RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589931.1

TXNL1-210, Transcript of thioredoxin like 1, humanhuman

TSL 3

Gene TXNL1, Length 466 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNL1-210ENST00000589931 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa-0.51□□□□□ -2.49
TXNL1-210ENST00000589931 KALRNO60229 2985 aa-0.51□□□□□ -2.49
TXNL1-210ENST00000589931 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa-0.51□□□□□ -2.49
TXNL1-210ENST00000589931 HILPDAQ9Y5L2 63 aa-0.51□□□□□ -2.49
TXNL1-210ENST00000589931 NHSQ6T4R5 1651 aa-0.52□□□□□ -2.49
TXNL1-210ENST00000589931 MT4P47944 62 aa-0.52□□□□□ -2.49
TXNL1-210ENST00000589931 S4R3F8 94 aa-0.52□□□□□ -2.49
TXNL1-210ENST00000589931 NBEAQ8NFP9 2946 aa-0.52□□□□□ -2.49
TXNL1-210ENST00000589931 ACACAQ13085 2346 aa-0.53□□□□□ -2.49
TXNL1-210ENST00000589931 DUOX2Q9NRD8 1548 aa-0.53□□□□□ -2.49
TXNL1-210ENST00000589931 ITPR3Q14573 2671 aa-0.53□□□□□ -2.49
TXNL1-210ENST00000589931 FAT1Q14517 4588 aa-0.53□□□□□ -2.49
TXNL1-210ENST00000589931 PDCD5O14737 125 aa-0.53□□□□□ -2.49
TXNL1-210ENST00000589931 ATXN8Q156A1 80 aa-0.53□□□□□ -2.49
TXNL1-210ENST00000589931 DEFB106AQ8N104 65 aa-0.53□□□□□ -2.49
TXNL1-210ENST00000589931 APOBP04114 4563 aaKnown RBP-0.54□□□□□ -2.5
TXNL1-210ENST00000589931 STARD9Q9P2P6 4700 aa-0.54□□□□□ -2.5
TXNL1-210ENST00000589931 UBR4Q5T4S7 5183 aa-0.54□□□□□ -2.5
TXNL1-210ENST00000589931 ITSN2Q9NZM3 1697 aa-0.54□□□□□ -2.5
TXNL1-210ENST00000589931 ABCA9Q8IUA7 1624 aa-0.55□□□□□ -2.5
TXNL1-210ENST00000589931 DEFB114Q30KQ6 69 aa-0.55□□□□□ -2.5
TXNL1-210ENST00000589931 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa-0.55□□□□□ -2.5
TXNL1-210ENST00000589931 RYR3Q15413 4870 aa-0.55□□□□□ -2.5
TXNL1-210ENST00000589931 MGAM2Q2M2H8 2515 aa-0.56□□□□□ -2.5
TXNL1-210ENST00000589931 HERC2O95714 4834 aa-0.57□□□□□ -2.5
TXNL1-210ENST00000589931 DNAH11Q96DT5 4516 aa-0.57□□□□□ -2.5
TXNL1-210ENST00000589931 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa-0.57□□□□□ -2.5
TXNL1-210ENST00000589931 RPS27P42677 84 aaKnown RBP-0.57□□□□□ -2.5
TXNL1-210ENST00000589931 WT1-ASQ06250 92 aa-0.57□□□□□ -2.5
TXNL1-210ENST00000589931 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP-0.57□□□□□ -2.5
TXNL1-210ENST00000589931 CCDC168Q8NDH2 2452 aa-0.57□□□□□ -2.5
TXNL1-210ENST00000589931 LAMA1P25391 3075 aa-0.58□□□□□ -2.5
TXNL1-210ENST00000589931 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP-0.58□□□□□ -2.5
TXNL1-210ENST00000589931 MINOS1Q5TGZ0 78 aa-0.58□□□□□ -2.5
TXNL1-210ENST00000589931 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa-0.58□□□□□ -2.5
TXNL1-210ENST00000589931 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
TXNL1-210ENST00000589931 GNG13Q9P2W3 67 aa-0.59□□□□□ -2.5
TXNL1-210ENST00000589931 SACSQ9NZJ4 4579 aa-0.59□□□□□ -2.5
TXNL1-210ENST00000589931 ABCC6O95255 1503 aa-0.59□□□□□ -2.5
TXNL1-210ENST00000589931 C3P01024 1663 aa-0.59□□□□□ -2.5
TXNL1-210ENST00000589931 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa-0.6□□□□□ -2.5
TXNL1-210ENST00000589931 ACACBO00763 2458 aa-0.6□□□□□ -2.51
TXNL1-210ENST00000589931 USH2AO75445 5202 aa-0.6□□□□□ -2.51
TXNL1-210ENST00000589931 MUC17Q685J3 4493 aa-0.6□□□□□ -2.51
TXNL1-210ENST00000589931 KIF1AQ12756 1690 aa-0.61□□□□□ -2.51
TXNL1-210ENST00000589931 DNAH1Q9P2D7 4330 aa-0.61□□□□□ -2.51
TXNL1-210ENST00000589931 DNMBPQ6XZF7 1577 aa-0.62□□□□□ -2.51
TXNL1-210ENST00000589931 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP-0.62□□□□□ -2.51
TXNL1-210ENST00000589931 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa-0.63□□□□□ -2.51
TXNL1-210ENST00000589931 DNAH2Q9P225 4427 aa-0.64□□□□□ -2.51
TXNL1-210ENST00000589931 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa-0.64□□□□□ -2.51
TXNL1-210ENST00000589931 C6orf48Q9UBA6 75 aa-0.64□□□□□ -2.51
TXNL1-210ENST00000589931 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP-0.65□□□□□ -2.51
TXNL1-210ENST00000589931 RYR1P21817 5038 aa-0.65□□□□□ -2.51
TXNL1-210ENST00000589931 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
TXNL1-210ENST00000589931 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
TXNL1-210ENST00000589931 LINC01549A6NIU2 74 aa-0.66□□□□□ -2.52
TXNL1-210ENST00000589931 KIAA1109Q2LD37 5005 aa-0.66□□□□□ -2.52
TXNL1-210ENST00000589931 MADDQ8WXG6 1647 aa-0.67□□□□□ -2.52
TXNL1-210ENST00000589931 DEFB110Q30KQ9 67 aa-0.67□□□□□ -2.52
TXNL1-210ENST00000589931 HYDINQ4G0P3 5121 aa-0.67□□□□□ -2.52
TXNL1-210ENST00000589931 DNAH8Q96JB1 4490 aa-0.67□□□□□ -2.52
TXNL1-210ENST00000589931 MROH1Q8NDA8 1641 aa-0.67□□□□□ -2.52
TXNL1-210ENST00000589931 CLASP1Q7Z460 1538 aa-0.68□□□□□ -2.52
TXNL1-210ENST00000589931 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa-0.68□□□□□ -2.52
TXNL1-210ENST00000589931 FCER1GP30273 86 aa-0.68□□□□□ -2.52
TXNL1-210ENST00000589931 TLN2Q9Y4G6 2542 aa-0.68□□□□□ -2.52
TXNL1-210ENST00000589931 EFCAB5A4FU69 1503 aa-0.69□□□□□ -2.52
TXNL1-210ENST00000589931 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP-0.69□□□□□ -2.52
TXNL1-210ENST00000589931 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP-0.7□□□□□ -2.52
TXNL1-210ENST00000589931 H3BUA1 57 aa-0.7□□□□□ -2.52
TXNL1-210ENST00000589931 SFTA3P0C7M3 94 aa-0.7□□□□□ -2.52
TXNL1-210ENST00000589931 TRIOO75962 3097 aa-0.7□□□□□ -2.52
TXNL1-210ENST00000589931 K7EMI3 77 aa-0.71□□□□□ -2.52
TXNL1-210ENST00000589931 A0A0C4DFX4 3053 aa-0.73□□□□□ -2.53
TXNL1-210ENST00000589931 TIAM1Q13009 1591 aa-0.74□□□□□ -2.53
TXNL1-210ENST00000589931 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa-0.74□□□□□ -2.53
TXNL1-210ENST00000589931 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa-0.74□□□□□ -2.53
TXNL1-210ENST00000589931 ABCA6Q8N139 1617 aa-0.75□□□□□ -2.53
TXNL1-210ENST00000589931 RYR2Q92736 4967 aa-0.75□□□□□ -2.53
TXNL1-210ENST00000589931 COL12A1Q99715 3063 aa-0.75□□□□□ -2.53
TXNL1-210ENST00000589931 TEX15Q9BXT5 2789 aa-0.75□□□□□ -2.53
TXNL1-210ENST00000589931 A0A087WWC5 75 aa-0.75□□□□□ -2.53
TXNL1-210ENST00000589931 M0R1W7 72 aa-0.75□□□□□ -2.53
TXNL1-210ENST00000589931 CROCC2H7BZ55 1655 aa-0.75□□□□□ -2.53
TXNL1-210ENST00000589931 LY75O60449 1722 aa-0.75□□□□□ -2.53
TXNL1-210ENST00000589931 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
TXNL1-210ENST00000589931 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa-0.77□□□□□ -2.53
TXNL1-210ENST00000589931 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
TXNL1-210ENST00000589931 FRYQ5TBA9 3013 aa-0.78□□□□□ -2.53
TXNL1-210ENST00000589931 TNP1P09430 55 aa-0.78□□□□□ -2.53
TXNL1-210ENST00000589931 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa-0.78□□□□□ -2.54
TXNL1-210ENST00000589931 GLI2P10070 1586 aa-0.79□□□□□ -2.54
TXNL1-210ENST00000589931 RNF213Q63HN8 5207 aa-0.79□□□□□ -2.54
TXNL1-210ENST00000589931 RELNP78509 3460 aa-0.79□□□□□ -2.54
TXNL1-210ENST00000589931 C5orf42Q9H799 3197 aa-0.8□□□□□ -2.54
TXNL1-210ENST00000589931 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP-0.8□□□□□ -2.54
TXNL1-210ENST00000589931 IGIPA6NJ69 53 aa-0.8□□□□□ -2.54
TXNL1-210ENST00000589931 MT1HP80294 61 aa-0.8□□□□□ -2.54
TXNL1-210ENST00000589931 COL6A5A8TX70 2615 aa-0.8□□□□□ -2.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.7 ms