RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 PCOTHQ58A44 107 aa7.71□□□□□ -1.18
PRAME-213ENST00000492657 ALMS1Q8TCU4 4167 aa7.71□□□□□ -1.18
PRAME-213ENST00000492657 KRTAP10-2P60368 255 aa7.7□□□□□ -1.18
PRAME-213ENST00000492657 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
PRAME-213ENST00000492657 LRP1BQ9NZR2 4599 aa7.69□□□□□ -1.18
PRAME-213ENST00000492657 Q96NJ1 140 aa7.69□□□□□ -1.18
PRAME-213ENST00000492657 PKD1P98161 4303 aa7.68□□□□□ -1.18
PRAME-213ENST00000492657 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
PRAME-213ENST00000492657 LCA10Q71F78 164 aa7.66□□□□□ -1.18
PRAME-213ENST00000492657 FAT2Q9NYQ8 4349 aa7.66□□□□□ -1.18
PRAME-213ENST00000492657 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa7.65□□□□□ -1.18
PRAME-213ENST00000492657 A6NED7 52 aa7.65□□□□□ -1.18
PRAME-213ENST00000492657 IGLV7-43P04211 117 aa7.65□□□□□ -1.18
PRAME-213ENST00000492657 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa7.65□□□□□ -1.19
PRAME-213ENST00000492657 SPAG11AQ6PDA7 123 aa7.63□□□□□ -1.19
PRAME-213ENST00000492657 COA5Q86WW8 74 aa7.63□□□□□ -1.19
PRAME-213ENST00000492657 H3BPC8 53 aa7.62□□□□□ -1.19
PRAME-213ENST00000492657 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa7.6□□□□□ -1.19
PRAME-213ENST00000492657 CD164Q04900 197 aa7.6□□□□□ -1.19
PRAME-213ENST00000492657 KRTAP10-1P60331 282 aa7.6□□□□□ -1.19
PRAME-213ENST00000492657 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa7.6□□□□□ -1.19
PRAME-213ENST00000492657 A0A087X002 238 aa7.59□□□□□ -1.19
PRAME-213ENST00000492657 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa7.59□□□□□ -1.19
PRAME-213ENST00000492657 NDUFS5O43920 106 aa7.58□□□□□ -1.2
PRAME-213ENST00000492657 C8orf17Q9NRJ1 99 aa7.58□□□□□ -1.2
PRAME-213ENST00000492657 SPINK6Q6UWN8 80 aa7.57□□□□□ -1.2
PRAME-213ENST00000492657 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa7.57□□□□□ -1.2
PRAME-213ENST00000492657 LIMD2Q9BT23 127 aa7.56□□□□□ -1.2
PRAME-213ENST00000492657 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa7.56□□□□□ -1.2
PRAME-213ENST00000492657 A0A1B0GVX0 72 aa7.56□□□□□ -1.2
PRAME-213ENST00000492657 CDK2AP2O75956 126 aa7.55□□□□□ -1.2
PRAME-213ENST00000492657 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa7.55□□□□□ -1.2
PRAME-213ENST00000492657 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa7.54□□□□□ -1.2
PRAME-213ENST00000492657 SACSQ9NZJ4 4579 aa7.54□□□□□ -1.2
PRAME-213ENST00000492657 SPINK7P58062 85 aa7.53□□□□□ -1.2
PRAME-213ENST00000492657 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa7.53□□□□□ -1.2
PRAME-213ENST00000492657 PKHD1P08F94 4074 aa7.53□□□□□ -1.2
PRAME-213ENST00000492657 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7.51□□□□□ -1.21
PRAME-213ENST00000492657 Q6ZSA8 131 aa7.51□□□□□ -1.21
PRAME-213ENST00000492657 PRR26Q8N8Z3 221 aa7.51□□□□□ -1.21
PRAME-213ENST00000492657 Q75L30 129 aa7.5□□□□□ -1.21
PRAME-213ENST00000492657 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa7.49□□□□□ -1.21
PRAME-213ENST00000492657 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
PRAME-213ENST00000492657 A6NN06 94 aa7.48□□□□□ -1.21
PRAME-213ENST00000492657 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa7.48□□□□□ -1.21
PRAME-213ENST00000492657 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa7.48□□□□□ -1.21
PRAME-213ENST00000492657 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa7.46□□□□□ -1.21
PRAME-213ENST00000492657 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PRAME-213ENST00000492657 HRES1P13985 223 aa7.45□□□□□ -1.22
PRAME-213ENST00000492657 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa7.44□□□□□ -1.22
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PRAME-213ENST00000492657 Q5W150 140 aa7.42□□□□□ -1.22
PRAME-213ENST00000492657 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa7.42□□□□□ -1.22
PRAME-213ENST00000492657 ADM2Q7Z4H4 148 aa7.42□□□□□ -1.22
PRAME-213ENST00000492657 FAT1Q14517 4588 aa7.39□□□□□ -1.23
PRAME-213ENST00000492657 RETNLBQ9BQ08 111 aa7.38□□□□□ -1.23
PRAME-213ENST00000492657 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa7.38□□□□□ -1.23
PRAME-213ENST00000492657 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa7.38□□□□□ -1.23
PRAME-213ENST00000492657 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PRAME-213ENST00000492657 C7orf65Q6ZTY9 151 aa7.36□□□□□ -1.23
PRAME-213ENST00000492657 LINC00313P59037 77 aa7.34□□□□□ -1.23
PRAME-213ENST00000492657 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa7.34□□□□□ -1.23
PRAME-213ENST00000492657 C8orf87E5RJ46 101 aa7.33□□□□□ -1.24
PRAME-213ENST00000492657 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PRAME-213ENST00000492657 APOBP04114 4563 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PRAME-213ENST00000492657 TYMSOSQ8TAI1 123 aa7.3□□□□□ -1.24
PRAME-213ENST00000492657 RYR2Q92736 4967 aa7.3□□□□□ -1.24
PRAME-213ENST00000492657 A0A0A0MQY5 61 aa7.29□□□□□ -1.24
PRAME-213ENST00000492657 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PRAME-213ENST00000492657 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa7.27□□□□□ -1.25
PRAME-213ENST00000492657 ACYP2P14621 99 aa7.24□□□□□ -1.25
PRAME-213ENST00000492657 FAM229AH3BQW9 127 aa7.22□□□□□ -1.25
PRAME-213ENST00000492657 A0A1B0GVY2 172 aa7.21□□□□□ -1.26
PRAME-213ENST00000492657 SPINK1P00995 79 aa7.21□□□□□ -1.26
PRAME-213ENST00000492657 LINC00304Q8N9R0 145 aa7.19□□□□□ -1.26
PRAME-213ENST00000492657 IGKV2-30P06310 120 aa7.18□□□□□ -1.26
PRAME-213ENST00000492657 DMAC1Q96GE9 116 aa7.18□□□□□ -1.26
PRAME-213ENST00000492657 A0A1B0GU69 56 aa7.17□□□□□ -1.26
PRAME-213ENST00000492657 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa7.17□□□□□ -1.26
PRAME-213ENST00000492657 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa7.16□□□□□ -1.26
PRAME-213ENST00000492657 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PRAME-213ENST00000492657 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PRAME-213ENST00000492657 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
PRAME-213ENST00000492657 C9orf92A6NGG3 77 aa7.09□□□□□ -1.28
PRAME-213ENST00000492657 MIR22HGQ0VDD5 57 aa7.08□□□□□ -1.28
PRAME-213ENST00000492657 LINC01554Q52M75 96 aa7.08□□□□□ -1.28
PRAME-213ENST00000492657 CSAG1Q6PB30 78 aa7.07□□□□□ -1.28
PRAME-213ENST00000492657 RYR3Q15413 4870 aa7.07□□□□□ -1.28
PRAME-213ENST00000492657 RPS29P62273 56 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PRAME-213ENST00000492657 SPATA8Q6RVD6 105 aa7.03□□□□□ -1.28
PRAME-213ENST00000492657 HSPG2P98160 4391 aa7.02□□□□□ -1.29
PRAME-213ENST00000492657 UQCR11O14957 56 aa7.01□□□□□ -1.29
PRAME-213ENST00000492657 FAT3Q8TDW7 4589 aa7.01□□□□□ -1.29
PRAME-213ENST00000492657 Q8N1X5 172 aa7□□□□□ -1.29
PRAME-213ENST00000492657 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PRAME-213ENST00000492657 TNXBP22105 4242 aa6.99□□□□□ -1.29
PRAME-213ENST00000492657 RYR1P21817 5038 aa6.98□□□□□ -1.29
PRAME-213ENST00000492657 A8MUU9 505 aa6.95□□□□□ -1.3
PRAME-213ENST00000492657 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.95□□□□□ -1.3
PRAME-213ENST00000492657 MYCBP2O75592 4640 aa6.94□□□□□ -1.3
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