RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 MUC17Q685J3 4493 aa4.89□□□□□ -1.63
HDLBP-211ENST00000425989 SMIM26A0A096LP01 95 aa4.89□□□□□ -1.63
HDLBP-211ENST00000425989 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa4.89□□□□□ -1.63
HDLBP-211ENST00000425989 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa4.89□□□□□ -1.63
HDLBP-211ENST00000425989 SVIPQ8NHG7 77 aa4.86□□□□□ -1.63
HDLBP-211ENST00000425989 V9GYY9 64 aa4.86□□□□□ -1.63
HDLBP-211ENST00000425989 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa4.85□□□□□ -1.63
HDLBP-211ENST00000425989 RNF213Q63HN8 5207 aa4.85□□□□□ -1.63
HDLBP-211ENST00000425989 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa4.82□□□□□ -1.64
HDLBP-211ENST00000425989 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa4.82□□□□□ -1.64
HDLBP-211ENST00000425989 LORP23490 312 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
HDLBP-211ENST00000425989 Q1T7F1 81 aa4.8□□□□□ -1.64
HDLBP-211ENST00000425989 S4R3F8 94 aa4.8□□□□□ -1.64
HDLBP-211ENST00000425989 CSAG1Q6PB30 78 aa4.77□□□□□ -1.65
HDLBP-211ENST00000425989 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa4.77□□□□□ -1.65
HDLBP-211ENST00000425989 SEC61GP60059 68 aa4.75□□□□□ -1.65
HDLBP-211ENST00000425989 LCA10Q71F78 164 aa4.75□□□□□ -1.65
HDLBP-211ENST00000425989 PRR15LQ9BU68 103 aa4.75□□□□□ -1.65
HDLBP-211ENST00000425989 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa4.73□□□□□ -1.65
HDLBP-211ENST00000425989 A0A1B0GU69 56 aa4.7□□□□□ -1.66
HDLBP-211ENST00000425989 H0YAA0 97 aa4.67□□□□□ -1.66
HDLBP-211ENST00000425989 PSPHP1O15172 72 aa4.62□□□□□ -1.67
HDLBP-211ENST00000425989 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
HDLBP-211ENST00000425989 MUC2Q02817 5179 aa4.59□□□□□ -1.67
HDLBP-211ENST00000425989 Q5VV11 94 aa4.59□□□□□ -1.67
HDLBP-211ENST00000425989 UQCR11O14957 56 aa4.58□□□□□ -1.68
HDLBP-211ENST00000425989 A0A1B0GU33 70 aa4.57□□□□□ -1.68
HDLBP-211ENST00000425989 M0R2T5 61 aa4.56□□□□□ -1.68
HDLBP-211ENST00000425989 MT1HP80294 61 aa4.56□□□□□ -1.68
HDLBP-211ENST00000425989 ADM2Q7Z4H4 148 aa4.56□□□□□ -1.68
HDLBP-211ENST00000425989 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
HDLBP-211ENST00000425989 FAT4Q6V0I7 4981 aa4.54□□□□□ -1.68
HDLBP-211ENST00000425989 A6NED7 52 aa4.53□□□□□ -1.68
HDLBP-211ENST00000425989 M0QZ58 72 aa4.53□□□□□ -1.68
HDLBP-211ENST00000425989 CRIPTQ9P021 101 aa4.53□□□□□ -1.68
HDLBP-211ENST00000425989 CRCT1Q9UGL9 99 aa4.52□□□□□ -1.69
HDLBP-211ENST00000425989 SPATA8Q6RVD6 105 aa4.5□□□□□ -1.69
HDLBP-211ENST00000425989 MIR22HGQ0VDD5 57 aa4.49□□□□□ -1.69
HDLBP-211ENST00000425989 P0C880 135 aa4.48□□□□□ -1.69
HDLBP-211ENST00000425989 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa4.47□□□□□ -1.69
HDLBP-211ENST00000425989 R4GN34 69 aa4.45□□□□□ -1.7
HDLBP-211ENST00000425989 BRK1Q8WUW1 75 aa4.42□□□□□ -1.7
HDLBP-211ENST00000425989 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa4.4□□□□□ -1.71
HDLBP-211ENST00000425989 FSIP2Q5CZC0 6907 aa4.4□□□□□ -1.71
HDLBP-211ENST00000425989 K7ERS5 55 aa4.39□□□□□ -1.71
HDLBP-211ENST00000425989 KRTAP10-10P60014 251 aa4.38□□□□□ -1.71
HDLBP-211ENST00000425989 PRO0628Q9UI54 55 aa4.38□□□□□ -1.71
HDLBP-211ENST00000425989 A6NN06 94 aa4.36□□□□□ -1.71
HDLBP-211ENST00000425989 MT2AP02795 61 aa4.36□□□□□ -1.71
HDLBP-211ENST00000425989 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa4.35□□□□□ -1.71
HDLBP-211ENST00000425989 SPRR2GQ9BYE4 73 aa4.34□□□□□ -1.71
HDLBP-211ENST00000425989 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.32□□□□□ -1.72
HDLBP-211ENST00000425989 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.32□□□□□ -1.72
HDLBP-211ENST00000425989 MT1FP04733 61 aa4.31□□□□□ -1.72
HDLBP-211ENST00000425989 A8MU10 97 aa4.3□□□□□ -1.72
HDLBP-211ENST00000425989 A0A0D9SG42 100 aa4.29□□□□□ -1.72
HDLBP-211ENST00000425989 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.29□□□□□ -1.72
HDLBP-211ENST00000425989 LINC01554Q52M75 96 aa4.28□□□□□ -1.72
HDLBP-211ENST00000425989 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa4.26□□□□□ -1.73
HDLBP-211ENST00000425989 KRTAP12-1P59990 96 aa4.25□□□□□ -1.73
HDLBP-211ENST00000425989 SPINT4Q6UDR6 99 aa4.25□□□□□ -1.73
HDLBP-211ENST00000425989 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa4.25□□□□□ -1.73
HDLBP-211ENST00000425989 PMAIP1Q13794 54 aa4.24□□□□□ -1.73
HDLBP-211ENST00000425989 PLAC4Q8WY50 150 aa4.24□□□□□ -1.73
HDLBP-211ENST00000425989 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa4.23□□□□□ -1.73
HDLBP-211ENST00000425989 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
HDLBP-211ENST00000425989 KRTAP12-2P59991 146 aa4.2□□□□□ -1.74
HDLBP-211ENST00000425989 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa4.16□□□□□ -1.74
HDLBP-211ENST00000425989 ROMO1P60602 79 aa4.12□□□□□ -1.75
HDLBP-211ENST00000425989 MT1BP07438 61 aa4.09□□□□□ -1.75
HDLBP-211ENST00000425989 PRO2289Q9P1D8 64 aa4.07□□□□□ -1.76
HDLBP-211ENST00000425989 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.03□□□□□ -1.76
HDLBP-211ENST00000425989 C10orf95Q9H7T3 257 aa4.02□□□□□ -1.77
HDLBP-211ENST00000425989 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa4.01□□□□□ -1.77
HDLBP-211ENST00000425989 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa4.01□□□□□ -1.77
HDLBP-211ENST00000425989 TNP1P09430 55 aa4□□□□□ -1.77
HDLBP-211ENST00000425989 KRTAP10-5P60370 271 aa3.96□□□□□ -1.78
HDLBP-211ENST00000425989 KRTAP23-1A1A580 65 aa3.95□□□□□ -1.78
HDLBP-211ENST00000425989 MT1XP80297 61 aa3.95□□□□□ -1.78
HDLBP-211ENST00000425989 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa3.93□□□□□ -1.78
HDLBP-211ENST00000425989 H3BS24 57 aa3.92□□□□□ -1.78
HDLBP-211ENST00000425989 SSPOA2VEC9 5147 aa3.92□□□□□ -1.78
HDLBP-211ENST00000425989 PP632Q6XCG6 107 aa3.91□□□□□ -1.78
HDLBP-211ENST00000425989 USH2AO75445 5202 aa3.91□□□□□ -1.78
HDLBP-211ENST00000425989 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.78
HDLBP-211ENST00000425989 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.9□□□□□ -1.79
HDLBP-211ENST00000425989 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
HDLBP-211ENST00000425989 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
HDLBP-211ENST00000425989 PRAC1Q96KF2 57 aa3.83□□□□□ -1.8
HDLBP-211ENST00000425989 KRTAP10-12P60413 245 aa3.81□□□□□ -1.8
HDLBP-211ENST00000425989 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.8□□□□□ -1.8
HDLBP-211ENST00000425989 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
HDLBP-211ENST00000425989 LCE3BQ5TA77 95 aa3.75□□□□□ -1.81
HDLBP-211ENST00000425989 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.75□□□□□ -1.81
HDLBP-211ENST00000425989 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.75□□□□□ -1.81
HDLBP-211ENST00000425989 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.73□□□□□ -1.81
HDLBP-211ENST00000425989 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa3.72□□□□□ -1.81
HDLBP-211ENST00000425989 LCE3AQ5TA76 89 aa3.71□□□□□ -1.82
HDLBP-211ENST00000425989 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa3.65□□□□□ -1.83
HDLBP-211ENST00000425989 NEBP20929 6669 aa3.64□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 98.3 ms