RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa11.11□□□□□ -0.63
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ODC1-201ENST00000234111 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa10.96□□□□□ -0.65
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ODC1-201ENST00000234111 KRTAP10-10P60014 251 aa8.11□□□□□ -1.11
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ODC1-201ENST00000234111 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa7.59□□□□□ -1.19
ODC1-201ENST00000234111 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa7.59□□□□□ -1.19
ODC1-201ENST00000234111 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa7.59□□□□□ -1.19
ODC1-201ENST00000234111 FSIP2Q5CZC0 6907 aa7.57□□□□□ -1.2
ODC1-201ENST00000234111 LCE2BO14633 110 aa7.54□□□□□ -1.2
ODC1-201ENST00000234111 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.42□□□□□ -1.22
ODC1-201ENST00000234111 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa7.38□□□□□ -1.23
ODC1-201ENST00000234111 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa7.38□□□□□ -1.23
ODC1-201ENST00000234111 SSPOA2VEC9 5147 aa7.27□□□□□ -1.24
ODC1-201ENST00000234111 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa7.22□□□□□ -1.25
ODC1-201ENST00000234111 MT1LQ93083 61 aa7.04□□□□□ -1.28
ODC1-201ENST00000234111 KRTAP12-4P60329 112 aa6.94□□□□□ -1.3
ODC1-201ENST00000234111 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.94□□□□□ -1.3
ODC1-201ENST00000234111 MT1EP04732 61 aa6.93□□□□□ -1.3
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