RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
TOP3B-206ENST00000436282 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
TOP3B-206ENST00000436282 Q5VSD8 79 aa7.76□□□□□ -1.17
TOP3B-206ENST00000436282 RPL37P61927 97 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.69□□□□□ -1.18
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP10-8P60410 259 aa7.69□□□□□ -1.18
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa7.69□□□□□ -1.18
TOP3B-206ENST00000436282 HSPG2P98160 4391 aa7.68□□□□□ -1.18
TOP3B-206ENST00000436282 TNXBP22105 4242 aa7.66□□□□□ -1.18
TOP3B-206ENST00000436282 FAT3Q8TDW7 4589 aa7.65□□□□□ -1.18
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.65□□□□□ -1.18
TOP3B-206ENST00000436282 P0C880 135 aa7.65□□□□□ -1.19
TOP3B-206ENST00000436282 A0A0D9SG42 100 aa7.64□□□□□ -1.19
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa7.63□□□□□ -1.19
TOP3B-206ENST00000436282 MYCBP2O75592 4640 aa7.63□□□□□ -1.19
TOP3B-206ENST00000436282 RYR3Q15413 4870 aa7.61□□□□□ -1.19
TOP3B-206ENST00000436282 TPRXLQ17RH7 258 aa7.61□□□□□ -1.19
TOP3B-206ENST00000436282 S4R3F8 94 aa7.59□□□□□ -1.19
TOP3B-206ENST00000436282 RYR1P21817 5038 aa7.55□□□□□ -1.2
TOP3B-206ENST00000436282 XP32Q5T750 250 aa7.55□□□□□ -1.2
TOP3B-206ENST00000436282 KIAA1109Q2LD37 5005 aa7.54□□□□□ -1.2
TOP3B-206ENST00000436282 SPINT4Q6UDR6 99 aa7.54□□□□□ -1.2
TOP3B-206ENST00000436282 C10orf95Q9H7T3 257 aa7.5□□□□□ -1.21
TOP3B-206ENST00000436282 MT1HL1P0DM35 61 aa7.49□□□□□ -1.21
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP12-2P59991 146 aa7.46□□□□□ -1.22
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP12-1P59990 96 aa7.4□□□□□ -1.22
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa7.4□□□□□ -1.22
TOP3B-206ENST00000436282 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
TOP3B-206ENST00000436282 LPAP08519 4548 aa7.32□□□□□ -1.24
TOP3B-206ENST00000436282 LRP2P98164 4655 aa7.31□□□□□ -1.24
TOP3B-206ENST00000436282 M0QZ58 72 aa7.31□□□□□ -1.24
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa7.31□□□□□ -1.24
TOP3B-206ENST00000436282 NDUFAF8A1L188 74 aa7.3□□□□□ -1.24
TOP3B-206ENST00000436282 A0A0A0MQY5 61 aa7.23□□□□□ -1.25
TOP3B-206ENST00000436282 ABCA13Q86UQ4 5058 aa7.19□□□□□ -1.26
TOP3B-206ENST00000436282 J3QL48 77 aa7.1□□□□□ -1.27
TOP3B-206ENST00000436282 R4GN34 69 aa7.05□□□□□ -1.28
TOP3B-206ENST00000436282 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
TOP3B-206ENST00000436282 HERC2O95714 4834 aa6.98□□□□□ -1.29
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.97□□□□□ -1.29
TOP3B-206ENST00000436282 PLAC4Q8WY50 150 aa6.95□□□□□ -1.3
TOP3B-206ENST00000436282 MUC17Q685J3 4493 aa6.9□□□□□ -1.31
TOP3B-206ENST00000436282 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
TOP3B-206ENST00000436282 BIRC6Q9NR09 4857 aa6.87□□□□□ -1.31
TOP3B-206ENST00000436282 PP632Q6XCG6 107 aa6.81□□□□□ -1.32
TOP3B-206ENST00000436282 MUC2Q02817 5179 aa6.79□□□□□ -1.32
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa6.75□□□□□ -1.33
TOP3B-206ENST00000436282 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa6.73□□□□□ -1.33
TOP3B-206ENST00000436282 LUZP6Q538Z0 58 aa6.7□□□□□ -1.34
TOP3B-206ENST00000436282 HERC1Q15751 4861 aa6.67□□□□□ -1.34
TOP3B-206ENST00000436282 PCLOQ9Y6V0 5065 aa6.59□□□□□ -1.35
TOP3B-206ENST00000436282 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.36
TOP3B-206ENST00000436282 TNP1P09430 55 aa6.52□□□□□ -1.37
TOP3B-206ENST00000436282 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.52□□□□□ -1.37
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.52□□□□□ -1.37
TOP3B-206ENST00000436282 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.46□□□□□ -1.38
TOP3B-206ENST00000436282 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.45□□□□□ -1.38
TOP3B-206ENST00000436282 LCE2CQ5TA81 110 aa6.41□□□□□ -1.38
TOP3B-206ENST00000436282 M0R2T5 61 aa6.4□□□□□ -1.38
TOP3B-206ENST00000436282 RNF213Q63HN8 5207 aa6.34□□□□□ -1.4
TOP3B-206ENST00000436282 UBR4Q5T4S7 5183 aa6.3□□□□□ -1.4
TOP3B-206ENST00000436282 MT1HP80294 61 aa6.27□□□□□ -1.41
TOP3B-206ENST00000436282 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.22□□□□□ -1.41
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.21□□□□□ -1.41
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP10-10P60014 251 aa6.2□□□□□ -1.42
TOP3B-206ENST00000436282 MT1FP04733 61 aa6.16□□□□□ -1.42
TOP3B-206ENST00000436282 MT2AP02795 61 aa6.15□□□□□ -1.42
TOP3B-206ENST00000436282 LCE3AQ5TA76 89 aa6.14□□□□□ -1.43
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.1□□□□□ -1.43
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6□□□□□ -1.45
TOP3B-206ENST00000436282 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.96□□□□□ -1.46
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa5.93□□□□□ -1.46
TOP3B-206ENST00000436282 MT1BP07438 61 aa5.91□□□□□ -1.46
TOP3B-206ENST00000436282 INE1O15225 51 aa5.9□□□□□ -1.47
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP10-5P60370 271 aa5.85□□□□□ -1.47
TOP3B-206ENST00000436282 MT1XP80297 61 aa5.84□□□□□ -1.47
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.84□□□□□ -1.47
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP12-3P60328 96 aa5.83□□□□□ -1.48
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP10-12P60413 245 aa5.81□□□□□ -1.48
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
TOP3B-206ENST00000436282 LCE2BO14633 110 aa5.66□□□□□ -1.5
TOP3B-206ENST00000436282 USH2AO75445 5202 aa5.63□□□□□ -1.51
TOP3B-206ENST00000436282 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
TOP3B-206ENST00000436282 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.51□□□□□ -1.53
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa5.49□□□□□ -1.53
TOP3B-206ENST00000436282 KMT2DO14686 5537 aa5.49□□□□□ -1.53
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.42□□□□□ -1.54
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.42□□□□□ -1.54
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.33□□□□□ -1.56
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.26□□□□□ -1.57
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.26□□□□□ -1.57
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.26□□□□□ -1.57
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.26□□□□□ -1.57
TOP3B-206ENST00000436282 FSIP2Q5CZC0 6907 aa5.21□□□□□ -1.58
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.2□□□□□ -1.58
TOP3B-206ENST00000436282 SSPOA2VEC9 5147 aa5.16□□□□□ -1.58
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.15□□□□□ -1.58
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa5.15□□□□□ -1.59
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.15□□□□□ -1.59
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