RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367576.5

LTV1-201, Transcript of LTV1 ribosome biogenesis factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTV1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1-201ENST00000367576 LCA10Q71F78 164 aa8.75□□□□□ -1.01
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LTV1-201ENST00000367576 MT1HP80294 61 aa8.61□□□□□ -1.03
LTV1-201ENST00000367576 SPTSSBQ8NFR3 76 aa8.6□□□□□ -1.03
LTV1-201ENST00000367576 CSAG1Q6PB30 78 aa8.57□□□□□ -1.04
LTV1-201ENST00000367576 FAT4Q6V0I7 4981 aa8.56□□□□□ -1.04
LTV1-201ENST00000367576 M0R2T5 61 aa8.54□□□□□ -1.04
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LTV1-201ENST00000367576 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
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LTV1-201ENST00000367576 Q1T7F1 81 aa8.38□□□□□ -1.07
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LTV1-201ENST00000367576 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
LTV1-201ENST00000367576 V9GYY9 64 aa8.35□□□□□ -1.07
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LTV1-201ENST00000367576 SEC61GP60059 68 aa8.34□□□□□ -1.07
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LTV1-201ENST00000367576 Q5VV11 94 aa8.22□□□□□ -1.09
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LTV1-201ENST00000367576 SPATA8Q6RVD6 105 aa8.09□□□□□ -1.11
LTV1-201ENST00000367576 M0QZ58 72 aa8.08□□□□□ -1.12
LTV1-201ENST00000367576 R4GN34 69 aa8.08□□□□□ -1.12
LTV1-201ENST00000367576 A6NED7 52 aa8.06□□□□□ -1.12
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LTV1-201ENST00000367576 A8MU10 97 aa7.96□□□□□ -1.13
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LTV1-201ENST00000367576 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa7.74□□□□□ -1.17
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LTV1-201ENST00000367576 MT1XP80297 61 aa7.41□□□□□ -1.22
LTV1-201ENST00000367576 KRTAP10-5P60370 271 aa7.38□□□□□ -1.23
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LTV1-201ENST00000367576 C10orf95Q9H7T3 257 aa7.35□□□□□ -1.23
LTV1-201ENST00000367576 SSPOA2VEC9 5147 aa7.33□□□□□ -1.24
LTV1-201ENST00000367576 FSIP2Q5CZC0 6907 aa7.32□□□□□ -1.24
LTV1-201ENST00000367576 PRO2289Q9P1D8 64 aa7.31□□□□□ -1.24
LTV1-201ENST00000367576 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa7.3□□□□□ -1.24
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LTV1-201ENST00000367576 CRCT1Q9UGL9 99 aa7.19□□□□□ -1.26
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LTV1-201ENST00000367576 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
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LTV1-201ENST00000367576 KRTAP10-12P60413 245 aa6.99□□□□□ -1.29
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LTV1-201ENST00000367576 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
LTV1-201ENST00000367576 MT1EP04732 61 aa6.5□□□□□ -1.37
LTV1-201ENST00000367576 KRTAP5-9P26371 169 aa6.43□□□□□ -1.38
LTV1-201ENST00000367576 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.42□□□□□ -1.38
LTV1-201ENST00000367576 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.41□□□□□ -1.38
LTV1-201ENST00000367576 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.36□□□□□ -1.39
LTV1-201ENST00000367576 MT1LQ93083 61 aa6.35□□□□□ -1.39
LTV1-201ENST00000367576 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.34□□□□□ -1.4
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