RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436404.6

CNGA3-205, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 2,504 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-205ENST00000436404 TNXBP22105 4242 aa9.25□□□□□ -0.93
CNGA3-205ENST00000436404 TYMSOSQ8TAI1 123 aa9.24□□□□□ -0.93
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CNGA3-205ENST00000436404 A0A1B0GU33 70 aa9.23□□□□□ -0.93
CNGA3-205ENST00000436404 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
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CNGA3-205ENST00000436404 KRTAP10-8P60410 259 aa9.18□□□□□ -0.94
CNGA3-205ENST00000436404 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa9.17□□□□□ -0.94
CNGA3-205ENST00000436404 P0C880 135 aa9.16□□□□□ -0.94
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CNGA3-205ENST00000436404 CRIPTQ9P021 101 aa9.12□□□□□ -0.95
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CNGA3-205ENST00000436404 C10orf95Q9H7T3 257 aa8.7□□□□□ -1.02
CNGA3-205ENST00000436404 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa8.69□□□□□ -1.02
CNGA3-205ENST00000436404 A0A0D9SG42 100 aa8.68□□□□□ -1.02
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CNGA3-205ENST00000436404 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa8.58□□□□□ -1.04
CNGA3-205ENST00000436404 HMCN2Q8NDA2 5059 aa8.57□□□□□ -1.04
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CNGA3-205ENST00000436404 KRTAP12-2P59991 146 aa8.46□□□□□ -1.05
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CNGA3-205ENST00000436404 KRTAP12-1P59990 96 aa8.37□□□□□ -1.07
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CNGA3-205ENST00000436404 M0QZ58 72 aa8.18□□□□□ -1.1
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CNGA3-205ENST00000436404 RNF213Q63HN8 5207 aa8.1□□□□□ -1.11
CNGA3-205ENST00000436404 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa8.01□□□□□ -1.13
CNGA3-205ENST00000436404 LCE2CQ5TA81 110 aa7.88□□□□□ -1.15
CNGA3-205ENST00000436404 FAT4Q6V0I7 4981 aa7.84□□□□□ -1.15
CNGA3-205ENST00000436404 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
CNGA3-205ENST00000436404 R4GN34 69 aa7.83□□□□□ -1.16
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CNGA3-205ENST00000436404 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa7.41□□□□□ -1.22
CNGA3-205ENST00000436404 KRTAP23-1A1A580 65 aa7.38□□□□□ -1.23
CNGA3-205ENST00000436404 MT2AP02795 61 aa7.35□□□□□ -1.23
CNGA3-205ENST00000436404 MT1FP04733 61 aa7.32□□□□□ -1.24
CNGA3-205ENST00000436404 TNP1P09430 55 aa7.32□□□□□ -1.24
CNGA3-205ENST00000436404 PRO2289Q9P1D8 64 aa7.25□□□□□ -1.25
CNGA3-205ENST00000436404 KRTAP10-10P60014 251 aa7.23□□□□□ -1.25
CNGA3-205ENST00000436404 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa7.14□□□□□ -1.27
CNGA3-205ENST00000436404 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa7.13□□□□□ -1.27
CNGA3-205ENST00000436404 SPRR2GQ9BYE4 73 aa7.1□□□□□ -1.27
CNGA3-205ENST00000436404 INE1O15225 51 aa7.07□□□□□ -1.28
CNGA3-205ENST00000436404 LCE2BO14633 110 aa6.99□□□□□ -1.29
CNGA3-205ENST00000436404 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.95□□□□□ -1.3
CNGA3-205ENST00000436404 MT1BP07438 61 aa6.89□□□□□ -1.31
CNGA3-205ENST00000436404 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CNGA3-205ENST00000436404 USH2AO75445 5202 aa6.86□□□□□ -1.31
CNGA3-205ENST00000436404 LCE3AQ5TA76 89 aa6.83□□□□□ -1.32
CNGA3-205ENST00000436404 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.71□□□□□ -1.34
CNGA3-205ENST00000436404 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.69□□□□□ -1.34
CNGA3-205ENST00000436404 SSPOA2VEC9 5147 aa6.68□□□□□ -1.34
CNGA3-205ENST00000436404 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.68□□□□□ -1.34
CNGA3-205ENST00000436404 MT1XP80297 61 aa6.63□□□□□ -1.35
CNGA3-205ENST00000436404 KRTAP10-5P60370 271 aa6.61□□□□□ -1.35
CNGA3-205ENST00000436404 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.57□□□□□ -1.36
CNGA3-205ENST00000436404 KRTAP10-12P60413 245 aa6.49□□□□□ -1.37
CNGA3-205ENST00000436404 KRTAP12-3P60328 96 aa6.49□□□□□ -1.37
CNGA3-205ENST00000436404 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.43□□□□□ -1.38
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CNGA3-205ENST00000436404 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
CNGA3-205ENST00000436404 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.23□□□□□ -1.41
CNGA3-205ENST00000436404 KMT2DO14686 5537 aa6.22□□□□□ -1.41
CNGA3-205ENST00000436404 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.17□□□□□ -1.42
CNGA3-205ENST00000436404 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.17□□□□□ -1.42
CNGA3-205ENST00000436404 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.16□□□□□ -1.42
CNGA3-205ENST00000436404 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
CNGA3-205ENST00000436404 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa6.01□□□□□ -1.45
CNGA3-205ENST00000436404 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6□□□□□ -1.45
CNGA3-205ENST00000436404 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6□□□□□ -1.45
CNGA3-205ENST00000436404 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6□□□□□ -1.45
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