RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 PRO0628Q9UI54 55 aa9.01□□□□□ -0.97
ACTB-201ENST00000331789 A8MU10 97 aa9.01□□□□□ -0.97
ACTB-201ENST00000331789 PCLOQ9Y6V0 5065 aa9.01□□□□□ -0.97
ACTB-201ENST00000331789 LCA10Q71F78 164 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-201ENST00000331789 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa8.97□□□□□ -0.97
ACTB-201ENST00000331789 S4R3F8 94 aa8.97□□□□□ -0.97
ACTB-201ENST00000331789 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa8.96□□□□□ -0.97
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa8.95□□□□□ -0.98
ACTB-201ENST00000331789 SEC61GP60059 68 aa8.94□□□□□ -0.98
ACTB-201ENST00000331789 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa8.9□□□□□ -0.99
ACTB-201ENST00000331789 UQCR11O14957 56 aa8.84□□□□□ -1
ACTB-201ENST00000331789 MUC17Q685J3 4493 aa8.83□□□□□ -1
ACTB-201ENST00000331789 HERC1Q15751 4861 aa8.83□□□□□ -1
ACTB-201ENST00000331789 MIR22HGQ0VDD5 57 aa8.79□□□□□ -1
ACTB-201ENST00000331789 SPATA8Q6RVD6 105 aa8.79□□□□□ -1
ACTB-201ENST00000331789 A0A1B0GU33 70 aa8.76□□□□□ -1.01
ACTB-201ENST00000331789 HMCN2Q8NDA2 5059 aa8.76□□□□□ -1.01
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
ACTB-201ENST00000331789 CSAG1Q6PB30 78 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-201ENST00000331789 H0YAA0 97 aa8.68□□□□□ -1.02
ACTB-201ENST00000331789 P0C880 135 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-201ENST00000331789 PMAIP1Q13794 54 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-201ENST00000331789 ADM2Q7Z4H4 148 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-201ENST00000331789 MUC2Q02817 5179 aa8.57□□□□□ -1.04
ACTB-201ENST00000331789 A6NN06 94 aa8.56□□□□□ -1.04
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa8.56□□□□□ -1.04
ACTB-201ENST00000331789 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
ACTB-201ENST00000331789 A0A0D9SG42 100 aa8.42□□□□□ -1.06
ACTB-201ENST00000331789 LCE2CQ5TA81 110 aa8.42□□□□□ -1.06
ACTB-201ENST00000331789 UBR4Q5T4S7 5183 aa8.37□□□□□ -1.07
ACTB-201ENST00000331789 RNF213Q63HN8 5207 aa8.37□□□□□ -1.07
ACTB-201ENST00000331789 M0QZ58 72 aa8.34□□□□□ -1.07
ACTB-201ENST00000331789 LORP23490 312 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
ACTB-201ENST00000331789 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa8.31□□□□□ -1.08
ACTB-201ENST00000331789 K7ERS5 55 aa8.29□□□□□ -1.08
ACTB-201ENST00000331789 R4GN34 69 aa8.27□□□□□ -1.09
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP12-2P59991 146 aa8.23□□□□□ -1.09
ACTB-201ENST00000331789 MT1HP80294 61 aa8.22□□□□□ -1.09
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP12-1P59990 96 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTB-201ENST00000331789 LINC01554Q52M75 96 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTB-201ENST00000331789 SPINT4Q6UDR6 99 aa8.19□□□□□ -1.1
ACTB-201ENST00000331789 FAT4Q6V0I7 4981 aa8.18□□□□□ -1.1
ACTB-201ENST00000331789 M0R2T5 61 aa8.17□□□□□ -1.1
ACTB-201ENST00000331789 PRAC1Q96KF2 57 aa8.13□□□□□ -1.11
ACTB-201ENST00000331789 CRIPTQ9P021 101 aa8.03□□□□□ -1.12
ACTB-201ENST00000331789 ROMO1P60602 79 aa8.03□□□□□ -1.12
ACTB-201ENST00000331789 MT2AP02795 61 aa7.96□□□□□ -1.13
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa7.95□□□□□ -1.14
ACTB-201ENST00000331789 MT1FP04733 61 aa7.93□□□□□ -1.14
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP10-10P60014 251 aa7.91□□□□□ -1.14
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa7.88□□□□□ -1.15
ACTB-201ENST00000331789 SPRR2GQ9BYE4 73 aa7.87□□□□□ -1.15
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa7.82□□□□□ -1.16
ACTB-201ENST00000331789 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa7.78□□□□□ -1.16
ACTB-201ENST00000331789 C10orf95Q9H7T3 257 aa7.78□□□□□ -1.16
ACTB-201ENST00000331789 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
ACTB-201ENST00000331789 PLAC4Q8WY50 150 aa7.68□□□□□ -1.18
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa7.66□□□□□ -1.18
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa7.63□□□□□ -1.19
ACTB-201ENST00000331789 MT1BP07438 61 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-201ENST00000331789 LCE2BO14633 110 aa7.43□□□□□ -1.22
ACTB-201ENST00000331789 TNP1P09430 55 aa7.42□□□□□ -1.22
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP10-5P60370 271 aa7.36□□□□□ -1.23
ACTB-201ENST00000331789 MT1XP80297 61 aa7.36□□□□□ -1.23
ACTB-201ENST00000331789 PP632Q6XCG6 107 aa7.29□□□□□ -1.24
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP23-1A1A580 65 aa7.21□□□□□ -1.26
ACTB-201ENST00000331789 PRO2289Q9P1D8 64 aa7.17□□□□□ -1.26
ACTB-201ENST00000331789 USH2AO75445 5202 aa7.15□□□□□ -1.27
ACTB-201ENST00000331789 LCE3AQ5TA76 89 aa7.13□□□□□ -1.27
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP10-12P60413 245 aa7.03□□□□□ -1.28
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa7□□□□□ -1.29
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.93□□□□□ -1.3
ACTB-201ENST00000331789 SSPOA2VEC9 5147 aa6.89□□□□□ -1.31
ACTB-201ENST00000331789 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.85□□□□□ -1.31
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP12-3P60328 96 aa6.8□□□□□ -1.32
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.8□□□□□ -1.32
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.8□□□□□ -1.32
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.78□□□□□ -1.32
ACTB-201ENST00000331789 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.74□□□□□ -1.33
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa6.73□□□□□ -1.33
ACTB-201ENST00000331789 KMT2DO14686 5537 aa6.71□□□□□ -1.33
ACTB-201ENST00000331789 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.6□□□□□ -1.35
ACTB-201ENST00000331789 NDUFAF8A1L188 74 aa6.58□□□□□ -1.36
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa6.56□□□□□ -1.36
ACTB-201ENST00000331789 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
ACTB-201ENST00000331789 LUZP6Q538Z0 58 aa6.46□□□□□ -1.37
ACTB-201ENST00000331789 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.46□□□□□ -1.37
ACTB-201ENST00000331789 MT1EP04732 61 aa6.42□□□□□ -1.38
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.41□□□□□ -1.38
ACTB-201ENST00000331789 H3BS24 57 aa6.39□□□□□ -1.39
ACTB-201ENST00000331789 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.38□□□□□ -1.39
ACTB-201ENST00000331789 MT1LQ93083 61 aa6.33□□□□□ -1.4
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.26□□□□□ -1.41
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.19□□□□□ -1.42
ACTB-201ENST00000331789 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
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