RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395789.5

C6orf48-209, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene C6orf48, Length 952 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-209ENST00000395789 H0Y9P7 68 aa6.3□□□□□ -1.4
C6orf48-209ENST00000395789 ATOX1O00244 68 aa6.27□□□□□ -1.41
C6orf48-209ENST00000395789 K7ERU9 68 aa6.24□□□□□ -1.41
C6orf48-209ENST00000395789 LCA10Q71F78 164 aa6.24□□□□□ -1.41
C6orf48-209ENST00000395789 MT-ATP8P03928 68 aa6.23□□□□□ -1.41
C6orf48-209ENST00000395789 S4R3F8 94 aa6.23□□□□□ -1.41
C6orf48-209ENST00000395789 C5orf47Q569G3 176 aa6.22□□□□□ -1.41
C6orf48-209ENST00000395789 LINC00208Q96KT6 92 aa6.22□□□□□ -1.41
C6orf48-209ENST00000395789 IMUPQ9GZP8 106 aa6.22□□□□□ -1.41
C6orf48-209ENST00000395789 USH2AO75445 5202 aa6.22□□□□□ -1.41
C6orf48-209ENST00000395789 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.21□□□□□ -1.42
C6orf48-209ENST00000395789 KLKP1Q107X0 134 aa6.2□□□□□ -1.42
C6orf48-209ENST00000395789 SSPOA2VEC9 5147 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-209ENST00000395789 MP68P56378 58 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-209ENST00000395789 CSAG1Q6PB30 78 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-209ENST00000395789 SCGB1A1P11684 91 aa6.14□□□□□ -1.43
C6orf48-209ENST00000395789 H3BPC8 53 aa6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-209ENST00000395789 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa6.1□□□□□ -1.43
C6orf48-209ENST00000395789 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.1□□□□□ -1.43
C6orf48-209ENST00000395789 A8MUN3 132 aa6.1□□□□□ -1.43
C6orf48-209ENST00000395789 LCE4AQ5TA78 99 aa6.08□□□□□ -1.44
C6orf48-209ENST00000395789 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.06□□□□□ -1.44
C6orf48-209ENST00000395789 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.04□□□□□ -1.44
C6orf48-209ENST00000395789 DMAC1Q96GE9 116 aa6.03□□□□□ -1.44
C6orf48-209ENST00000395789 NDUFC1O43677 76 aa6.02□□□□□ -1.45
C6orf48-209ENST00000395789 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.02□□□□□ -1.45
C6orf48-209ENST00000395789 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.01□□□□□ -1.45
C6orf48-209ENST00000395789 H0YAA0 97 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-209ENST00000395789 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
C6orf48-209ENST00000395789 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa5.97□□□□□ -1.45
C6orf48-209ENST00000395789 MT1BP07438 61 aa5.96□□□□□ -1.46
C6orf48-209ENST00000395789 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.96□□□□□ -1.46
C6orf48-209ENST00000395789 SNURFQ9Y675 71 aa5.93□□□□□ -1.46
C6orf48-209ENST00000395789 SERP2Q8N6R1 65 aa5.92□□□□□ -1.46
C6orf48-209ENST00000395789 CRIPTQ9P021 101 aa5.91□□□□□ -1.46
C6orf48-209ENST00000395789 ADM2Q7Z4H4 148 aa5.9□□□□□ -1.46
C6orf48-209ENST00000395789 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.89□□□□□ -1.47
C6orf48-209ENST00000395789 C20orf197Q8N268 126 aa5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-209ENST00000395789 Q5VV11 94 aa5.87□□□□□ -1.47
C6orf48-209ENST00000395789 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-209ENST00000395789 ACYP2P14621 99 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-209ENST00000395789 P0C880 135 aa5.83□□□□□ -1.48
C6orf48-209ENST00000395789 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa5.83□□□□□ -1.48
C6orf48-209ENST00000395789 PCP4P48539 62 aa5.82□□□□□ -1.48
C6orf48-209ENST00000395789 COX7CP15954 63 aa5.78□□□□□ -1.48
C6orf48-209ENST00000395789 KRTAP10-5P60370 271 aa5.76□□□□□ -1.49
C6orf48-209ENST00000395789 CYSTM1Q9H1C7 97 aa5.74□□□□□ -1.49
C6orf48-209ENST00000395789 A6NN06 94 aa5.73□□□□□ -1.49
C6orf48-209ENST00000395789 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa5.71□□□□□ -1.5
C6orf48-209ENST00000395789 SPTSSBQ8NFR3 76 aa5.71□□□□□ -1.5
C6orf48-209ENST00000395789 R4GN34 69 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-209ENST00000395789 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-209ENST00000395789 H7BZZ5 65 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-209ENST00000395789 M0QZ58 72 aa5.68□□□□□ -1.5
C6orf48-209ENST00000395789 COA5Q86WW8 74 aa5.65□□□□□ -1.5
C6orf48-209ENST00000395789 ANAPC13Q9BS18 74 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-209ENST00000395789 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
C6orf48-209ENST00000395789 MT1XP80297 61 aa5.62□□□□□ -1.51
C6orf48-209ENST00000395789 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.59□□□□□ -1.51
C6orf48-209ENST00000395789 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.59□□□□□ -1.51
C6orf48-209ENST00000395789 PLAC4Q8WY50 150 aa5.58□□□□□ -1.52
C6orf48-209ENST00000395789 CCDC179H3BU77 68 aa5.57□□□□□ -1.52
C6orf48-209ENST00000395789 LINC01554Q52M75 96 aa5.57□□□□□ -1.52
C6orf48-209ENST00000395789 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa5.54□□□□□ -1.52
C6orf48-209ENST00000395789 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.51□□□□□ -1.53
C6orf48-209ENST00000395789 KRTAP5-9P26371 169 aa5.43□□□□□ -1.54
C6orf48-209ENST00000395789 KRTAP12-2P59991 146 aa5.42□□□□□ -1.54
C6orf48-209ENST00000395789 SEC61GP60059 68 aa5.4□□□□□ -1.54
C6orf48-209ENST00000395789 SERP1Q9Y6X1 66 aa5.4□□□□□ -1.54
C6orf48-209ENST00000395789 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
C6orf48-209ENST00000395789 A0A1B0GU33 70 aa5.36□□□□□ -1.55
C6orf48-209ENST00000395789 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.36□□□□□ -1.55
C6orf48-209ENST00000395789 KMT2DO14686 5537 aa5.35□□□□□ -1.55
C6orf48-209ENST00000395789 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
C6orf48-209ENST00000395789 KRTAP10-12P60413 245 aa5.34□□□□□ -1.55
C6orf48-209ENST00000395789 TMEM258P61165 79 aa5.33□□□□□ -1.56
C6orf48-209ENST00000395789 A0A0D9SG42 100 aa5.31□□□□□ -1.56
C6orf48-209ENST00000395789 A0A1B0GU69 56 aa5.31□□□□□ -1.56
C6orf48-209ENST00000395789 MUC12Q9UKN1 5478 aa5.3□□□□□ -1.56
C6orf48-209ENST00000395789 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.28□□□□□ -1.56
C6orf48-209ENST00000395789 NEBP20929 6669 aa5.27□□□□□ -1.57
C6orf48-209ENST00000395789 KRTAP12-1P59990 96 aa5.26□□□□□ -1.57
C6orf48-209ENST00000395789 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa5.25□□□□□ -1.57
C6orf48-209ENST00000395789 SPRR2FQ96RM1 72 aa5.25□□□□□ -1.57
C6orf48-209ENST00000395789 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa5.24□□□□□ -1.57
C6orf48-209ENST00000395789 A8MU10 97 aa5.21□□□□□ -1.58
C6orf48-209ENST00000395789 SPINT4Q6UDR6 99 aa5.19□□□□□ -1.58
C6orf48-209ENST00000395789 SMIM26A0A096LP01 95 aa5.18□□□□□ -1.58
C6orf48-209ENST00000395789 MDN1Q9NU22 5596 aa5.16□□□□□ -1.58
C6orf48-209ENST00000395789 PRR15LQ9BU68 103 aa5.16□□□□□ -1.58
C6orf48-209ENST00000395789 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.15□□□□□ -1.59
C6orf48-209ENST00000395789 SPRR2EP22531 72 aa5.12□□□□□ -1.59
C6orf48-209ENST00000395789 SPRR2BP35325 72 aa5.12□□□□□ -1.59
C6orf48-209ENST00000395789 SPRR2AP35326 72 aa5.12□□□□□ -1.59
C6orf48-209ENST00000395789 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.06□□□□□ -1.6
C6orf48-209ENST00000395789 UQCR11O14957 56 aa5.04□□□□□ -1.6
C6orf48-209ENST00000395789 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.03□□□□□ -1.6
C6orf48-209ENST00000395789 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.03□□□□□ -1.6
C6orf48-209ENST00000395789 Q1T7F1 81 aa5.01□□□□□ -1.61
C6orf48-209ENST00000395789 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms