RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635555.1

LINC00466-210, long intergenic non-protein coding RNA 466, humanhuman

TSL 5

Gene LINC00466, Length 1,016 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00466-210ENST00000635555 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa4.73□□□□□ -1.65
LINC00466-210ENST00000635555 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
LINC00466-210ENST00000635555 CXCL6P80162 114 aa4.73□□□□□ -1.65
LINC00466-210ENST00000635555 A0A0G2JQZ4 141 aa4.72□□□□□ -1.65
LINC00466-210ENST00000635555 Q5VSD8 79 aa4.72□□□□□ -1.65
LINC00466-210ENST00000635555 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
LINC00466-210ENST00000635555 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
LINC00466-210ENST00000635555 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
LINC00466-210ENST00000635555 F8WEM9 126 aa4.7□□□□□ -1.66
LINC00466-210ENST00000635555 Q75L30 129 aa4.7□□□□□ -1.66
LINC00466-210ENST00000635555 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa4.7□□□□□ -1.66
LINC00466-210ENST00000635555 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
LINC00466-210ENST00000635555 NREPQ16612 68 aa4.69□□□□□ -1.66
LINC00466-210ENST00000635555 KRTAP10-5P60370 271 aa4.68□□□□□ -1.66
LINC00466-210ENST00000635555 ANAPC11Q9NYG5 84 aa4.68□□□□□ -1.66
LINC00466-210ENST00000635555 A0A087WVE0 104 aa4.67□□□□□ -1.66
LINC00466-210ENST00000635555 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa4.67□□□□□ -1.66
LINC00466-210ENST00000635555 DSCR10P59022 87 aa4.67□□□□□ -1.66
LINC00466-210ENST00000635555 LINC00472Q9H8W2 130 aa4.67□□□□□ -1.66
LINC00466-210ENST00000635555 IGKV4-1P06312 121 aa4.66□□□□□ -1.66
LINC00466-210ENST00000635555 FAM229BQ4G0N7 80 aa4.66□□□□□ -1.66
LINC00466-210ENST00000635555 LCE1FQ5T754 118 aa4.66□□□□□ -1.66
LINC00466-210ENST00000635555 A0A087WSZ3 146 aa4.65□□□□□ -1.67
LINC00466-210ENST00000635555 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa4.65□□□□□ -1.67
LINC00466-210ENST00000635555 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa4.65□□□□□ -1.67
LINC00466-210ENST00000635555 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa4.65□□□□□ -1.67
LINC00466-210ENST00000635555 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
LINC00466-210ENST00000635555 BPY2O14599 106 aa4.64□□□□□ -1.67
LINC00466-210ENST00000635555 MOBPQ13875 183 aa4.64□□□□□ -1.67
LINC00466-210ENST00000635555 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa4.64□□□□□ -1.67
LINC00466-210ENST00000635555 Q96NJ1 140 aa4.64□□□□□ -1.67
LINC00466-210ENST00000635555 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa4.63□□□□□ -1.67
LINC00466-210ENST00000635555 KRTAP10-12P60413 245 aa4.63□□□□□ -1.67
LINC00466-210ENST00000635555 CD164Q04900 197 aa4.63□□□□□ -1.67
LINC00466-210ENST00000635555 A0A087X002 238 aa4.62□□□□□ -1.67
LINC00466-210ENST00000635555 SPINK6Q6UWN8 80 aa4.62□□□□□ -1.67
LINC00466-210ENST00000635555 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa4.62□□□□□ -1.67
LINC00466-210ENST00000635555 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa4.62□□□□□ -1.67
LINC00466-210ENST00000635555 MYCBP2O75592 4640 aa4.61□□□□□ -1.67
LINC00466-210ENST00000635555 ATOX1O00244 68 aa4.61□□□□□ -1.67
LINC00466-210ENST00000635555 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa4.61□□□□□ -1.67
LINC00466-210ENST00000635555 C9orf153Q5TBE3 101 aa4.61□□□□□ -1.67
LINC00466-210ENST00000635555 Q8N9L7 120 aa4.61□□□□□ -1.67
LINC00466-210ENST00000635555 ANAPC13Q9BS18 74 aa4.61□□□□□ -1.67
LINC00466-210ENST00000635555 Q5XG85 94 aa4.6□□□□□ -1.67
LINC00466-210ENST00000635555 K7EQZ3 153 aa4.59□□□□□ -1.67
LINC00466-210ENST00000635555 J3KT08 172 aa4.58□□□□□ -1.68
LINC00466-210ENST00000635555 COX7CP15954 63 aa4.58□□□□□ -1.68
LINC00466-210ENST00000635555 PRR15Q8IV56 129 aa4.58□□□□□ -1.68
LINC00466-210ENST00000635555 FAT3Q8TDW7 4589 aa4.57□□□□□ -1.68
LINC00466-210ENST00000635555 A8MWP4 228 aa4.57□□□□□ -1.68
LINC00466-210ENST00000635555 CCDC179H3BU77 68 aa4.57□□□□□ -1.68
LINC00466-210ENST00000635555 DEFB116Q30KQ4 102 aa4.57□□□□□ -1.68
LINC00466-210ENST00000635555 SERP2Q8N6R1 65 aa4.57□□□□□ -1.68
LINC00466-210ENST00000635555 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
LINC00466-210ENST00000635555 OCR1Q9BZK8 76 aa4.56□□□□□ -1.68
LINC00466-210ENST00000635555 SS18L2Q9UHA2 77 aa4.56□□□□□ -1.68
LINC00466-210ENST00000635555 TRAV7A0A075B6U4 112 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00466-210ENST00000635555 UQCRQO14949 82 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00466-210ENST00000635555 HRCT1Q6UXD1 115 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00466-210ENST00000635555 SMIM20Q8N5G0 67 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00466-210ENST00000635555 HERC1Q15751 4861 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00466-210ENST00000635555 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa4.53□□□□□ -1.68
LINC00466-210ENST00000635555 HCG22E2RYF7 251 aa4.53□□□□□ -1.68
LINC00466-210ENST00000635555 OXTP01178 125 aa4.52□□□□□ -1.69
LINC00466-210ENST00000635555 RPS29P62273 56 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
LINC00466-210ENST00000635555 C1orf195Q5TG92 126 aa4.52□□□□□ -1.69
LINC00466-210ENST00000635555 A0A1B0GVX0 72 aa4.5□□□□□ -1.69
LINC00466-210ENST00000635555 NDUFAF8A1L188 74 aa4.5□□□□□ -1.69
LINC00466-210ENST00000635555 SPINK1P00995 79 aa4.5□□□□□ -1.69
LINC00466-210ENST00000635555 TYMSOSQ8TAI1 123 aa4.5□□□□□ -1.69
LINC00466-210ENST00000635555 CYSTM1Q9H1C7 97 aa4.5□□□□□ -1.69
LINC00466-210ENST00000635555 KRTAP10-8P60410 259 aa4.49□□□□□ -1.69
LINC00466-210ENST00000635555 C8orf17Q9NRJ1 99 aa4.49□□□□□ -1.69
LINC00466-210ENST00000635555 NDUFB1O75438 58 aa4.48□□□□□ -1.69
LINC00466-210ENST00000635555 KLKP1Q107X0 134 aa4.48□□□□□ -1.69
LINC00466-210ENST00000635555 SPAG11AQ6PDA7 123 aa4.48□□□□□ -1.69
LINC00466-210ENST00000635555 CASC2Q6XLA1 102 aa4.48□□□□□ -1.69
LINC00466-210ENST00000635555 TNXBP22105 4242 aa4.47□□□□□ -1.69
LINC00466-210ENST00000635555 A0A0U1RQV1 116 aa4.47□□□□□ -1.69
LINC00466-210ENST00000635555 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa4.47□□□□□ -1.69
LINC00466-210ENST00000635555 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
LINC00466-210ENST00000635555 WFDC13Q8IUB5 93 aa4.46□□□□□ -1.7
LINC00466-210ENST00000635555 LIMD2Q9BT23 127 aa4.46□□□□□ -1.7
LINC00466-210ENST00000635555 hDV103S1A0JD37 113 aa4.45□□□□□ -1.7
LINC00466-210ENST00000635555 MT1HL1P0DM35 61 aa4.45□□□□□ -1.7
LINC00466-210ENST00000635555 C5orf47Q569G3 176 aa4.45□□□□□ -1.7
LINC00466-210ENST00000635555 LINC00304Q8N9R0 145 aa4.45□□□□□ -1.7
LINC00466-210ENST00000635555 TMEM254Q8TBM7 123 aa4.45□□□□□ -1.7
LINC00466-210ENST00000635555 C8orf87E5RJ46 101 aa4.44□□□□□ -1.7
LINC00466-210ENST00000635555 C20orf197Q8N268 126 aa4.44□□□□□ -1.7
LINC00466-210ENST00000635555 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa4.43□□□□□ -1.7
LINC00466-210ENST00000635555 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.43□□□□□ -1.7
LINC00466-210ENST00000635555 H7BZZ5 65 aa4.43□□□□□ -1.7
LINC00466-210ENST00000635555 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
LINC00466-210ENST00000635555 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa4.42□□□□□ -1.7
LINC00466-210ENST00000635555 PRAC1Q96KF2 57 aa4.41□□□□□ -1.7
LINC00466-210ENST00000635555 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa4.41□□□□□ -1.7
LINC00466-210ENST00000635555 H3BPC8 53 aa4.4□□□□□ -1.71
LINC00466-210ENST00000635555 LINC00313P59037 77 aa4.4□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 100.6 ms