RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436072.6

SFRP4-201, Transcript of secreted frizzled related protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SFRP4, Length 2,966 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4-201ENST00000436072 A0A0D9SG42 100 aa8.14□□□□□ -1.11
SFRP4-201ENST00000436072 K7ERS5 55 aa8.14□□□□□ -1.11
SFRP4-201ENST00000436072 HSPG2P98160 4391 aa8.1□□□□□ -1.11
SFRP4-201ENST00000436072 MYCBP2O75592 4640 aa8.07□□□□□ -1.12
SFRP4-201ENST00000436072 KIAA1109Q2LD37 5005 aa8.06□□□□□ -1.12
SFRP4-201ENST00000436072 RPS29P62273 56 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
SFRP4-201ENST00000436072 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa8.04□□□□□ -1.12
SFRP4-201ENST00000436072 P0C880 135 aa8.03□□□□□ -1.12
SFRP4-201ENST00000436072 Q5VSD8 79 aa8.03□□□□□ -1.12
SFRP4-201ENST00000436072 TNXBP22105 4242 aa8.02□□□□□ -1.13
SFRP4-201ENST00000436072 RYR1P21817 5038 aa8□□□□□ -1.13
SFRP4-201ENST00000436072 C10orf95Q9H7T3 257 aa8□□□□□ -1.13
SFRP4-201ENST00000436072 FAT3Q8TDW7 4589 aa7.99□□□□□ -1.13
SFRP4-201ENST00000436072 RPL37P61927 97 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
SFRP4-201ENST00000436072 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa7.98□□□□□ -1.13
SFRP4-201ENST00000436072 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
SFRP4-201ENST00000436072 TPRXLQ17RH7 258 aa7.96□□□□□ -1.13
SFRP4-201ENST00000436072 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
SFRP4-201ENST00000436072 SPINT4Q6UDR6 99 aa7.96□□□□□ -1.14
SFRP4-201ENST00000436072 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.94□□□□□ -1.14
SFRP4-201ENST00000436072 KRTAP10-8P60410 259 aa7.89□□□□□ -1.15
SFRP4-201ENST00000436072 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.89□□□□□ -1.15
SFRP4-201ENST00000436072 S4R3F8 94 aa7.83□□□□□ -1.16
SFRP4-201ENST00000436072 KRTAP12-2P59991 146 aa7.8□□□□□ -1.16
SFRP4-201ENST00000436072 ABCA13Q86UQ4 5058 aa7.74□□□□□ -1.17
SFRP4-201ENST00000436072 NDUFAF8A1L188 74 aa7.74□□□□□ -1.17
SFRP4-201ENST00000436072 LPAP08519 4548 aa7.74□□□□□ -1.17
SFRP4-201ENST00000436072 MT1HL1P0DM35 61 aa7.72□□□□□ -1.17
SFRP4-201ENST00000436072 XP32Q5T750 250 aa7.71□□□□□ -1.17
SFRP4-201ENST00000436072 LRP2P98164 4655 aa7.71□□□□□ -1.18
SFRP4-201ENST00000436072 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa7.67□□□□□ -1.18
SFRP4-201ENST00000436072 KRTAP12-1P59990 96 aa7.65□□□□□ -1.19
SFRP4-201ENST00000436072 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa7.65□□□□□ -1.19
SFRP4-201ENST00000436072 A0A0A0MQY5 61 aa7.53□□□□□ -1.2
SFRP4-201ENST00000436072 HERC2O95714 4834 aa7.48□□□□□ -1.21
SFRP4-201ENST00000436072 M0QZ58 72 aa7.42□□□□□ -1.22
SFRP4-201ENST00000436072 J3QL48 77 aa7.38□□□□□ -1.23
SFRP4-201ENST00000436072 MUC2Q02817 5179 aa7.35□□□□□ -1.23
SFRP4-201ENST00000436072 R4GN34 69 aa7.34□□□□□ -1.23
SFRP4-201ENST00000436072 LORP23490 312 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SFRP4-201ENST00000436072 HERC1Q15751 4861 aa7.25□□□□□ -1.25
SFRP4-201ENST00000436072 BIRC6Q9NR09 4857 aa7.23□□□□□ -1.25
SFRP4-201ENST00000436072 PLAC4Q8WY50 150 aa7.23□□□□□ -1.25
SFRP4-201ENST00000436072 MUC17Q685J3 4493 aa7.22□□□□□ -1.25
SFRP4-201ENST00000436072 PCLOQ9Y6V0 5065 aa7.21□□□□□ -1.26
SFRP4-201ENST00000436072 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa7.19□□□□□ -1.26
SFRP4-201ENST00000436072 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
SFRP4-201ENST00000436072 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa7.05□□□□□ -1.28
SFRP4-201ENST00000436072 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.98□□□□□ -1.29
SFRP4-201ENST00000436072 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.96□□□□□ -1.3
SFRP4-201ENST00000436072 LUZP6Q538Z0 58 aa6.96□□□□□ -1.3
SFRP4-201ENST00000436072 RNF213Q63HN8 5207 aa6.95□□□□□ -1.3
SFRP4-201ENST00000436072 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa6.91□□□□□ -1.3
SFRP4-201ENST00000436072 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
SFRP4-201ENST00000436072 UBR4Q5T4S7 5183 aa6.87□□□□□ -1.31
SFRP4-201ENST00000436072 PP632Q6XCG6 107 aa6.84□□□□□ -1.31
SFRP4-201ENST00000436072 TNP1P09430 55 aa6.71□□□□□ -1.34
SFRP4-201ENST00000436072 M0R2T5 61 aa6.63□□□□□ -1.35
SFRP4-201ENST00000436072 LCE2CQ5TA81 110 aa6.63□□□□□ -1.35
SFRP4-201ENST00000436072 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.49□□□□□ -1.37
SFRP4-201ENST00000436072 MT1HP80294 61 aa6.48□□□□□ -1.37
SFRP4-201ENST00000436072 LCE3AQ5TA76 89 aa6.41□□□□□ -1.38
SFRP4-201ENST00000436072 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.41□□□□□ -1.38
SFRP4-201ENST00000436072 KRTAP10-10P60014 251 aa6.39□□□□□ -1.39
SFRP4-201ENST00000436072 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.36□□□□□ -1.39
SFRP4-201ENST00000436072 MT1FP04733 61 aa6.35□□□□□ -1.39
SFRP4-201ENST00000436072 MT2AP02795 61 aa6.33□□□□□ -1.4
SFRP4-201ENST00000436072 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.31□□□□□ -1.4
SFRP4-201ENST00000436072 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.29□□□□□ -1.4
SFRP4-201ENST00000436072 USH2AO75445 5202 aa6.12□□□□□ -1.43
SFRP4-201ENST00000436072 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.08□□□□□ -1.44
SFRP4-201ENST00000436072 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.07□□□□□ -1.44
SFRP4-201ENST00000436072 MT1BP07438 61 aa6.05□□□□□ -1.44
SFRP4-201ENST00000436072 KRTAP12-3P60328 96 aa6.03□□□□□ -1.44
SFRP4-201ENST00000436072 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.03□□□□□ -1.44
SFRP4-201ENST00000436072 KRTAP10-5P60370 271 aa6.02□□□□□ -1.45
SFRP4-201ENST00000436072 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.02□□□□□ -1.45
SFRP4-201ENST00000436072 MT1XP80297 61 aa6□□□□□ -1.45
SFRP4-201ENST00000436072 KRTAP10-12P60413 245 aa5.98□□□□□ -1.45
SFRP4-201ENST00000436072 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
SFRP4-201ENST00000436072 INE1O15225 51 aa5.94□□□□□ -1.46
SFRP4-201ENST00000436072 KMT2DO14686 5537 aa5.9□□□□□ -1.47
SFRP4-201ENST00000436072 LCE2BO14633 110 aa5.87□□□□□ -1.47
SFRP4-201ENST00000436072 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
SFRP4-201ENST00000436072 FSIP2Q5CZC0 6907 aa5.83□□□□□ -1.48
SFRP4-201ENST00000436072 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa5.73□□□□□ -1.49
SFRP4-201ENST00000436072 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.67□□□□□ -1.5
SFRP4-201ENST00000436072 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.61□□□□□ -1.51
SFRP4-201ENST00000436072 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.61□□□□□ -1.51
SFRP4-201ENST00000436072 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.59□□□□□ -1.51
SFRP4-201ENST00000436072 SSPOA2VEC9 5147 aa5.59□□□□□ -1.52
SFRP4-201ENST00000436072 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.55□□□□□ -1.52
SFRP4-201ENST00000436072 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.33□□□□□ -1.56
SFRP4-201ENST00000436072 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.33□□□□□ -1.56
SFRP4-201ENST00000436072 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.33□□□□□ -1.56
SFRP4-201ENST00000436072 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.33□□□□□ -1.56
SFRP4-201ENST00000436072 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
SFRP4-201ENST00000436072 MUC12Q9UKN1 5478 aa5.26□□□□□ -1.57
SFRP4-201ENST00000436072 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa5.22□□□□□ -1.57
SFRP4-201ENST00000436072 MT1LQ93083 61 aa5.19□□□□□ -1.58
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