RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492485.5

TRIOBP-211, Transcript of TRIO and F-actin binding protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TRIOBP, Length 3,948 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBP-211ENST00000492485 CRIPTQ9P021 101 aa7.54□□□□□ -1.2
TRIOBP-211ENST00000492485 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa7.54□□□□□ -1.2
TRIOBP-211ENST00000492485 LINC00472Q9H8W2 130 aa7.53□□□□□ -1.2
TRIOBP-211ENST00000492485 C8orf87E5RJ46 101 aa7.53□□□□□ -1.2
TRIOBP-211ENST00000492485 APLNQ9ULZ1 77 aa7.53□□□□□ -1.2
TRIOBP-211ENST00000492485 HRES1P13985 223 aa7.52□□□□□ -1.21
TRIOBP-211ENST00000492485 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa7.51□□□□□ -1.21
TRIOBP-211ENST00000492485 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa7.51□□□□□ -1.21
TRIOBP-211ENST00000492485 TYMSOSQ8TAI1 123 aa7.5□□□□□ -1.21
TRIOBP-211ENST00000492485 LCA10Q71F78 164 aa7.48□□□□□ -1.21
TRIOBP-211ENST00000492485 MIR22HGQ0VDD5 57 aa7.47□□□□□ -1.21
TRIOBP-211ENST00000492485 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7.47□□□□□ -1.21
TRIOBP-211ENST00000492485 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa7.46□□□□□ -1.21
TRIOBP-211ENST00000492485 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa7.45□□□□□ -1.22
TRIOBP-211ENST00000492485 FAM229AH3BQW9 127 aa7.45□□□□□ -1.22
TRIOBP-211ENST00000492485 UQCR11O14957 56 aa7.45□□□□□ -1.22
TRIOBP-211ENST00000492485 AKAP9Q99996 3911 aa7.44□□□□□ -1.22
TRIOBP-211ENST00000492485 IGLV7-43P04211 117 aa7.44□□□□□ -1.22
TRIOBP-211ENST00000492485 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa7.44□□□□□ -1.22
TRIOBP-211ENST00000492485 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
TRIOBP-211ENST00000492485 Q5W150 140 aa7.43□□□□□ -1.22
TRIOBP-211ENST00000492485 ADM2Q7Z4H4 148 aa7.43□□□□□ -1.22
TRIOBP-211ENST00000492485 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
TRIOBP-211ENST00000492485 A0A0D9SG42 100 aa7.41□□□□□ -1.22
TRIOBP-211ENST00000492485 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa7.4□□□□□ -1.22
TRIOBP-211ENST00000492485 Q75L30 129 aa7.37□□□□□ -1.23
TRIOBP-211ENST00000492485 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa7.37□□□□□ -1.23
TRIOBP-211ENST00000492485 H3BS24 57 aa7.34□□□□□ -1.23
TRIOBP-211ENST00000492485 SPINT4Q6UDR6 99 aa7.34□□□□□ -1.23
TRIOBP-211ENST00000492485 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa7.32□□□□□ -1.24
TRIOBP-211ENST00000492485 KRTAP10-2P60368 255 aa7.31□□□□□ -1.24
TRIOBP-211ENST00000492485 CSAG1Q6PB30 78 aa7.31□□□□□ -1.24
TRIOBP-211ENST00000492485 SPRR1BP22528 89 aa7.27□□□□□ -1.25
TRIOBP-211ENST00000492485 LINC00304Q8N9R0 145 aa7.25□□□□□ -1.25
TRIOBP-211ENST00000492485 LINC01554Q52M75 96 aa7.25□□□□□ -1.25
TRIOBP-211ENST00000492485 LCE6AA0A183 80 aa7.22□□□□□ -1.25
TRIOBP-211ENST00000492485 SPATA8Q6RVD6 105 aa7.18□□□□□ -1.26
TRIOBP-211ENST00000492485 KRTAP10-1P60331 282 aa7.18□□□□□ -1.26
TRIOBP-211ENST00000492485 PLAC8Q9NZF1 115 aa7.18□□□□□ -1.26
TRIOBP-211ENST00000492485 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
TRIOBP-211ENST00000492485 Q6ZR54 194 aa7.15□□□□□ -1.26
TRIOBP-211ENST00000492485 A6NN06 94 aa7.14□□□□□ -1.27
TRIOBP-211ENST00000492485 A0A1B0GU33 70 aa7.13□□□□□ -1.27
TRIOBP-211ENST00000492485 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
TRIOBP-211ENST00000492485 DMAC1Q96GE9 116 aa7.08□□□□□ -1.28
TRIOBP-211ENST00000492485 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa7.07□□□□□ -1.28
TRIOBP-211ENST00000492485 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa7.05□□□□□ -1.28
TRIOBP-211ENST00000492485 LINC00483Q53H64 154 aa7.05□□□□□ -1.28
TRIOBP-211ENST00000492485 DNAH10Q8IVF4 4471 aa6.84□□□□□ -1.32
TRIOBP-211ENST00000492485 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.83□□□□□ -1.32
TRIOBP-211ENST00000492485 Q6ZSA8 131 aa6.8□□□□□ -1.32
TRIOBP-211ENST00000492485 C10orf95Q9H7T3 257 aa6.79□□□□□ -1.32
TRIOBP-211ENST00000492485 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.78□□□□□ -1.32
TRIOBP-211ENST00000492485 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
TRIOBP-211ENST00000492485 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.76□□□□□ -1.33
TRIOBP-211ENST00000492485 H0YAA0 97 aa6.73□□□□□ -1.33
TRIOBP-211ENST00000492485 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.73□□□□□ -1.33
TRIOBP-211ENST00000492485 S4R3F8 94 aa6.73□□□□□ -1.33
TRIOBP-211ENST00000492485 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.72□□□□□ -1.33
TRIOBP-211ENST00000492485 ROMO1P60602 79 aa6.7□□□□□ -1.34
TRIOBP-211ENST00000492485 A8MUU9 505 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIOBP-211ENST00000492485 NDUFAF8A1L188 74 aa6.68□□□□□ -1.34
TRIOBP-211ENST00000492485 LYSTQ99698 3801 aa6.67□□□□□ -1.34
TRIOBP-211ENST00000492485 Q5VSD8 79 aa6.66□□□□□ -1.34
TRIOBP-211ENST00000492485 J3QL48 77 aa6.65□□□□□ -1.34
TRIOBP-211ENST00000492485 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.65□□□□□ -1.34
TRIOBP-211ENST00000492485 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.65□□□□□ -1.34
TRIOBP-211ENST00000492485 ANK2Q01484 3957 aa6.65□□□□□ -1.35
TRIOBP-211ENST00000492485 LUZP6Q538Z0 58 aa6.64□□□□□ -1.35
TRIOBP-211ENST00000492485 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa6.64□□□□□ -1.35
TRIOBP-211ENST00000492485 R4GN34 69 aa6.64□□□□□ -1.35
TRIOBP-211ENST00000492485 M0QZ58 72 aa6.62□□□□□ -1.35
TRIOBP-211ENST00000492485 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
TRIOBP-211ENST00000492485 P0C880 135 aa6.54□□□□□ -1.36
TRIOBP-211ENST00000492485 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
TRIOBP-211ENST00000492485 DNAH11Q96DT5 4516 aa6.52□□□□□ -1.37
TRIOBP-211ENST00000492485 DNHD1Q96M86 4753 aa6.5□□□□□ -1.37
TRIOBP-211ENST00000492485 DNAH8Q96JB1 4490 aa6.48□□□□□ -1.37
TRIOBP-211ENST00000492485 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa6.45□□□□□ -1.38
TRIOBP-211ENST00000492485 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.45□□□□□ -1.38
TRIOBP-211ENST00000492485 MYCBP2O75592 4640 aa6.45□□□□□ -1.38
TRIOBP-211ENST00000492485 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.45□□□□□ -1.38
TRIOBP-211ENST00000492485 DNAH1Q9P2D7 4330 aa6.41□□□□□ -1.38
TRIOBP-211ENST00000492485 FAT1Q14517 4588 aa6.4□□□□□ -1.39
TRIOBP-211ENST00000492485 A0A0A0MQY5 61 aa6.39□□□□□ -1.39
TRIOBP-211ENST00000492485 M0R2T5 61 aa6.38□□□□□ -1.39
TRIOBP-211ENST00000492485 DNAH9Q9NYC9 4486 aa6.38□□□□□ -1.39
TRIOBP-211ENST00000492485 CMYA5Q8N3K9 4069 aa6.38□□□□□ -1.39
TRIOBP-211ENST00000492485 DNAH3Q8TD57 4116 aa6.37□□□□□ -1.39
TRIOBP-211ENST00000492485 KMT2AQ03164 3969 aa6.36□□□□□ -1.39
TRIOBP-211ENST00000492485 FRAS1Q86XX4 4008 aa6.36□□□□□ -1.39
TRIOBP-211ENST00000492485 KRTAP10-8P60410 259 aa6.35□□□□□ -1.39
TRIOBP-211ENST00000492485 XP32Q5T750 250 aa6.35□□□□□ -1.39
TRIOBP-211ENST00000492485 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.33□□□□□ -1.4
TRIOBP-211ENST00000492485 STARD9Q9P2P6 4700 aa6.33□□□□□ -1.4
TRIOBP-211ENST00000492485 LRP1BQ9NZR2 4599 aa6.31□□□□□ -1.4
TRIOBP-211ENST00000492485 TPRXLQ17RH7 258 aa6.3□□□□□ -1.4
TRIOBP-211ENST00000492485 KRTAP12-2P59991 146 aa6.29□□□□□ -1.4
TRIOBP-211ENST00000492485 A0A1B0GVY2 172 aa6.28□□□□□ -1.4
TRIOBP-211ENST00000492485 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
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