5□□□□□ -2.01
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PHF20L1-211ENST00000460236 LCE4AQ5TA78 99 aa2.43□□□□□ -2.02
PHF20L1-211ENST00000460236 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa2.42□□□□□ -2.02
PHF20L1-211ENST00000460236 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa2.42□□□□□ -2.02
PHF20L1-211ENST00000460236 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa2.4□□□□□ -2.03
PHF20L1-211ENST00000460236 LCE1DQ5T752 114 aa2.39□□□□□ -2.03
PHF20L1-211ENST00000460236 SPRR2GQ9BYE4 73 aa2.39□□□□□ -2.03
PHF20L1-211ENST00000460236 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa2.39□□□□□ -2.03
PHF20L1-211ENST00000460236 LCE1FQ5T754 118 aa2.38□□□□□ -2.03
PHF20L1-211ENST00000460236 KMT2DO14686 5537 aa2.37□□□□□ -2.03
PHF20L1-211ENST00000460236 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.37□□□□□ -2.03
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