RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 TPRXLQ17RH7 258 aa3.47□□□□□ -1.85
PDE4D-228ENST00000636120 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa3.46□□□□□ -1.85
PDE4D-228ENST00000636120 A8MU10 97 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-228ENST00000636120 ATMQ13315 3056 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-228ENST00000636120 KALRNO60229 2985 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-228ENST00000636120 NDUFAF8A1L188 74 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-228ENST00000636120 FLNCQ14315 2725 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-228ENST00000636120 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-228ENST00000636120 ZZEF1O43149 2961 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-228ENST00000636120 HIVEP1P15822 2718 aa3.44□□□□□ -1.86
PDE4D-228ENST00000636120 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa3.44□□□□□ -1.86
PDE4D-228ENST00000636120 A0A1B0GVY2 172 aa3.44□□□□□ -1.86
PDE4D-228ENST00000636120 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa3.43□□□□□ -1.86
PDE4D-228ENST00000636120 STAB1Q9NY15 2570 aa3.43□□□□□ -1.86
PDE4D-228ENST00000636120 FRYLO94915 3013 aa3.42□□□□□ -1.86
PDE4D-228ENST00000636120 FREM2Q5SZK8 3169 aa3.42□□□□□ -1.86
PDE4D-228ENST00000636120 NOTCH1P46531 2555 aa3.41□□□□□ -1.86
PDE4D-228ENST00000636120 COL12A1Q99715 3063 aa3.41□□□□□ -1.86
PDE4D-228ENST00000636120 DMXL1Q9Y485 3027 aa3.41□□□□□ -1.86
PDE4D-228ENST00000636120 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-228ENST00000636120 TNP1P09430 55 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-228ENST00000636120 NBEAQ8NFP9 2946 aa3.37□□□□□ -1.87
PDE4D-228ENST00000636120 KRTAP10-8P60410 259 aa3.37□□□□□ -1.87
PDE4D-228ENST00000636120 PP632Q6XCG6 107 aa3.35□□□□□ -1.87
PDE4D-228ENST00000636120 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
PDE4D-228ENST00000636120 H0YAA0 97 aa3.33□□□□□ -1.88
PDE4D-228ENST00000636120 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-228ENST00000636120 TACC2O95359 2948 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-228ENST00000636120 PDZD2O15018 2839 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-228ENST00000636120 TENM4Q6N022 2769 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-228ENST00000636120 FBN2P35556 2912 aa3.29□□□□□ -1.88
PDE4D-228ENST00000636120 LOC400499M0QZD8 3231 aa3.29□□□□□ -1.88
PDE4D-228ENST00000636120 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PDE4D-228ENST00000636120 MYO15AQ9UKN7 3530 aa3.28□□□□□ -1.88
PDE4D-228ENST00000636120 STAB2Q8WWQ8 2551 aa3.28□□□□□ -1.88
PDE4D-228ENST00000636120 ZANQ9Y493 2812 aa3.28□□□□□ -1.89
PDE4D-228ENST00000636120 SPEGQ15772 3267 aa3.26□□□□□ -1.89
PDE4D-228ENST00000636120 CELSR2Q9HCU4 2923 aa3.26□□□□□ -1.89
PDE4D-228ENST00000636120 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa3.24□□□□□ -1.89
PDE4D-228ENST00000636120 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa3.24□□□□□ -1.89
PDE4D-228ENST00000636120 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.23□□□□□ -1.89
PDE4D-228ENST00000636120 P0C880 135 aa3.22□□□□□ -1.89
PDE4D-228ENST00000636120 ASPMQ8IZT6 3477 aa3.22□□□□□ -1.89
PDE4D-228ENST00000636120 KRTAP10-10P60014 251 aa3.22□□□□□ -1.89
PDE4D-228ENST00000636120 ALMS1Q8TCU4 4167 aa3.22□□□□□ -1.89
PDE4D-228ENST00000636120 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa3.21□□□□□ -1.89
PDE4D-228ENST00000636120 C10orf95Q9H7T3 257 aa3.21□□□□□ -1.9
PDE4D-228ENST00000636120 DCHS2Q6V1P9 2916 aa3.21□□□□□ -1.9
PDE4D-228ENST00000636120 MXRA5Q9NR99 2828 aa3.19□□□□□ -1.9
PDE4D-228ENST00000636120 BSNQ9UPA5 3926 aa3.19□□□□□ -1.9
PDE4D-228ENST00000636120 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa3.17□□□□□ -1.9
PDE4D-228ENST00000636120 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa3.17□□□□□ -1.9
PDE4D-228ENST00000636120 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
PDE4D-228ENST00000636120 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
PDE4D-228ENST00000636120 NF1P21359 2839 aa3.16□□□□□ -1.9
PDE4D-228ENST00000636120 RELNP78509 3460 aa3.16□□□□□ -1.9
PDE4D-228ENST00000636120 DMDP11532 3685 aa3.16□□□□□ -1.9
PDE4D-228ENST00000636120 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-228ENST00000636120 KRTAP12-2P59991 146 aa3.13□□□□□ -1.91
PDE4D-228ENST00000636120 OTOGQ6ZRI0 2925 aa3.13□□□□□ -1.91
PDE4D-228ENST00000636120 ZFHX4Q86UP3 3567 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-228ENST00000636120 TENM3Q9P273 2699 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-228ENST00000636120 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-228ENST00000636120 LAMA5O15230 3695 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-228ENST00000636120 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-228ENST00000636120 KRTAP12-1P59990 96 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-228ENST00000636120 TENM2Q9NT68 2774 aa3.09□□□□□ -1.91
PDE4D-228ENST00000636120 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.92
PDE4D-228ENST00000636120 DCHS1Q96JQ0 3298 aa3.09□□□□□ -1.92
PDE4D-228ENST00000636120 MT1HL1P0DM35 61 aa3.08□□□□□ -1.92
PDE4D-228ENST00000636120 AKAP9Q99996 3911 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-228ENST00000636120 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-228ENST00000636120 CSMD1Q96PZ7 3565 aa3.06□□□□□ -1.92
PDE4D-228ENST00000636120 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
PDE4D-228ENST00000636120 KRTAP23-1A1A580 65 aa3.05□□□□□ -1.92
PDE4D-228ENST00000636120 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
PDE4D-228ENST00000636120 TGP01266 2768 aa3.04□□□□□ -1.92
PDE4D-228ENST00000636120 TENM1Q9UKZ4 2725 aa3.04□□□□□ -1.92
PDE4D-228ENST00000636120 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
PDE4D-228ENST00000636120 DNAH9Q9NYC9 4486 aa3□□□□□ -1.93
PDE4D-228ENST00000636120 VWFP04275 2813 aa3□□□□□ -1.93
PDE4D-228ENST00000636120 SVEP1Q4LDE5 3571 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-228ENST00000636120 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-228ENST00000636120 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa2.96□□□□□ -1.94
PDE4D-228ENST00000636120 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa2.96□□□□□ -1.94
PDE4D-228ENST00000636120 MUC3AQ02505 3323 aa2.95□□□□□ -1.94
PDE4D-228ENST00000636120 DNAH3Q8TD57 4116 aa2.94□□□□□ -1.94
PDE4D-228ENST00000636120 VPS13CQ709C8 3753 aa2.92□□□□□ -1.94
PDE4D-228ENST00000636120 DNAH1Q9P2D7 4330 aa2.92□□□□□ -1.94
PDE4D-228ENST00000636120 DNAH2Q9P225 4427 aa2.92□□□□□ -1.94
PDE4D-228ENST00000636120 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa2.91□□□□□ -1.94
PDE4D-228ENST00000636120 CUBNO60494 3623 aa2.9□□□□□ -1.94
PDE4D-228ENST00000636120 CSMD2Q7Z408 3487 aa2.9□□□□□ -1.95
PDE4D-228ENST00000636120 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa2.9□□□□□ -1.95
PDE4D-228ENST00000636120 VPS13DQ5THJ4 4388 aa2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-228ENST00000636120 DNAH6Q9C0G6 4158 aa2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-228ENST00000636120 DNAH17Q9UFH2 4485 aa2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-228ENST00000636120 DNAH10Q8IVF4 4471 aa2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-228ENST00000636120 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-228ENST00000636120 ZFHX3Q15911 3703 aa2.87□□□□□ -1.95
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