RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436638.5

ECHDC1-208, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene ECHDC1, Length 766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ECHDC1-208	ENST00000436638	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		3.64	□□□□□ -1.83
ECHDC1-208	ENST00000436638	DMAC1	Q96GE9	116 aa		3.64	□□□□□ -1.83
ECHDC1-208	ENST00000436638	FAT1	Q14517	4588 aa		3.64	□□□□□ -1.83
ECHDC1-208	ENST00000436638		Q6ZQY7	126 aa		3.63	□□□□□ -1.83
ECHDC1-208	ENST00000436638		H3BQ85	93 aa		3.62	□□□□□ -1.83
ECHDC1-208	ENST00000436638	SPRR1B	P22528	89 aa		3.62	□□□□□ -1.83
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZCCHC13	Q8WW36	166 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
ECHDC1-208	ENST00000436638	IGLV5-48	A0A075B6I7	105 aa		3.61	□□□□□ -1.83
ECHDC1-208	ENST00000436638	PDE6G	P18545	87 aa		3.61	□□□□□ -1.83
ECHDC1-208	ENST00000436638	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		3.61	□□□□□ -1.83
ECHDC1-208	ENST00000436638	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		3.6	□□□□□ -1.83
ECHDC1-208	ENST00000436638	MT3	P25713	68 aa		3.6	□□□□□ -1.83
ECHDC1-208	ENST00000436638	KRTAP10-8	P60410	259 aa		3.6	□□□□□ -1.83
ECHDC1-208	ENST00000436638	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		3.6	□□□□□ -1.83
ECHDC1-208	ENST00000436638		Q8N377	158 aa		3.6	□□□□□ -1.83
ECHDC1-208	ENST00000436638	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		3.6	□□□□□ -1.83
ECHDC1-208	ENST00000436638	NDUFAF8	A1L188	74 aa		3.59	□□□□□ -1.83
ECHDC1-208	ENST00000436638		H0Y9P7	68 aa		3.59	□□□□□ -1.83
ECHDC1-208	ENST00000436638	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		3.59	□□□□□ -1.83
ECHDC1-208	ENST00000436638	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		3.59	□□□□□ -1.83
ECHDC1-208	ENST00000436638	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ECHDC1-208	ENST00000436638	MT1HL1	P0DM35	61 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ECHDC1-208	ENST00000436638	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ECHDC1-208	ENST00000436638	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
ECHDC1-208	ENST00000436638	UQCR11	O14957	56 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ECHDC1-208	ENST00000436638	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
ECHDC1-208	ENST00000436638	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ECHDC1-208	ENST00000436638	LOC110117498	A0A087WWA1	95 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ECHDC1-208	ENST00000436638	SPINK1	P00995	79 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ECHDC1-208	ENST00000436638	SPINK7	P58062	85 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ECHDC1-208	ENST00000436638	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
ECHDC1-208	ENST00000436638	IGFL1	Q6UW32	110 aa		3.53	□□□□□ -1.84
ECHDC1-208	ENST00000436638	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
ECHDC1-208	ENST00000436638		A0A0G2JQZ4	141 aa		3.51	□□□□□ -1.85
ECHDC1-208	ENST00000436638	SPATA8	Q6RVD6	105 aa		3.51	□□□□□ -1.85
ECHDC1-208	ENST00000436638	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		3.51	□□□□□ -1.85
ECHDC1-208	ENST00000436638	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
ECHDC1-208	ENST00000436638	COA5	Q86WW8	74 aa		3.5	□□□□□ -1.85
ECHDC1-208	ENST00000436638		A0A1B0GU33	70 aa		3.49	□□□□□ -1.85
ECHDC1-208	ENST00000436638		Q5W150	140 aa		3.49	□□□□□ -1.85
ECHDC1-208	ENST00000436638	MYCBP2	O75592	4640 aa		3.48	□□□□□ -1.85
ECHDC1-208	ENST00000436638	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
ECHDC1-208	ENST00000436638	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	3.46	□□□□□ -1.85
ECHDC1-208	ENST00000436638	IGKV4-1	P06312	121 aa		3.46	□□□□□ -1.86
ECHDC1-208	ENST00000436638	SPINT4	Q6UDR6	99 aa		3.45	□□□□□ -1.86
ECHDC1-208	ENST00000436638	TNXB	P22105	4242 aa		3.44	□□□□□ -1.86
ECHDC1-208	ENST00000436638	DEFB116	Q30KQ4	102 aa		3.43	□□□□□ -1.86
ECHDC1-208	ENST00000436638	TPRXL	Q17RH7	258 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ECHDC1-208	ENST00000436638		A0A1B0GU69	56 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ECHDC1-208	ENST00000436638	C9orf92	A6NGG3	77 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ECHDC1-208	ENST00000436638	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ECHDC1-208	ENST00000436638	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ECHDC1-208	ENST00000436638	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ECHDC1-208	ENST00000436638		Q96NJ1	140 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ECHDC1-208	ENST00000436638	LINC00472	Q9H8W2	130 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ECHDC1-208	ENST00000436638	HERC1	Q15751	4861 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ECHDC1-208	ENST00000436638	DSCR10	P59022	87 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ECHDC1-208	ENST00000436638	HMCN2	Q8NDA2	5059 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ECHDC1-208	ENST00000436638	PRO2289	Q9P1D8	64 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ECHDC1-208	ENST00000436638		K7EQZ3	153 aa		3.31	□□□□□ -1.88
ECHDC1-208	ENST00000436638	RPL37	P61927	97 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
ECHDC1-208	ENST00000436638	ACYP2	P14621	99 aa		3.29	□□□□□ -1.88
ECHDC1-208	ENST00000436638	PCOTH	Q58A44	107 aa		3.29	□□□□□ -1.88
ECHDC1-208	ENST00000436638	WFDC13	Q8IUB5	93 aa		3.28	□□□□□ -1.88
ECHDC1-208	ENST00000436638		Q8N9L7	120 aa		3.28	□□□□□ -1.88
ECHDC1-208	ENST00000436638	MRPL34	Q9BQ48	92 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
ECHDC1-208	ENST00000436638	MMP24-AS1	A0A0U1RRL7	71 aa		3.27	□□□□□ -1.89
ECHDC1-208	ENST00000436638	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.27	□□□□□ -1.89
ECHDC1-208	ENST00000436638		R4GN34	69 aa		3.26	□□□□□ -1.89
ECHDC1-208	ENST00000436638	LPA	P08519	4548 aa		3.25	□□□□□ -1.89
ECHDC1-208	ENST00000436638	HRES1	P13985	223 aa		3.24	□□□□□ -1.89
ECHDC1-208	ENST00000436638	LRP2	P98164	4655 aa		3.23	□□□□□ -1.89
ECHDC1-208	ENST00000436638	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.23	□□□□□ -1.89
ECHDC1-208	ENST00000436638	KRTAP10-5	P60370	271 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ECHDC1-208	ENST00000436638	MUC17	Q685J3	4493 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ECHDC1-208	ENST00000436638	KRTAP10-12	P60413	245 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ECHDC1-208	ENST00000436638	TP53AIP1	Q9HCN2	124 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ECHDC1-208	ENST00000436638	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ECHDC1-208	ENST00000436638	KRTAP4-1	Q9BYQ7	146 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ECHDC1-208	ENST00000436638	RNF213	Q63HN8	5207 aa		3.17	□□□□□ -1.9
ECHDC1-208	ENST00000436638	COX6B2	Q6YFQ2	88 aa		3.17	□□□□□ -1.9
ECHDC1-208	ENST00000436638	INE1	O15225	51 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ECHDC1-208	ENST00000436638		M0R2T5	61 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ECHDC1-208	ENST00000436638	PLAC4	Q8WY50	150 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ECHDC1-208	ENST00000436638	KRTAP19-2	Q3LHN2	52 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECHDC1-208	ENST00000436638	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECHDC1-208	ENST00000436638	MT1H	P80294	61 aa		3.05	□□□□□ -1.92
ECHDC1-208	ENST00000436638	H1FX-AS1	Q4G0G2	97 aa		3.05	□□□□□ -1.92
ECHDC1-208	ENST00000436638	CRIPT	Q9P021	101 aa		3.05	□□□□□ -1.92
ECHDC1-208	ENST00000436638	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		3.05	□□□□□ -1.92
ECHDC1-208	ENST00000436638	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ECHDC1-208	ENST00000436638	MUC2	Q02817	5179 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ECHDC1-208	ENST00000436638		S4R3F8	94 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ECHDC1-208	ENST00000436638		H0YAA0	97 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ECHDC1-208	ENST00000436638	PP632	Q6XCG6	107 aa		2.92	□□□□□ -1.94
ECHDC1-208	ENST00000436638	KRTAP12-2	P59991	146 aa		2.9	□□□□□ -1.95
ECHDC1-208	ENST00000436638	KRTAP10-10	P60014	251 aa		2.9	□□□□□ -1.95
ECHDC1-208	ENST00000436638	FLG	P20930	4061 aa	Predicted RBP	2.89	□□□□□ -1.95
ECHDC1-208	ENST00000436638	MT2A	P02795	61 aa		2.88	□□□□□ -1.95
ECHDC1-208	ENST00000436638	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		2.88	□□□□□ -1.95

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