RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335475.5

KCNQ1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-202ENST00000335475 MIR22HGQ0VDD5 57 aa10.86□□□□□ -0.67
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KCNQ1-202ENST00000335475 KRTAP10-10P60014 251 aa8.79□□□□□ -1
KCNQ1-202ENST00000335475 PLAC4Q8WY50 150 aa8.78□□□□□ -1
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KCNQ1-202ENST00000335475 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa8.5□□□□□ -1.05
KCNQ1-202ENST00000335475 KRTAP10-5P60370 271 aa8.44□□□□□ -1.06
KCNQ1-202ENST00000335475 MT1XP80297 61 aa8.44□□□□□ -1.06
KCNQ1-202ENST00000335475 LCE3AQ5TA76 89 aa8.41□□□□□ -1.06
KCNQ1-202ENST00000335475 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa8.29□□□□□ -1.08
KCNQ1-202ENST00000335475 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa8.24□□□□□ -1.09
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KCNQ1-202ENST00000335475 KRTAP10-12P60413 245 aa8.17□□□□□ -1.1
KCNQ1-202ENST00000335475 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
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KCNQ1-202ENST00000335475 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa7.77□□□□□ -1.17
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KCNQ1-202ENST00000335475 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa7.69□□□□□ -1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 KMT2DO14686 5537 aa7.68□□□□□ -1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 INE1O15225 51 aa7.66□□□□□ -1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 SSPOA2VEC9 5147 aa7.59□□□□□ -1.19
KCNQ1-202ENST00000335475 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa7.53□□□□□ -1.2
KCNQ1-202ENST00000335475 LCE3CQ5T5A8 94 aa7.53□□□□□ -1.2
KCNQ1-202ENST00000335475 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa7.44□□□□□ -1.22
KCNQ1-202ENST00000335475 MT1EP04732 61 aa7.33□□□□□ -1.24
KCNQ1-202ENST00000335475 MT1LQ93083 61 aa7.29□□□□□ -1.24
KCNQ1-202ENST00000335475 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa7.28□□□□□ -1.24
KCNQ1-202ENST00000335475 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.24□□□□□ -1.25
KCNQ1-202ENST00000335475 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa7.23□□□□□ -1.25
KCNQ1-202ENST00000335475 FSIP2Q5CZC0 6907 aa7.15□□□□□ -1.27
KCNQ1-202ENST00000335475 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
KCNQ1-202ENST00000335475 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
KCNQ1-202ENST00000335475 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa7.03□□□□□ -1.28
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