RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477970.1

PTPRF-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRF, Length 3,321 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-212ENST00000477970 TRAV22A0A0B4J277 110 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRF-212ENST00000477970 A0A1B0GVX0 72 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRF-212ENST00000477970 C8orf17Q9NRJ1 99 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRF-212ENST00000477970 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRF-212ENST00000477970 H0Y9P7 68 aa7.21□□□□□ -1.25
PTPRF-212ENST00000477970 ANAPC11Q9NYG5 84 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRF-212ENST00000477970 FAM229BQ4G0N7 80 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRF-212ENST00000477970 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRF-212ENST00000477970 V9GYY9 64 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRF-212ENST00000477970 KRTAP10-1P60331 282 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRF-212ENST00000477970 CDK2AP2O75956 126 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRF-212ENST00000477970 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRF-212ENST00000477970 LINC00208Q96KT6 92 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRF-212ENST00000477970 BRK1Q8WUW1 75 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRF-212ENST00000477970 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PTPRF-212ENST00000477970 PKHD1P08F94 4074 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRF-212ENST00000477970 H3BS24 57 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRF-212ENST00000477970 C1orf64Q8NEQ6 169 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRF-212ENST00000477970 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRF-212ENST00000477970 PRO0628Q9UI54 55 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRF-212ENST00000477970 C8orf87E5RJ46 101 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRF-212ENST00000477970 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRF-212ENST00000477970 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRF-212ENST00000477970 A0A087X002 238 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRF-212ENST00000477970 C1orf195Q5TG92 126 aa7.09□□□□□ -1.28
PTPRF-212ENST00000477970 HERC2O95714 4834 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRF-212ENST00000477970 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRF-212ENST00000477970 MPLKIPQ8TAP9 179 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRF-212ENST00000477970 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRF-212ENST00000477970 LRP1BQ9NZR2 4599 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRF-212ENST00000477970 Q1T7F1 81 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRF-212ENST00000477970 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRF-212ENST00000477970 LIMD2Q9BT23 127 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRF-212ENST00000477970 APOBP04114 4563 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PTPRF-212ENST00000477970 NDUFS5O43920 106 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRF-212ENST00000477970 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRF-212ENST00000477970 SPINK6Q6UWN8 80 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRF-212ENST00000477970 RYR1P21817 5038 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRF-212ENST00000477970 HSPG2P98160 4391 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRF-212ENST00000477970 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
PTPRF-212ENST00000477970 RPS29P62273 56 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
PTPRF-212ENST00000477970 LINC00313P59037 77 aa7□□□□□ -1.29
PTPRF-212ENST00000477970 PRR4Q16378 134 aa7□□□□□ -1.29
PTPRF-212ENST00000477970 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRF-212ENST00000477970 SPINK1P00995 79 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRF-212ENST00000477970 Q8N1X5 172 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRF-212ENST00000477970 KIAA1109Q2LD37 5005 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRF-212ENST00000477970 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRF-212ENST00000477970 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRF-212ENST00000477970 Q5W150 140 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRF-212ENST00000477970 FAM229AH3BQW9 127 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRF-212ENST00000477970 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRF-212ENST00000477970 PCOTHQ58A44 107 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRF-212ENST00000477970 COA5Q86WW8 74 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRF-212ENST00000477970 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRF-212ENST00000477970 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRF-212ENST00000477970 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRF-212ENST00000477970 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRF-212ENST00000477970 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRF-212ENST00000477970 IGKV2-30P06310 120 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRF-212ENST00000477970 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRF-212ENST00000477970 HRES1P13985 223 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRF-212ENST00000477970 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRF-212ENST00000477970 PMAIP1Q13794 54 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRF-212ENST00000477970 Q5VSD8 79 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRF-212ENST00000477970 A0A0A0MQY5 61 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRF-212ENST00000477970 DMAC1Q96GE9 116 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRF-212ENST00000477970 ACYP2P14621 99 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRF-212ENST00000477970 Q5VV11 94 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRF-212ENST00000477970 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRF-212ENST00000477970 PSPHP1O15172 72 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRF-212ENST00000477970 A8MUN3 132 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRF-212ENST00000477970 Q75L30 129 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRF-212ENST00000477970 ABCA13Q86UQ4 5058 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRF-212ENST00000477970 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
PTPRF-212ENST00000477970 FAT1Q14517 4588 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRF-212ENST00000477970 PRR15LQ9BU68 103 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRF-212ENST00000477970 PCLOQ9Y6V0 5065 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRF-212ENST00000477970 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRF-212ENST00000477970 RETNLBQ9BQ08 111 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRF-212ENST00000477970 A8MUU9 505 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRF-212ENST00000477970 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRF-212ENST00000477970 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRF-212ENST00000477970 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRF-212ENST00000477970 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRF-212ENST00000477970 A8MU10 97 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRF-212ENST00000477970 FAT3Q8TDW7 4589 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRF-212ENST00000477970 KRTAP10-8P60410 259 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRF-212ENST00000477970 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRF-212ENST00000477970 MYCBP2O75592 4640 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRF-212ENST00000477970 A6NED7 52 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRF-212ENST00000477970 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRF-212ENST00000477970 TNXBP22105 4242 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRF-212ENST00000477970 LCA10Q71F78 164 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRF-212ENST00000477970 C9orf92A6NGG3 77 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRF-212ENST00000477970 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRF-212ENST00000477970 J3QL48 77 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-212ENST00000477970 MT1HL1P0DM35 61 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-212ENST00000477970 SPINK7P58062 85 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRF-212ENST00000477970 A0A1B0GU69 56 aa6.53□□□□□ -1.36
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