RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270517.11

ECSIT-202, Transcript of ECSIT signalling integrator, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECSIT, Length 1,700 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECSIT-202ENST00000270517 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa9.32□□□□□ -0.92
ECSIT-202ENST00000270517 PRO0628Q9UI54 55 aa9.31□□□□□ -0.92
ECSIT-202ENST00000270517 COX6B2Q6YFQ2 88 aa9.3□□□□□ -0.92
ECSIT-202ENST00000270517 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa9.29□□□□□ -0.92
ECSIT-202ENST00000270517 LCE2CQ5TA81 110 aa9.28□□□□□ -0.92
ECSIT-202ENST00000270517 PRR15LQ9BU68 103 aa9.27□□□□□ -0.93
ECSIT-202ENST00000270517 BRK1Q8WUW1 75 aa9.26□□□□□ -0.93
ECSIT-202ENST00000270517 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa9.19□□□□□ -0.94
ECSIT-202ENST00000270517 MT1HP80294 61 aa9.18□□□□□ -0.94
ECSIT-202ENST00000270517 M0R2T5 61 aa9.12□□□□□ -0.95
ECSIT-202ENST00000270517 SPINK7P58062 85 aa9.11□□□□□ -0.95
ECSIT-202ENST00000270517 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa9.09□□□□□ -0.95
ECSIT-202ENST00000270517 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa9.06□□□□□ -0.96
ECSIT-202ENST00000270517 A6NED7 52 aa9.04□□□□□ -0.96
ECSIT-202ENST00000270517 A8MU10 97 aa9.04□□□□□ -0.96
ECSIT-202ENST00000270517 LCA10Q71F78 164 aa9.03□□□□□ -0.96
ECSIT-202ENST00000270517 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa9□□□□□ -0.97
ECSIT-202ENST00000270517 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
ECSIT-202ENST00000270517 A0A1B0GU69 56 aa8.98□□□□□ -0.97
ECSIT-202ENST00000270517 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
ECSIT-202ENST00000270517 LORP23490 312 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
ECSIT-202ENST00000270517 SPTSSBQ8NFR3 76 aa8.91□□□□□ -0.98
ECSIT-202ENST00000270517 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa8.89□□□□□ -0.99
ECSIT-202ENST00000270517 SPATA8Q6RVD6 105 aa8.81□□□□□ -1
ECSIT-202ENST00000270517 UQCR11O14957 56 aa8.79□□□□□ -1
ECSIT-202ENST00000270517 SEC61GP60059 68 aa8.76□□□□□ -1.01
ECSIT-202ENST00000270517 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa8.76□□□□□ -1.01
ECSIT-202ENST00000270517 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
ECSIT-202ENST00000270517 PMAIP1Q13794 54 aa8.75□□□□□ -1.01
ECSIT-202ENST00000270517 A6NN06 94 aa8.74□□□□□ -1.01
ECSIT-202ENST00000270517 MIR22HGQ0VDD5 57 aa8.74□□□□□ -1.01
ECSIT-202ENST00000270517 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa8.72□□□□□ -1.01
ECSIT-202ENST00000270517 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa8.71□□□□□ -1.02
ECSIT-202ENST00000270517 MT2AP02795 61 aa8.64□□□□□ -1.03
ECSIT-202ENST00000270517 S4R3F8 94 aa8.63□□□□□ -1.03
ECSIT-202ENST00000270517 H0YAA0 97 aa8.6□□□□□ -1.03
ECSIT-202ENST00000270517 A0A1B0GU33 70 aa8.59□□□□□ -1.03
ECSIT-202ENST00000270517 KRTAP10-10P60014 251 aa8.59□□□□□ -1.03
ECSIT-202ENST00000270517 MT1FP04733 61 aa8.57□□□□□ -1.04
ECSIT-202ENST00000270517 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa8.57□□□□□ -1.04
ECSIT-202ENST00000270517 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa8.52□□□□□ -1.05
ECSIT-202ENST00000270517 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa8.51□□□□□ -1.05
ECSIT-202ENST00000270517 FSIP2Q5CZC0 6907 aa8.5□□□□□ -1.05
ECSIT-202ENST00000270517 CRCT1Q9UGL9 99 aa8.46□□□□□ -1.06
ECSIT-202ENST00000270517 CSAG1Q6PB30 78 aa8.43□□□□□ -1.06
ECSIT-202ENST00000270517 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa8.43□□□□□ -1.06
ECSIT-202ENST00000270517 P0C880 135 aa8.36□□□□□ -1.07
ECSIT-202ENST00000270517 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa8.36□□□□□ -1.07
ECSIT-202ENST00000270517 LCE2BO14633 110 aa8.34□□□□□ -1.07
ECSIT-202ENST00000270517 ADM2Q7Z4H4 148 aa8.3□□□□□ -1.08
ECSIT-202ENST00000270517 USH2AO75445 5202 aa8.29□□□□□ -1.08
ECSIT-202ENST00000270517 PRAC1Q96KF2 57 aa8.21□□□□□ -1.09
ECSIT-202ENST00000270517 K7ERS5 55 aa8.19□□□□□ -1.1
ECSIT-202ENST00000270517 SSPOA2VEC9 5147 aa8.15□□□□□ -1.11
ECSIT-202ENST00000270517 M0QZ58 72 aa8.15□□□□□ -1.11
ECSIT-202ENST00000270517 A0A0D9SG42 100 aa8.14□□□□□ -1.11
ECSIT-202ENST00000270517 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa8.11□□□□□ -1.11
ECSIT-202ENST00000270517 KRTAP12-1P59990 96 aa8.04□□□□□ -1.12
ECSIT-202ENST00000270517 KRTAP12-2P59991 146 aa8.04□□□□□ -1.12
ECSIT-202ENST00000270517 SPRR2GQ9BYE4 73 aa8.03□□□□□ -1.12
ECSIT-202ENST00000270517 CRIPTQ9P021 101 aa8.02□□□□□ -1.13
ECSIT-202ENST00000270517 ROMO1P60602 79 aa8□□□□□ -1.13
ECSIT-202ENST00000270517 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa7.98□□□□□ -1.13
ECSIT-202ENST00000270517 R4GN34 69 aa7.95□□□□□ -1.14
ECSIT-202ENST00000270517 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa7.94□□□□□ -1.14
ECSIT-202ENST00000270517 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
ECSIT-202ENST00000270517 MT1BP07438 61 aa7.92□□□□□ -1.14
ECSIT-202ENST00000270517 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa7.92□□□□□ -1.14
ECSIT-202ENST00000270517 SPINT4Q6UDR6 99 aa7.91□□□□□ -1.14
ECSIT-202ENST00000270517 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
ECSIT-202ENST00000270517 LINC01554Q52M75 96 aa7.85□□□□□ -1.15
ECSIT-202ENST00000270517 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa7.69□□□□□ -1.18
ECSIT-202ENST00000270517 KRTAP10-5P60370 271 aa7.69□□□□□ -1.18
ECSIT-202ENST00000270517 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
ECSIT-202ENST00000270517 PLAC4Q8WY50 150 aa7.68□□□□□ -1.18
ECSIT-202ENST00000270517 C10orf95Q9H7T3 257 aa7.63□□□□□ -1.19
ECSIT-202ENST00000270517 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
ECSIT-202ENST00000270517 PRO2289Q9P1D8 64 aa7.54□□□□□ -1.2
ECSIT-202ENST00000270517 MT1XP80297 61 aa7.49□□□□□ -1.21
ECSIT-202ENST00000270517 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa7.47□□□□□ -1.21
ECSIT-202ENST00000270517 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa7.41□□□□□ -1.22
ECSIT-202ENST00000270517 PP632Q6XCG6 107 aa7.25□□□□□ -1.25
ECSIT-202ENST00000270517 TNP1P09430 55 aa7.21□□□□□ -1.26
ECSIT-202ENST00000270517 KRTAP23-1A1A580 65 aa7.18□□□□□ -1.26
ECSIT-202ENST00000270517 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
ECSIT-202ENST00000270517 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa7.16□□□□□ -1.26
ECSIT-202ENST00000270517 KRTAP5-9P26371 169 aa7.15□□□□□ -1.26
ECSIT-202ENST00000270517 KMT2DO14686 5537 aa7.15□□□□□ -1.26
ECSIT-202ENST00000270517 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa7.15□□□□□ -1.27
ECSIT-202ENST00000270517 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa7.12□□□□□ -1.27
ECSIT-202ENST00000270517 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa7.12□□□□□ -1.27
ECSIT-202ENST00000270517 KRTAP10-12P60413 245 aa7.1□□□□□ -1.27
ECSIT-202ENST00000270517 SPRR2FQ96RM1 72 aa7.1□□□□□ -1.27
ECSIT-202ENST00000270517 NEBP20929 6669 aa7.07□□□□□ -1.28
ECSIT-202ENST00000270517 MUC12Q9UKN1 5478 aa7.04□□□□□ -1.28
ECSIT-202ENST00000270517 SPRR2EP22531 72 aa6.93□□□□□ -1.3
ECSIT-202ENST00000270517 SPRR2BP35325 72 aa6.93□□□□□ -1.3
ECSIT-202ENST00000270517 SPRR2AP35326 72 aa6.93□□□□□ -1.3
ECSIT-202ENST00000270517 MDN1Q9NU22 5596 aa6.89□□□□□ -1.31
ECSIT-202ENST00000270517 LCE3AQ5TA76 89 aa6.89□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.7 ms