RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378858.4

LRRN4-201, Transcript of leucine rich repeat neuronal 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRN4, Length 2,692 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4-201ENST00000378858 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa8.66□□□□□ -1.02
LRRN4-201ENST00000378858 A0A1B0GVY2 172 aa8.66□□□□□ -1.02
LRRN4-201ENST00000378858 RPL37P61927 97 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
LRRN4-201ENST00000378858 P0C880 135 aa8.65□□□□□ -1.02
LRRN4-201ENST00000378858 A0A0D9SG42 100 aa8.65□□□□□ -1.03
LRRN4-201ENST00000378858 FAT3Q8TDW7 4589 aa8.62□□□□□ -1.03
LRRN4-201ENST00000378858 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa8.6□□□□□ -1.03
LRRN4-201ENST00000378858 HSPG2P98160 4391 aa8.59□□□□□ -1.03
LRRN4-201ENST00000378858 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
LRRN4-201ENST00000378858 RYR2Q92736 4967 aa8.57□□□□□ -1.04
LRRN4-201ENST00000378858 KRTAP10-8P60410 259 aa8.57□□□□□ -1.04
LRRN4-201ENST00000378858 S4R3F8 94 aa8.55□□□□□ -1.04
LRRN4-201ENST00000378858 TNXBP22105 4242 aa8.51□□□□□ -1.05
LRRN4-201ENST00000378858 MYCBP2O75592 4640 aa8.51□□□□□ -1.05
LRRN4-201ENST00000378858 TPRXLQ17RH7 258 aa8.5□□□□□ -1.05
LRRN4-201ENST00000378858 RYR3Q15413 4870 aa8.49□□□□□ -1.05
LRRN4-201ENST00000378858 XP32Q5T750 250 aa8.48□□□□□ -1.05
LRRN4-201ENST00000378858 C10orf95Q9H7T3 257 aa8.45□□□□□ -1.06
LRRN4-201ENST00000378858 SPINT4Q6UDR6 99 aa8.41□□□□□ -1.06
LRRN4-201ENST00000378858 KRTAP12-2P59991 146 aa8.4□□□□□ -1.06
LRRN4-201ENST00000378858 Q5VSD8 79 aa8.34□□□□□ -1.07
LRRN4-201ENST00000378858 NDUFAF8A1L188 74 aa8.3□□□□□ -1.08
LRRN4-201ENST00000378858 KRTAP12-1P59990 96 aa8.3□□□□□ -1.08
LRRN4-201ENST00000378858 LPAP08519 4548 aa8.29□□□□□ -1.08
LRRN4-201ENST00000378858 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa8.26□□□□□ -1.09
LRRN4-201ENST00000378858 KIAA1109Q2LD37 5005 aa8.22□□□□□ -1.09
LRRN4-201ENST00000378858 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
LRRN4-201ENST00000378858 M0QZ58 72 aa8.17□□□□□ -1.1
LRRN4-201ENST00000378858 LRP2P98164 4655 aa8.17□□□□□ -1.1
LRRN4-201ENST00000378858 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa8.17□□□□□ -1.1
LRRN4-201ENST00000378858 MT1HL1P0DM35 61 aa8.15□□□□□ -1.11
LRRN4-201ENST00000378858 RYR1P21817 5038 aa8.13□□□□□ -1.11
LRRN4-201ENST00000378858 A0A0A0MQY5 61 aa8.1□□□□□ -1.11
LRRN4-201ENST00000378858 R4GN34 69 aa7.97□□□□□ -1.13
LRRN4-201ENST00000378858 ABCA13Q86UQ4 5058 aa7.9□□□□□ -1.15
LRRN4-201ENST00000378858 LORP23490 312 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
LRRN4-201ENST00000378858 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa7.84□□□□□ -1.16
LRRN4-201ENST00000378858 LUZP6Q538Z0 58 aa7.77□□□□□ -1.16
LRRN4-201ENST00000378858 MUC17Q685J3 4493 aa7.75□□□□□ -1.17
LRRN4-201ENST00000378858 PLAC4Q8WY50 150 aa7.75□□□□□ -1.17
LRRN4-201ENST00000378858 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
LRRN4-201ENST00000378858 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa7.69□□□□□ -1.18
LRRN4-201ENST00000378858 HERC2O95714 4834 aa7.66□□□□□ -1.18
LRRN4-201ENST00000378858 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa7.61□□□□□ -1.19
LRRN4-201ENST00000378858 BIRC6Q9NR09 4857 aa7.55□□□□□ -1.2
LRRN4-201ENST00000378858 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa7.55□□□□□ -1.2
LRRN4-201ENST00000378858 PP632Q6XCG6 107 aa7.55□□□□□ -1.2
LRRN4-201ENST00000378858 PCLOQ9Y6V0 5065 aa7.52□□□□□ -1.21
LRRN4-201ENST00000378858 MUC2Q02817 5179 aa7.48□□□□□ -1.21
LRRN4-201ENST00000378858 HERC1Q15751 4861 aa7.45□□□□□ -1.22
LRRN4-201ENST00000378858 J3QL48 77 aa7.45□□□□□ -1.22
LRRN4-201ENST00000378858 TNP1P09430 55 aa7.32□□□□□ -1.24
LRRN4-201ENST00000378858 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
LRRN4-201ENST00000378858 KRTAP23-1A1A580 65 aa7.21□□□□□ -1.26
LRRN4-201ENST00000378858 HMCN2Q8NDA2 5059 aa7.14□□□□□ -1.27
LRRN4-201ENST00000378858 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa7.14□□□□□ -1.27
LRRN4-201ENST00000378858 RNF213Q63HN8 5207 aa7.11□□□□□ -1.27
LRRN4-201ENST00000378858 FAT4Q6V0I7 4981 aa7.1□□□□□ -1.27
LRRN4-201ENST00000378858 UBR4Q5T4S7 5183 aa7.07□□□□□ -1.28
LRRN4-201ENST00000378858 SPRR2GQ9BYE4 73 aa7.03□□□□□ -1.28
LRRN4-201ENST00000378858 LCE2CQ5TA81 110 aa7.01□□□□□ -1.29
LRRN4-201ENST00000378858 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa7.01□□□□□ -1.29
LRRN4-201ENST00000378858 LCE3AQ5TA76 89 aa6.93□□□□□ -1.3
LRRN4-201ENST00000378858 M0R2T5 61 aa6.91□□□□□ -1.3
LRRN4-201ENST00000378858 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.86□□□□□ -1.31
LRRN4-201ENST00000378858 KRTAP10-10P60014 251 aa6.79□□□□□ -1.32
LRRN4-201ENST00000378858 MT1HP80294 61 aa6.79□□□□□ -1.32
LRRN4-201ENST00000378858 MT1FP04733 61 aa6.78□□□□□ -1.32
LRRN4-201ENST00000378858 MT2AP02795 61 aa6.76□□□□□ -1.33
LRRN4-201ENST00000378858 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.72□□□□□ -1.33
LRRN4-201ENST00000378858 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.68□□□□□ -1.34
LRRN4-201ENST00000378858 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.65□□□□□ -1.34
LRRN4-201ENST00000378858 INE1O15225 51 aa6.64□□□□□ -1.35
LRRN4-201ENST00000378858 KRTAP10-5P60370 271 aa6.63□□□□□ -1.35
LRRN4-201ENST00000378858 MT1XP80297 61 aa6.61□□□□□ -1.35
LRRN4-201ENST00000378858 MT1BP07438 61 aa6.6□□□□□ -1.35
LRRN4-201ENST00000378858 KRTAP12-3P60328 96 aa6.58□□□□□ -1.36
LRRN4-201ENST00000378858 KRTAP10-12P60413 245 aa6.56□□□□□ -1.36
LRRN4-201ENST00000378858 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
LRRN4-201ENST00000378858 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRN4-201ENST00000378858 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRN4-201ENST00000378858 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.21□□□□□ -1.42
LRRN4-201ENST00000378858 USH2AO75445 5202 aa6.19□□□□□ -1.42
LRRN4-201ENST00000378858 KMT2DO14686 5537 aa6.17□□□□□ -1.42
LRRN4-201ENST00000378858 LCE2BO14633 110 aa6.11□□□□□ -1.43
LRRN4-201ENST00000378858 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.07□□□□□ -1.44
LRRN4-201ENST00000378858 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.05□□□□□ -1.44
LRRN4-201ENST00000378858 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.05□□□□□ -1.44
LRRN4-201ENST00000378858 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa6.03□□□□□ -1.44
LRRN4-201ENST00000378858 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
LRRN4-201ENST00000378858 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.92□□□□□ -1.46
LRRN4-201ENST00000378858 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.89□□□□□ -1.47
LRRN4-201ENST00000378858 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.85□□□□□ -1.47
LRRN4-201ENST00000378858 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.85□□□□□ -1.47
LRRN4-201ENST00000378858 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.85□□□□□ -1.47
LRRN4-201ENST00000378858 MT1LQ93083 61 aa5.73□□□□□ -1.49
LRRN4-201ENST00000378858 SSPOA2VEC9 5147 aa5.71□□□□□ -1.5
LRRN4-201ENST00000378858 MT1EP04732 61 aa5.69□□□□□ -1.5
LRRN4-201ENST00000378858 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.67□□□□□ -1.5
LRRN4-201ENST00000378858 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.5□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 108.5 ms